More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2237 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2237  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 228 aa  471  1e-132  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1869  TetR family transcriptional regulator  62.62 
 
 		 215 aa  264  8e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5253  transcriptional regulator, TetR family  41.58 
 
 		 215 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5533  transcriptional regulator, TetR family  39.32 
 
 		 215 aa  146  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.374337  normal  0.0421471 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3598  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 222 aa  87  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.822043 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 208 aa  82.4  0.000000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0518509 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1456  transcriptional regulator, TetR family  29.1 
 
 		 211 aa  78.2  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5999  transcriptional regulator, TetR family  31.14 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6489  transcriptional regulator, TetR family  29.76 
 
 		 215 aa  72.8  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0093  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 229 aa  72  0.000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.247373  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4103  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 209 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  25.55 
 
 		 230 aa  71.2  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1993  transcriptional regulator, TetR family  25.24 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2537  transcriptional regulator, TetR family  28.04 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  32.81 
 
 		 209 aa  68.9  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4680  transcriptional regulator, TetR family  27.03 
 
 		 236 aa  68.9  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 214 aa  68.6  0.00000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0743  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 216 aa  67.8  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4695  TetR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 215 aa  67.8  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003358  transcriptional regulator  25.51 
 
 		 251 aa  66.6  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.433364  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6393  TetR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 229 aa  66.6  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0255151  normal  1 
 
 
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NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 213 aa  65.5  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 257 aa  65.1  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  40.26 
 
 		 215 aa  64.7  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
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NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  32.69 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
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NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  26.82 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3644  TetR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.106311  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1276  transcriptional regulator, TetR family  28.51 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933053  normal  1 
 
 
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NC_011992  Dtpsy_1838  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.834516  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3273  TetR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 210 aa  62  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.346529  normal  0.756983 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0450  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 201 aa  62  0.000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2029  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 220 aa  62  0.000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3896  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 211 aa  62  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  25.76 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_011004  Rpal_4417  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  25.76 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
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NC_010322  PputGB1_1119  TetR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 213 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4208  TetR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 213 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.826614 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1924  TetR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.343626  normal  1 
 
 
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NC_011071  Smal_2111  transcriptional regulator, TetR family  32.08 
 
 		 214 aa  61.6  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.780559 
 
 
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NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  26.63 
 
 		 230 aa  61.2  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
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NC_013947  Snas_1938  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 226 aa  60.5  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.165177  normal  1 
 
 
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NC_007643  Rru_A2444  TetR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007794  Saro_0706  TetR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012669  Bcav_0542  transcriptional regulator, TetR family  33.11 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.669667 
 
 
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NC_013521  Sked_18820  transcriptional regulator  30.14 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.348199  normal  0.343375 
 
 
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NC_011666  Msil_2443  transcriptional regulator, TetR family  27.43 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0506357 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3720  transcriptional regulator, TetR family  29.68 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2432  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0652024 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4265  TetR/AcrR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 228 aa  60.1  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752062  normal  1 
 
 
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NC_011666  Msil_3427  transcriptional regulator, TetR family  34.06 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_011989  Avi_3517  transcriptional regulator protein  27.78 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.873146  n/a   
 
 
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NC_009719  Plav_2441  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.429129  normal  0.59735 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0532  TetR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 424 aa  59.3  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1515  TetR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3455  transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 		 245 aa  58.5  0.00000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 247 aa  58.5  0.00000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 247 aa  58.5  0.00000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  34.07 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1767  TetR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.271955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3915  transcriptional regulator, TetR family  31.85 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0552  transcriptional regulator, TetR family  26.4 
 
 		 208 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  32.77 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2329  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 221 aa  58.2  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6158  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.488727  normal  0.104212 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5582  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 218 aa  58.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.431544 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  25.26 
 
 		 226 aa  57.8  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
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NC_009092  Shew_1544  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 219 aa  58.2  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00902  transcription regulator protein  26.62 
 
 		 209 aa  57  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806346  normal  0.603909 
 
 
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NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  26.21 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
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NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  30.88 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2256  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 207 aa  57  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0681818  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3923  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  26.4 
 
 		 208 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0155  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2049  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8304  transcriptional regulator, TetR family  31.06 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.505381  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1279  regulatory protein, TetR  27.95 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.211303  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  35.34 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007492  Pfl01_3058  TetR family transcriptional regulator  23.5 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.765793  normal  0.0466418 
 
 
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NC_007760  Adeh_0519  TetR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011729  PCC7424_3129  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_011071  Smal_3394  transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.222962 
 
 
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NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  37.33 
 
 		 271 aa  55.1  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  29.2 
 
 		 231 aa  55.1  0.0000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
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NC_008751  Dvul_0496  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.250936 
 
 
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NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 330 aa  55.1  0.0000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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