More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8390 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 222 aa  459  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  87.8 
 
 		 206 aa  371  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  75.86 
 
 		 206 aa  320  9.000000000000001e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  67.8 
 
 		 206 aa  279  2e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  64.32 
 
 		 216 aa  259  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  62.89 
 
 		 212 aa  246  2e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  62.24 
 
 		 195 aa  244  9.999999999999999e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  61.86 
 
 		 212 aa  242  3e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  59.39 
 
 		 206 aa  241  7e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3827  transcriptional regulator, TetR family  66.34 
 
 		 212 aa  237  9e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.31638 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  59.49 
 
 		 221 aa  236  2e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  56.65 
 
 		 216 aa  235  5.0000000000000005e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  57.42 
 
 		 238 aa  233  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0830  transcriptional regulator, TetR family  61.54 
 
 		 214 aa  231  7.000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  55.2 
 
 		 221 aa  229  3e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  54.85 
 
 		 215 aa  223  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  58.25 
 
 		 228 aa  221  7e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  52.76 
 
 		 219 aa  208  5e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  46.48 
 
 		 224 aa  196  3e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  46.48 
 
 		 224 aa  196  3e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  46.48 
 
 		 224 aa  195  6e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  48.04 
 
 		 224 aa  194  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  47.55 
 
 		 224 aa  194  1e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  48.97 
 
 		 223 aa  192  4e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 228 aa  187  8e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  46.91 
 
 		 237 aa  186  2e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15250  transcriptional regulator, tetR family  39.42 
 
 		 218 aa  129  4.0000000000000003e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.110377  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2475  transcriptional regulator, TetR family  38.65 
 
 		 222 aa  124  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.260568  hitchhiker  0.0024636 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27670  transcriptional regulator  34.55 
 
 		 254 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  32.11 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  32.08 
 
 		 225 aa  100  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 205 aa  96.3  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0710  transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 		 248 aa  93.2  3e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 227 aa  92.4  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 		 209 aa  90.9  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  30.1 
 
 		 206 aa  90.1  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  27.88 
 
 		 218 aa  90.5  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4456  regulatory protein TetR  30.73 
 
 		 202 aa  89.7  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0166479  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 216 aa  89.7  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  30.1 
 
 		 226 aa  89.7  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  32.14 
 
 		 205 aa  89.7  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  25.87 
 
 		 271 aa  89  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 224 aa  88.6  6e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  26.96 
 
 		 211 aa  88.6  8e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  27.92 
 
 		 220 aa  86.7  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0236  TetR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 218 aa  87  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0269868  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 220 aa  87  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0246  TetR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 218 aa  87  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0226  TetR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 218 aa  87  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.131166 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 218 aa  87  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  26.5 
 
 		 231 aa  86.3  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0414  TetR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 215 aa  86.7  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.462572  normal  0.0664832 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1944  transcriptional regulator, TetR family  27.41 
 
 		 205 aa  86.3  4e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00538978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0257  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 209 aa  86.3  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102981 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  30.1 
 
 		 215 aa  85.9  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 		 203 aa  85.5  6e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0305  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 215 aa  85.1  8e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.437849  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38900  transcriptional regulator, TetR family  28.28 
 
 		 226 aa  85.1  8e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.749862  normal  0.429215 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  44.34 
 
 		 216 aa  84.3  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 225 aa  84.3  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10241  TetR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 204 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000764085  normal  0.925652 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 211 aa  83.6  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  28.91 
 
 		 215 aa  84  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4626  transcriptional regulator, TetR family  30.63 
 
 		 211 aa  83.6  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  hitchhiker  0.00755279 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 218 aa  83.6  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 212 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 212 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 212 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 197 aa  82  0.000000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  28.34 
 
 		 200 aa  81.3  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0424  transcriptional regulator, TetR family  28.27 
 
 		 201 aa  80.9  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.315635  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  25.89 
 
 		 207 aa  80.9  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0984  transcriptional regulator, TetR family  26.2 
 
 		 245 aa  78.6  0.00000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.50937  hitchhiker  0.00233885 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 221 aa  79  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 217 aa  79  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2551  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 206 aa  79  0.00000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48532  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 204 aa  78.6  0.00000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6979  transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 		 220 aa  78.2  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.941023  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1286  transcriptional regulator, TetR family  25.39 
 
 		 199 aa  77.8  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000123202 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06690  transcriptional regulator  28.3 
 
 		 256 aa  77.4  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 197 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1434  transcriptional regulator, TetR family  30.19 
 
 		 225 aa  75.5  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.185065  normal  0.789444 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  30.2 
 
 		 220 aa  75.5  0.0000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0330  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 233 aa  74.7  0.0000000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 330 aa  74.3  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4029  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 217 aa  74.3  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.697639  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12528  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 215 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0275989 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3962  putative transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 194 aa  73.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.545183  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1958  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 251 aa  73.2  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455038  normal  0.501183 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 212 aa  71.6  0.000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2242  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 208 aa  71.2  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0149249  normal  0.352289 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3632  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 207 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3705  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 207 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4092  TetR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 206 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3637  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 207 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.262942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8610  putative transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 317 aa  69.7  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3020  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000370253  normal  0.25528 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1683  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 197 aa  68.6  0.00000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.947535  normal  0.202583 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  38.74 
 
 		 197 aa  68.6  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2869  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 285 aa  68.6  0.00000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>