More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2329 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



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Organism name
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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2329  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 221 aa  432  1e-120  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  45.35 
 
 		 211 aa  123  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4487  transcriptional regulator, TetR family  36.32 
 
 		 207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4516  transcriptional regulator, TetR family  36.32 
 
 		 207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8304  transcriptional regulator, TetR family  36.42 
 
 		 223 aa  103  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.505381  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0542  transcriptional regulator, TetR family  42.44 
 
 		 210 aa  100  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.669667 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 207 aa  99.4  4e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4680  transcriptional regulator, TetR family  37.34 
 
 		 236 aa  94.7  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2256  TetR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 207 aa  92.8  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0681818  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 234 aa  92.8  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  41.46 
 
 		 218 aa  91.3  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0155  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 222 aa  90.1  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4046  TetR family transcriptional regulator  38.59 
 
 		 222 aa  90.5  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933953  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  31.53 
 
 		 220 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1358  TetR family transcriptional regulator  36.2 
 
 		 202 aa  90.1  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1059  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 211 aa  88.6  6e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2027  TetR family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 208 aa  88.2  9e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  37.42 
 
 		 200 aa  87.8  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5077  transcriptional regulator, TetR family  38.41 
 
 		 212 aa  87.4  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  37.42 
 
 		 200 aa  87.8  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 202 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  31.47 
 
 		 220 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1709  transcriptional regulator, TetR family  35.26 
 
 		 203 aa  86.3  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.922562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  31.47 
 
 		 220 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3880  transcriptional regulator, TetR family  38.07 
 
 		 217 aa  85.9  5e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.133053 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1709  TetR family transcriptional regulator  41.04 
 
 		 224 aa  84  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.400859  normal  0.0301663 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  32.86 
 
 		 215 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2432  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 220 aa  84  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0652024 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 213 aa  83.6  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 210 aa  84  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 214 aa  83.2  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1276  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 214 aa  82.8  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5823  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 217 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6188  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 217 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.301672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1231  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 289 aa  82.4  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00074883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7734  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 217 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 257 aa  82  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3727  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 203 aa  82  0.000000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000227076 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0292  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 203 aa  81.6  0.000000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000945067 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0292  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 203 aa  81.6  0.000000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000414466 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  31.66 
 
 		 221 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 205 aa  80.5  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6667  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 217 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.33995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6137  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 207 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150449  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6592  TetR family transcriptional regulator  37.43 
 
 		 225 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.186395 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1312  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 206 aa  79.7  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.278349  normal  0.387509 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3129  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 191 aa  80.1  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2507  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 207 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.881075  normal  0.842438 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1511  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 225 aa  79.3  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 208 aa  79.3  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0518509 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 212 aa  79.3  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  38.12 
 
 		 216 aa  79  0.00000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.6413 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  35.8 
 
 		 209 aa  79  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 210 aa  79  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0297  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 203 aa  78.6  0.00000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 209 aa  78.6  0.00000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3317  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 214 aa  78.6  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.305506  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0106  transcriptional regulator  32.73 
 
 		 207 aa  78.6  0.00000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4044  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 214 aa  78.6  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0450  TetR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 201 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5925  transcriptional regulator, TetR family  38.22 
 
 		 211 aa  77.8  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3994  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 225 aa  77.8  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3682  TetR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 540 aa  77.8  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0191871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  29.41 
 
 		 224 aa  77.8  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2650  TetR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 195 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1222  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 204 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  36.6 
 
 		 222 aa  77.4  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  31.15 
 
 		 226 aa  77.4  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 218 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  31.15 
 
 		 226 aa  76.3  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5073  transcriptional regulator TetR family  38.98 
 
 		 227 aa  76.3  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.479761  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  29.27 
 
 		 230 aa  76.6  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4265  TetR/AcrR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 228 aa  76.6  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 208 aa  75.9  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 210 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1400  putative transcriptional regulator  34.44 
 
 		 213 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3126  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 207 aa  75.5  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.333802  hitchhiker  0.00150199 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0299  TetR family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 202 aa  75.1  0.0000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3598  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 222 aa  75.1  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.822043 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3324  regulatory protein, TetR  34.27 
 
 		 204 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0882884 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5419  TetR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 211 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.752491  normal  0.799332 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0050  TetR family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 210 aa  74.3  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2972  TetR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 216 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419953  n/a   
 
 
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NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  31.38 
 
 		 212 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007778  RPB_1979  TetR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 216 aa  73.6  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28862  normal  1 
 
 
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NC_010505  Mrad2831_5237  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 233 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.139236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 206 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
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NC_011663  Sbal223_1391  transcriptional regulator, TetR family  32.87 
 
 		 208 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008751  Dvul_0496  TetR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 202 aa  73.6  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.250936 
 
 
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NC_009665  Shew185_2986  TetR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 216 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
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NC_010087  Bmul_6158  TetR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 212 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.488727  normal  0.104212 
 
 
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NC_008228  Patl_0736  TetR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 198 aa  72.8  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011666  Msil_1456  transcriptional regulator, TetR family  33.96 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_010505  Mrad2831_5246  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 192 aa  72.8  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
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NC_008463  PA14_16280  putative transcriptional regulator  34.62 
 
 		 213 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.450776  normal  1 
 
 
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NC_007643  Rru_A2444  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 217 aa  72.4  0.000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 203 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010681  Bphyt_1885  transcriptional regulator, TetR family  34.09 
 
 		 204 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.393011  normal  0.0927704 
 
 
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