More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8103 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8103  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 223 aa  449  1e-125  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6001  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 224 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.903994  normal  0.20153 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1981  TetR family transcriptional regulator  41.71 
 
 		 227 aa  107  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0412771  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7149  transcriptional regulator, TetR family  35.19 
 
 		 224 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 244 aa  93.6  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6537  transcriptional regulator, TetR family  37.39 
 
 		 230 aa  93.2  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.563628  normal  0.0265458 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3466  TetR family transcriptional regulator  40.12 
 
 		 245 aa  92.4  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 211 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  33.96 
 
 		 226 aa  90.5  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3880  transcriptional regulator, TetR family  36.56 
 
 		 217 aa  88.6  7e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.133053 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  30.09 
 
 		 212 aa  87  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 212 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  38.56 
 
 		 218 aa  86.7  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  32.31 
 
 		 217 aa  85.5  6e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 206 aa  84.7  9e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 211 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  33.01 
 
 		 209 aa  84.7  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0929  TetR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 205 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.99421  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1276  transcriptional regulator, TetR family  33.17 
 
 		 214 aa  84  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5077  transcriptional regulator, TetR family  33.18 
 
 		 212 aa  84  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1403  TetR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 241 aa  83.2  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 206 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 208 aa  82  0.000000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0518509 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 247 aa  81.3  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 247 aa  81.3  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 206 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  34.84 
 
 		 222 aa  80.9  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 226 aa  79.3  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  32.08 
 
 		 220 aa  79  0.00000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4103  TetR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 209 aa  78.6  0.00000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 203 aa  78.6  0.00000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2416  TetR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 192 aa  78.2  0.00000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.363583 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3482  TetR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 248 aa  77.8  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0660414  normal  0.032442 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 234 aa  77.8  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 206 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 212 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1391  transcriptional regulator, TetR family  33.78 
 
 		 208 aa  77  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3130  TetR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 216 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2986  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 216 aa  77  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1119  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 213 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1360  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 270 aa  77.4  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100226  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 208 aa  77  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 		 209 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
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NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  31.75 
 
 		 220 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
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NC_013947  Snas_1938  transcriptional regulator, TetR family  34.63 
 
 		 226 aa  76.3  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.165177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0299  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 202 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 		 220 aa  75.5  0.0000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003358  transcriptional regulator  26.6 
 
 		 251 aa  75.5  0.0000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.433364  n/a   
 
 
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NC_009675  Anae109_0570  TetR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 209 aa  75.1  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  29.81 
 
 		 230 aa  74.3  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 216 aa  74.7  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.6413 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  29.72 
 
 		 226 aa  74.3  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 		 221 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
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NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 207 aa  74.7  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 210 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007954  Sden_1279  regulatory protein, TetR  29.3 
 
 		 206 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.211303  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2972  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 216 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419953  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5925  transcriptional regulator, TetR family  32.44 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5949  transcriptional regulator TetR family  28.02 
 
 		 250 aa  73.2  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2443  transcriptional regulator, TetR family  30.29 
 
 		 237 aa  73.2  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0506357 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3994  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 225 aa  73.6  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5045  transcriptional regulator, TetR family  34.84 
 
 		 208 aa  72.8  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.301448 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 205 aa  72  0.000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4208  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 213 aa  71.6  0.000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.826614 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1515  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 213 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0106  transcriptional regulator  32.97 
 
 		 207 aa  70.9  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2309  transcriptional regulator, TetR family  35.1 
 
 		 204 aa  70.9  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.601552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2624  TetR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 214 aa  70.1  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.373378  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3340  TetR family transcriptional regulator  41.6 
 
 		 224 aa  69.7  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.841293 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2507  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.881075  normal  0.842438 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2256  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0681818  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6137  TetR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150449  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 257 aa  67.8  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 216 aa  67.8  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1709  transcriptional regulator, TetR family  36.59 
 
 		 203 aa  67.8  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.922562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4201  hypothetical protein  23.92 
 
 		 201 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3277  TetR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 188 aa  67  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
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NC_009667  Oant_1774  TetR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 231 aa  67  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277997  n/a   
 
 
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NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  30.17 
 
 		 205 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
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NC_009428  Rsph17025_3126  TetR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.333802  hitchhiker  0.00150199 
 
 
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NC_010581  Bind_2027  TetR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal  1 
 
 
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NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  27.57 
 
 		 207 aa  65.9  0.0000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
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NC_010681  Bphyt_1885  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.393011  normal  0.0927704 
 
 
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NC_007952  Bxe_B2650  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 195 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  26.45 
 
 		 226 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003296  RS00902  transcription regulator protein  30.72 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806346  normal  0.603909 
 
 
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NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  30.37 
 
 		 215 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
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NC_007778  RPB_1979  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 216 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28862  normal  1 
 
 
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NC_010623  Bphy_5419  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.752491  normal  0.799332 
 
 
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NC_007925  RPC_3598  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.822043 
 
 
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NC_007953  Bxe_C1222  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011988  Avi_5954  transcriptional regulator TetR family  30.07 
 
 		 219 aa  64.7  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  27.04 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007958  RPD_3407  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0155576  normal  0.84746 
 
 
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NC_007005  Psyr_3324  regulatory protein, TetR  34.19 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0882884 
 
 
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NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  31.46 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007974  Rmet_4265  TetR/AcrR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752062  normal  1 
 
 
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