More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5582 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5582  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 218 aa  429  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.431544 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1421  TetR family transcriptional regulator  45.41 
 
 		 190 aa  167  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.216023 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6393  TetR family transcriptional regulator  45.67 
 
 		 229 aa  164  8e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0255151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5237  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 233 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.139236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3915  transcriptional regulator, TetR family  33.83 
 
 		 215 aa  95.9  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3427  transcriptional regulator, TetR family  40.58 
 
 		 216 aa  82.4  0.000000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00902  transcription regulator protein  31.79 
 
 		 209 aa  79.7  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806346  normal  0.603909 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3623  regulatory protein TetR  31.55 
 
 		 193 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.755125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 216 aa  77.8  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.6413 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6912  TetR family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 236 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.830717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6137  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 207 aa  76.3  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150449  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2256  TetR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0681818  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4417  transcriptional regulator, TetR family  31.55 
 
 		 207 aa  76.3  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2507  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 207 aa  76.3  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.881075  normal  0.842438 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3455  transcriptional regulator, TetR family  38.64 
 
 		 245 aa  74.7  0.0000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18820  transcriptional regulator  34.53 
 
 		 225 aa  73.2  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.348199  normal  0.343375 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0706  TetR family transcriptional regulator  33.69 
 
 		 215 aa  72.8  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0050  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 210 aa  71.2  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1138  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 228 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2292  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 208 aa  71.6  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3682  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 540 aa  67  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0191871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2329  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 221 aa  67.4  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 211 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3598  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.822043 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0518509 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0532  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 424 aa  65.1  0.0000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2925  TetR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 259 aa  64.3  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4046  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933953  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0542  transcriptional regulator, TetR family  39.62 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.669667 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  29.68 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1993  transcriptional regulator, TetR family  25.81 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0496  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  29.86 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1400  putative transcriptional regulator  34.78 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2444  TetR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 217 aa  62  0.000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  30.18 
 
 		 212 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2624  TetR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 214 aa  61.6  0.000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.373378  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 222 aa  61.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 205 aa  61.6  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  34.71 
 
 		 226 aa  61.2  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16280  putative transcriptional regulator  33.91 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.450776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2537  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0744  TetR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3126  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.333802  hitchhiker  0.00150199 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4695  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2402  transcriptional regulator, TetR family  31.22 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  24.64 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1511  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  24.64 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1609  TetR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000193721 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  36.44 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6592  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.186395 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  34.96 
 
 		 220 aa  58.2  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4103  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2237  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 228 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  28.89 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  28.89 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3129  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 191 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3317  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 214 aa  57  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.305506  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4516  transcriptional regulator, TetR family  30.08 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3482  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0660414  normal  0.032442 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4487  transcriptional regulator, TetR family  30.08 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5999  transcriptional regulator, TetR family  30.83 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3130  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 216 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  24.64 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4044  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 214 aa  57  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  34.96 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5045  transcriptional regulator, TetR family  34.68 
 
 		 208 aa  57  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.301448 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1119  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4680  transcriptional regulator, TetR family  33.93 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0008  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1391  transcriptional regulator, TetR family  26.5 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1515  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.512381  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  23.96 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0743  TetR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3727  TetR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000227076 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1156  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1436  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0010  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009079  BMA10247_A0011  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009078  BURPS1106A_A0010  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.387363  n/a   
 
 
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NC_009620  Smed_3994  TetR family transcriptional regulator  29 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
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NC_009665  Shew185_2986  TetR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
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NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
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NC_009952  Dshi_0106  transcriptional regulator  33.06 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009052  Sbal_2972  TetR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419953  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_8103  transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 		 223 aa  55.1  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008321  Shewmr4_0292  TetR family transcriptional regulator  53.06 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000414466 
 
 
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