More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_3727 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_3727  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 203 aa  419  1e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000227076 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0292  TetR family transcriptional regulator  98.03 
 
 		 203 aa  413  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000414466 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0292  TetR family transcriptional regulator  96.06 
 
 		 203 aa  404  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000945067 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0297  TetR family transcriptional regulator  83.25 
 
 		 203 aa  353  1e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1358  TetR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 202 aa  154  7e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0299  TetR family transcriptional regulator  41.87 
 
 		 202 aa  143  1e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1885  transcriptional regulator, TetR family  42.21 
 
 		 204 aa  142  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.393011  normal  0.0927704 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1709  transcriptional regulator, TetR family  39.47 
 
 		 203 aa  141  8e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.922562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1222  TetR family transcriptional regulator  42.93 
 
 		 204 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6667  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 217 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.33995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2650  TetR family transcriptional regulator  41.36 
 
 		 195 aa  137  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7734  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 217 aa  136  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5823  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 217 aa  135  4e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6188  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 217 aa  135  4e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.301672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1924  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 210 aa  135  5e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.343626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  41.15 
 
 		 207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 202 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0450  TetR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 201 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5419  TetR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 211 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.752491  normal  0.799332 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6158  TetR family transcriptional regulator  38.42 
 
 		 212 aa  124  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.488727  normal  0.104212 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3865  transcriptional regulator, TetR family protein  33.17 
 
 		 205 aa  122  3e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3324  regulatory protein, TetR  37.89 
 
 		 204 aa  118  7e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0882884 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0736  TetR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 198 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3549  transcriptional regulator AefR  38.42 
 
 		 200 aa  112  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.695719  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06672  hypothetical protein  33.16 
 
 		 198 aa  112  4.0000000000000004e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5760  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.327742  normal  0.559912 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6005  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.695496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02663  transcriptional regulator  30.77 
 
 		 204 aa  107  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0806616  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0035  putative transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 202 aa  103  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0792  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 212 aa  102  4e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4516  transcriptional regulator, TetR family  34.01 
 
 		 207 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4487  transcriptional regulator, TetR family  34.01 
 
 		 207 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1346  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 209 aa  101  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 211 aa  94.7  8e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 210 aa  90.5  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3407  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 218 aa  86.7  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0155576  normal  0.84746 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  31.82 
 
 		 220 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 220 aa  82  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0542  transcriptional regulator, TetR family  30.89 
 
 		 210 aa  81.6  0.000000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.669667 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2329  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 221 aa  81.6  0.000000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6137  TetR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 207 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150449  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  35.54 
 
 		 218 aa  80.5  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2507  TetR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 207 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.881075  normal  0.842438 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1979  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 216 aa  79  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2293  TetR family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 204 aa  79  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 213 aa  78.6  0.00000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  31.19 
 
 		 216 aa  78.2  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  36.05 
 
 		 222 aa  78.2  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6001  transcriptional regulator, TetR family  35.03 
 
 		 224 aa  78.2  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.903994  normal  0.20153 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 218 aa  76.3  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8304  transcriptional regulator, TetR family  31.34 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.505381  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 216 aa  75.9  0.0000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.6413 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2292  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 208 aa  75.1  0.0000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1511  TetR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 225 aa  74.7  0.0000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1231  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 289 aa  74.7  0.0000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00074883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 		 220 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3126  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 207 aa  72.4  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.333802  hitchhiker  0.00150199 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3880  transcriptional regulator, TetR family  34 
 
 		 217 aa  72  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.133053 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  30.1 
 
 		 217 aa  72  0.000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1276  transcriptional regulator, TetR family  38.33 
 
 		 214 aa  70.9  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933053  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7149  transcriptional regulator, TetR family  34.33 
 
 		 224 aa  71.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 		 215 aa  70.5  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4208  TetR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.826614 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1515  TetR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4103  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 209 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 234 aa  68.6  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  35.9 
 
 		 224 aa  68.6  0.00000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1544  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 219 aa  68.6  0.00000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  29.91 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 211 aa  68.2  0.00000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1119  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2256  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 207 aa  67  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0681818  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 231 aa  67.4  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0706  TetR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5077  transcriptional regulator, TetR family  29.23 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3682  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 540 aa  66.2  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0191871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  28.96 
 
 		 221 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 257 aa  65.9  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0496  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 210 aa  65.1  0.0000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5954  transcriptional regulator TetR family  32.34 
 
 		 219 aa  65.1  0.0000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1007  transcription regulator protein  39.58 
 
 		 239 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.605979  normal  0.178446 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  31.33 
 
 		 226 aa  64.3  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1138  TetR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 228 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6292  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011729  PCC7424_3129  transcriptional regulator, TetR family  37.38 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0050  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
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NC_009675  Anae109_0570  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009656  PSPA7_1400  putative transcriptional regulator  29.28 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_8103  transcriptional regulator, TetR family  57.63 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012669  Bcav_2309  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.601552  normal  1 
 
 
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NC_007925  RPC_1187  TetR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.49367  normal  1 
 
 
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NC_010338  Caul_1312  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.278349  normal  0.387509 
 
 
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