More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0450 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0450  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 201 aa  410  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0299  TetR family transcriptional regulator  61.69 
 
 		 202 aa  260  1e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1358  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 202 aa  148  4e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1709  transcriptional regulator, TetR family  39.69 
 
 		 203 aa  143  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.922562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5419  TetR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 211 aa  141  6e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.752491  normal  0.799332 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7734  TetR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 217 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3324  regulatory protein, TetR  36.5 
 
 		 204 aa  138  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0882884 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2650  TetR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 195 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010512  Bcenmc03_6667  TetR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 217 aa  138  6e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.33995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5823  TetR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 217 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6188  TetR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 217 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.301672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1222  TetR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 204 aa  134  9e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 202 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1885  transcriptional regulator, TetR family  37.25 
 
 		 204 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.393011  normal  0.0927704 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3549  transcriptional regulator AefR  35.75 
 
 		 200 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.695719  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0292  TetR family transcriptional regulator  39.59 
 
 		 203 aa  131  6e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000414466 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3727  TetR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 203 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000227076 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0292  TetR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 203 aa  129  3e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000945067 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0297  TetR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 203 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6158  TetR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 212 aa  124  9e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.488727  normal  0.104212 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1924  TetR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 210 aa  117  9e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.343626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5760  TetR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 208 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.327742  normal  0.559912 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6005  TetR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 208 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.695496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0792  TetR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 212 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02663  transcriptional regulator  33.67 
 
 		 204 aa  108  7.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0806616  n/a   
 
 
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NC_009784  VIBHAR_06672  hypothetical protein  30.57 
 
 		 198 aa  108  8.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_008345  Sfri_3865  transcriptional regulator, TetR family protein  33.33 
 
 		 205 aa  106  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0035  putative transcriptional regulator, TetR family  29.5 
 
 		 202 aa  101  9e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008228  Patl_0736  TetR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 198 aa  100  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1346  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 209 aa  99.8  3e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  43.7 
 
 		 222 aa  84.7  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4680  transcriptional regulator, TetR family  32.08 
 
 		 236 aa  76.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2329  TetR family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 221 aa  75.5  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  29.8 
 
 		 211 aa  74.7  0.0000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4313  transcriptional regulator, TetR family  34 
 
 		 238 aa  73.2  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2293  TetR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 204 aa  72.4  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0542  transcriptional regulator, TetR family  29.74 
 
 		 210 aa  71.6  0.000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.669667 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 210 aa  70.9  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2292  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 208 aa  70.5  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4487  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4516  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1276  transcriptional regulator, TetR family  36.29 
 
 		 214 aa  69.7  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933053  normal  1 
 
 
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NC_007298  Daro_3923  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 214 aa  68.9  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  33.53 
 
 		 209 aa  68.2  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1421  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 190 aa  67.4  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.216023 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 200 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 200 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 213 aa  67  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
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NC_007958  RPD_1791  regulatory protein, TetR  29.88 
 
 		 246 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00350194  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 218 aa  65.9  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  53.23 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1019  TetR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2309  transcriptional regulator, TetR family  28.99 
 
 		 204 aa  65.1  0.0000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.601552  normal  1 
 
 
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NC_007954  Sden_1279  regulatory protein, TetR  38.33 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.211303  n/a   
 
 
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NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  28.79 
 
 		 217 aa  64.7  0.0000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  52.46 
 
 		 206 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  54.24 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  55.93 
 
 		 207 aa  64.7  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1869  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  52.46 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  25.76 
 
 		 216 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  52.46 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0570  TetR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2972  TetR family transcriptional regulator  55.17 
 
 		 216 aa  63.5  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419953  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2986  TetR family transcriptional regulator  55.17 
 
 		 216 aa  63.5  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1231  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 289 aa  63.5  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00074883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  56.9 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 226 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 208 aa  63.5  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3130  TetR family transcriptional regulator  55.17 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3827  putative transcriptional regulator  28.93 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1391  transcriptional regulator, TetR family  55.17 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8103  transcriptional regulator, TetR family  32.21 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44980  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1443  transcriptional regulator, TetR family  30.54 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79888  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  39.34 
 
 		 224 aa  62.8  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1979  TetR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0716  TetR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.281964  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  53.45 
 
 		 226 aa  62.8  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5306  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.190126 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3605  transcriptional regulator, TetR family  34.75 
 
 		 197 aa  62  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.02462e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3654  TetR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 197 aa  62  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.786622  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5086  transcriptional regulator, TetR family  31.9 
 
 		 210 aa  62  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423561  normal  0.0707297 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2237  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 228 aa  62  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3389  TetR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 241 aa  61.6  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3352  TetR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 241 aa  61.6  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000543998  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3407  TetR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 218 aa  61.6  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0155576  normal  0.84746 
 
 
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NC_013947  Snas_5077  transcriptional regulator, TetR family  38.64 
 
 		 212 aa  61.6  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010511  M446_6397  TetR family transcriptional regulator  51.67 
 
 		 218 aa  61.6  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.467706 
 
 
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NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  30.59 
 
 		 207 aa  61.2  0.000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
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NC_011989  Avi_1313  transcriptional regulator TetR family  30.72 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 220 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
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NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  30.23 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
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NC_011887  Mnod_8100  transcriptional regulator, TetR family  34.09 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978856  n/a   
 
 
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NC_012858  Rleg_7149  transcriptional regulator, TetR family  26.9 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009077  Mjls_1726  TetR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.379747  normal  1 
 
 
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NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  57.41 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
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