More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0123 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0123  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 224 aa  459  9.999999999999999e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3994  TetR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1400  putative transcriptional regulator  33.89 
 
 		 213 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16280  putative transcriptional regulator  32.24 
 
 		 213 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.450776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2443  transcriptional regulator, TetR family  28.85 
 
 		 237 aa  91.3  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0506357 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4265  TetR/AcrR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 228 aa  87.4  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0743  TetR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 216 aa  85.9  5e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0106  transcriptional regulator  28.24 
 
 		 207 aa  82.4  0.000000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  32.88 
 
 		 218 aa  79.7  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2027  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 208 aa  78.2  0.00000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0050  TetR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 210 aa  74.3  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2049  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 198 aa  73.2  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 234 aa  73.2  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0570  TetR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 209 aa  73.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 208 aa  72.4  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1551  transcription regulator protein  24.14 
 
 		 205 aa  71.6  0.000000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000200418  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1138  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 228 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5954  transcriptional regulator TetR family  26.53 
 
 		 219 aa  70.9  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  24.64 
 
 		 208 aa  70.5  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0518509 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2925  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 259 aa  69.7  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4201  hypothetical protein  28.22 
 
 		 201 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1456  transcriptional regulator, TetR family  29.44 
 
 		 211 aa  67.8  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 210 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 211 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 216 aa  67  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.6413 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0120  transcription regulator protein  27.05 
 
 		 209 aa  67.4  0.0000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0496  TetR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 202 aa  67.4  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003358  transcriptional regulator  23.62 
 
 		 251 aa  67.4  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.433364  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1709  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.400859  normal  0.0301663 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 214 aa  66.2  0.0000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4695  TetR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2256  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 207 aa  64.7  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0681818  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 257 aa  64.7  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3880  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 217 aa  64.7  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.133053 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1447  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.268108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  23.47 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1589  TetR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00902  transcription regulator protein  27.37 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806346  normal  0.603909 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1443  transcriptional regulator, TetR family  27.67 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79888  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  25.77 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3482  TetR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 248 aa  62  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0660414  normal  0.032442 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  25.63 
 
 		 224 aa  61.6  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5073  transcriptional regulator TetR family  33.33 
 
 		 227 aa  61.2  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.479761  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1544  TetR family transcriptional regulator  23.39 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0747  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4487  transcriptional regulator, TetR family  24.02 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4516  transcriptional regulator, TetR family  24.02 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  23.56 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5077  transcriptional regulator, TetR family  26.7 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4417  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3598  TetR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.822043 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  24.64 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4446  TetR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5949  transcriptional regulator TetR family  25.41 
 
 		 250 aa  59.3  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2309  transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.601552  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0417  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.582738  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  24 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1231  TetR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 289 aa  58.9  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00074883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  22.35 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1885  transcriptional regulator, TetR family  29.05 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.393011  normal  0.0927704 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  29.67 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1979  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  24 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1313  transcriptional regulator TetR family  28.24 
 
 		 213 aa  58.2  0.00000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6001  transcriptional regulator, TetR family  25.48 
 
 		 224 aa  58.2  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.903994  normal  0.20153 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  40.96 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1187  TetR family transcriptional regulator  22.94 
 
 		 221 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.49367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1121  TetR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0496337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  23.88 
 
 		 226 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  26.29 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1993  TetR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209055  normal  0.134866 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1222  TetR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2537  transcriptional regulator, TetR family  25.21 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1059  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  23.15 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0391  TetR family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.914065  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2972  TetR family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 216 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419953  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0566  transcription regulator protein  27.73 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.000000411686  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0552  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1558  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  30.53 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1358  TetR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1641  transcriptional regulator, TetR family protein  26.96 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.216203  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1391  transcriptional regulator, TetR family  24.82 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2986  TetR family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3915  transcriptional regulator, TetR family  26.52 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8304  transcriptional regulator, TetR family  26.24 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.505381  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3130  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2650  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6292  TetR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1290  AcrR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3623  regulatory protein TetR  26.52 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.755125  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>