More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1709 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1709  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 203 aa  413  1e-114  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.922562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1885  transcriptional regulator, TetR family  67.51 
 
 		 204 aa  261  6e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.393011  normal  0.0927704 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5419  TetR family transcriptional regulator  63.96 
 
 		 211 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.752491  normal  0.799332 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2650  TetR family transcriptional regulator  66.15 
 
 		 195 aa  257  9e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1222  TetR family transcriptional regulator  64.14 
 
 		 204 aa  254  7e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6667  TetR family transcriptional regulator  63.13 
 
 		 217 aa  253  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.33995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7734  TetR family transcriptional regulator  61.69 
 
 		 217 aa  253  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5823  TetR family transcriptional regulator  62.63 
 
 		 217 aa  252  3e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008544  Bcen2424_6188  TetR family transcriptional regulator  62.63 
 
 		 217 aa  252  3e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.301672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  58.5 
 
 		 202 aa  251  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  56.85 
 
 		 207 aa  230  1e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6158  TetR family transcriptional regulator  60.3 
 
 		 212 aa  229  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.488727  normal  0.104212 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5760  TetR family transcriptional regulator  63.78 
 
 		 208 aa  222  3e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.327742  normal  0.559912 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1924  TetR family transcriptional regulator  54.31 
 
 		 210 aa  221  7e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.343626  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3549  transcriptional regulator AefR  56.35 
 
 		 200 aa  219  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.695719  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6005  TetR family transcriptional regulator  63.27 
 
 		 208 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.695496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3324  regulatory protein, TetR  54.77 
 
 		 204 aa  214  8e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0882884 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1358  TetR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 202 aa  157  1e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0299  TetR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 202 aa  155  3e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0297  TetR family transcriptional regulator  39.9 
 
 		 203 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0450  TetR family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 201 aa  143  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3865  transcriptional regulator, TetR family protein  37.31 
 
 		 205 aa  143  2e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008322  Shewmr7_3727  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 203 aa  141  8e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000227076 
 
 
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NC_008321  Shewmr4_0292  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 203 aa  140  9e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000414466 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0292  TetR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 203 aa  139  3e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000945067 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02663  transcriptional regulator  35.9 
 
 		 204 aa  132  5e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0806616  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0792  TetR family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 212 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009784  VIBHAR_06672  hypothetical protein  31.79 
 
 		 198 aa  117  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_008228  Patl_0736  TetR family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 198 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009457  VC0395_A1346  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 209 aa  102  4e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0035  putative transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 202 aa  97.8  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 211 aa  97.4  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4487  transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 207 aa  95.5  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4516  transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 207 aa  95.5  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2329  TetR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 221 aa  84  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8304  transcriptional regulator, TetR family  32.31 
 
 		 223 aa  79.3  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.505381  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0542  transcriptional regulator, TetR family  31.31 
 
 		 210 aa  77.8  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.669667 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  30.95 
 
 		 220 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  32.02 
 
 		 212 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  33.17 
 
 		 222 aa  76.3  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 		 220 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0496  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 202 aa  75.5  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1059  TetR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
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NC_011884  Cyan7425_4680  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 236 aa  72.4  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009719  Plav_2293  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 204 aa  72.4  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009092  Shew_1544  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 219 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  36.08 
 
 		 226 aa  71.6  0.000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 214 aa  71.2  0.000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  30.24 
 
 		 205 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1119  TetR family transcriptional regulator  31 
 
 		 213 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2292  TetR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 208 aa  70.1  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4208  TetR family transcriptional regulator  31 
 
 		 213 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.826614 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  31.74 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1019  TetR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18820  transcriptional regulator  35.2 
 
 		 225 aa  69.7  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.348199  normal  0.343375 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2948  TetR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 191 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2992  TetR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 191 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.385096  normal  0.373192 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1515  TetR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  31.47 
 
 		 209 aa  68.2  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 210 aa  68.2  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3576  TetR-like virulence regulator  32.14 
 
 		 207 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0991  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 190 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0995  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 190 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  27.94 
 
 		 220 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1231  TetR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 289 aa  67.4  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00074883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1237  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 190 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8103  transcriptional regulator, TetR family  36.59 
 
 		 223 aa  67.8  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1159  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 190 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1460  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 210 aa  67.8  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1008  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 190 aa  67  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1080  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 190 aa  67  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  31.06 
 
 		 200 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4194  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.6413 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1112  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  31.06 
 
 		 200 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2963  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 189 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.412295 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4103  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 257 aa  66.2  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3317  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.305506  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1553  regulatory protein, TetR  29.7 
 
 		 234 aa  66.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0034  TetR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 189 aa  66.2  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.345685  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0034  TetR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 189 aa  66.2  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009050  Rsph17029_4044  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014210  Ndas_1276  transcriptional regulator, TetR family  31.5 
 
 		 214 aa  65.5  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933053  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1177  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 190 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_0995  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 190 aa  65.1  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.713352  n/a   
 
 
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NC_009674  Bcer98_0833  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 190 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011729  PCC7424_3129  transcriptional regulator, TetR family  27.41 
 
 		 191 aa  64.7  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  29.95 
 
 		 217 aa  64.7  0.0000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011365  Gdia_1993  transcriptional regulator, TetR family  32.12 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 184 aa  63.9  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
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NC_009670  Oant_4809  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 213 aa  63.5  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009832  Spro_1824  TetR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 224 aa  62.8  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.87921  normal  0.175095 
 
 
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NC_009428  Rsph17025_1459  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.540117  normal  1 
 
 
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NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
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NC_012852  Rleg_5999  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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