More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1709 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_1709  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 224 aa  449  1e-125  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.400859  normal  0.0301663 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2329  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 221 aa  81.3  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3994  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 225 aa  75.9  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0496  TetR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 202 aa  75.1  0.0000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  37.23 
 
 		 218 aa  72  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3880  transcriptional regulator, TetR family  36.49 
 
 		 217 aa  71.2  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.133053 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 212 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  29.52 
 
 		 226 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2432  transcriptional regulator, TetR family  39.17 
 
 		 220 aa  70.1  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0652024 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4680  transcriptional regulator, TetR family  32.13 
 
 		 236 aa  69.3  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2986  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 216 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2972  TetR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 216 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419953  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3130  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1391  transcriptional regulator, TetR family  30.88 
 
 		 208 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2027  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 208 aa  68.2  0.00000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 214 aa  67.8  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0570  TetR family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 209 aa  67.8  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 205 aa  67  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 207 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1515  TetR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0123  transcriptional regulator, TetR family  29.14 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 226 aa  66.6  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4103  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4208  TetR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 213 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.826614 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 226 aa  66.2  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8304  transcriptional regulator, TetR family  31.29 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.505381  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2256  TetR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0681818  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1119  TetR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 213 aa  65.5  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 208 aa  65.1  0.0000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0518509 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5073  transcriptional regulator TetR family  40.91 
 
 		 227 aa  65.1  0.0000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.479761  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 203 aa  64.7  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3407  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 218 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0155576  normal  0.84746 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 210 aa  64.7  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 195 aa  64.3  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1231  TetR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 289 aa  63.5  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00074883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1511  TetR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 225 aa  63.2  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6801  transcriptional regulator, TetR family  39.1 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142519  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0056  transcriptional regulator, TetR family  32.46 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4265  TetR/AcrR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 228 aa  62  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  29.23 
 
 		 215 aa  61.6  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  42.35 
 
 		 222 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16280  putative transcriptional regulator  34.38 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.450776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8103  transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 		 223 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3277  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5306  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.190126 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  24.5 
 
 		 231 aa  60.5  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3598  TetR family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.822043 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2650  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1279  regulatory protein, TetR  32.77 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.211303  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1885  transcriptional regulator, TetR family  40.54 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.393011  normal  0.0927704 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5954  transcriptional regulator TetR family  34.58 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1400  putative transcriptional regulator  33.59 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0743  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0929  TetR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.99421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  34.88 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  30.27 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2443  transcriptional regulator, TetR family  31.72 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0506357 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6397  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.467706 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  30.27 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0232  TetR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 230 aa  59.3  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 244 aa  59.3  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4201  hypothetical protein  24.73 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0425  transcriptional regulator, TetR family  33.77 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.752712  normal  0.122961 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  49.15 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1276  transcriptional regulator, TetR family  34.11 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  35.78 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
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NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1709  transcriptional regulator, TetR family  35.77 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.922562  normal  1 
 
 
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NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010512  Bcenmc03_6667  TetR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 217 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.33995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2444  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 217 aa  58.2  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007778  RPB_1979  TetR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 216 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28862  normal  1 
 
 
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NC_013947  Snas_5925  transcriptional regulator, TetR family  47.62 
 
 		 211 aa  58.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008062  Bcen_5823  TetR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008544  Bcen2424_6188  TetR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.301672  normal  1 
 
 
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NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 226 aa  58.2  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
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NC_011004  Rpal_4417  transcriptional regulator, TetR family  30.57 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_004578  PSPTO_3576  TetR-like virulence regulator  35.71 
 
 		 207 aa  57  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011988  Avi_5949  transcriptional regulator TetR family  28.64 
 
 		 250 aa  57  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009427  Saro_3644  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.106311  n/a   
 
 
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NC_007794  Saro_0706  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 215 aa  57  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009921  Franean1_3682  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 540 aa  57  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0191871  normal  1 
 
 
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NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  30.1 
 
 		 216 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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