More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1421 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1421  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 190 aa  384  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.216023 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5582  TetR family transcriptional regulator  45.41 
 
 		 218 aa  167  8e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.431544 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6393  TetR family transcriptional regulator  45.6 
 
 		 229 aa  155  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0255151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3623  regulatory protein TetR  28.41 
 
 		 193 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.755125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3915  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 215 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2256  TetR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 207 aa  72.4  0.000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0681818  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2329  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 221 aa  72  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2292  TetR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 208 aa  68.6  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0450  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 201 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3880  transcriptional regulator, TetR family  32.8 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.133053 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4265  TetR/AcrR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 228 aa  65.9  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1138  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 228 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00902  transcription regulator protein  34.88 
 
 		 209 aa  64.7  0.0000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806346  normal  0.603909 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4417  transcriptional regulator, TetR family  27.57 
 
 		 207 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1276  transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 		 214 aa  63.9  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0496  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0050  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3598  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.822043 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8100  transcriptional regulator, TetR family  34.81 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978856  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1609  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 224 aa  61.6  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000193721 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2925  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 259 aa  61.6  0.000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2293  TetR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2416  TetR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.363583 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  23.44 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16280  putative transcriptional regulator  30.51 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.450776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4208  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.826614 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4103  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3427  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1400  putative transcriptional regulator  30.91 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2049  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  29.8 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4680  transcriptional regulator, TetR family  35.85 
 
 		 236 aa  58.2  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1511  TetR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 225 aa  58.2  0.00000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1119  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 213 aa  57.8  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5237  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 233 aa  57  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.139236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2441  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.429129  normal  0.59735 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0299  TetR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  27.67 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1944  transcriptional regulator, TetR family  51.02 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00538978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1979  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0532  TetR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 424 aa  57  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  48 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0106  transcriptional regulator  29.19 
 
 		 207 aa  57  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5077  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  31.34 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 231 aa  57  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6592  TetR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.186395 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2537  transcriptional regulator, TetR family  26.18 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1515  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0518509 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1358  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1869  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  46.94 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3994  TetR family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  42 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2237  TetR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 228 aa  55.1  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1121  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0496337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  23.24 
 
 		 231 aa  54.7  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4666  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3923  TetR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 214 aa  54.7  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6912  TetR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 236 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.830717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4487  transcriptional regulator, TetR family  31.19 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6001  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 224 aa  55.1  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.903994  normal  0.20153 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4516  transcriptional regulator, TetR family  31.19 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5954  transcriptional regulator TetR family  30.53 
 
 		 219 aa  54.7  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 207 aa  54.7  0.0000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5246  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 192 aa  54.7  0.0000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6292  TetR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 210 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  51.22 
 
 		 222 aa  54.7  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 234 aa  53.9  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  46.94 
 
 		 211 aa  53.9  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2443  transcriptional regulator, TetR family  24.87 
 
 		 237 aa  54.3  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0506357 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 257 aa  54.3  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3482  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 248 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0660414  normal  0.032442 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0570  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 210 aa  53.9  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0123  transcriptional regulator, TetR family  31 
 
 		 224 aa  53.9  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7149  transcriptional regulator, TetR family  27.89 
 
 		 224 aa  53.9  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 210 aa  53.1  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
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NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  44.9 
 
 		 218 aa  53.5  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
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NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 227 aa  53.1  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
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NC_011666  Msil_3455  transcriptional regulator, TetR family  33.65 
 
 		 245 aa  53.5  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_007958  RPD_3407  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0155576  normal  0.84746 
 
 
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NC_012669  Bcav_0542  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.669667 
 
 
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NC_012791  Vapar_3720  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 225 aa  53.1  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
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NC_008782  Ajs_2029  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 220 aa  53.5  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107784  normal  1 
 
 
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