More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3273 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3273  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 210 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.346529  normal  0.756983 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3896  transcriptional regulator, TetR family  80.69 
 
 		 211 aa  335  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7041  TetR family transcriptional regulator  45.18 
 
 		 224 aa  166  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.971453 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4695  TetR family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 215 aa  72.8  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1663  TetR family transcriptional regulator  46.75 
 
 		 194 aa  71.6  0.000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.319165 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3427  transcriptional regulator, TetR family  30.1 
 
 		 216 aa  70.5  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3682  TetR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 540 aa  67  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0191871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1609  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000193721 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2444  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 217 aa  65.1  0.0000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1945  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 225 aa  63.2  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1869  TetR family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3598  TetR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.822043 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2237  TetR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 228 aa  62  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0507  TetR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 211 aa  62  0.000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.982351 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 202 aa  62  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3915  transcriptional regulator, TetR family  36.21 
 
 		 215 aa  61.6  0.000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0400  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5954  transcriptional regulator TetR family  35.34 
 
 		 219 aa  61.2  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0056  transcriptional regulator, TetR family  33.61 
 
 		 198 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  35.48 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  34.26 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013456  VEA_003358  transcriptional regulator  32.06 
 
 		 251 aa  58.2  0.00000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.433364  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5327  TetR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4680  transcriptional regulator, TetR family  32.48 
 
 		 236 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8304  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.505381  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_2423  transcriptional regulator, TetR family  25.57 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3880  transcriptional regulator, TetR family  27.72 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.133053 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5887  TetR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.825874 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2973  transcriptional regulator, TetR family  37.18 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3623  regulatory protein TetR  37.25 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.755125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3823  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0524018  normal  0.237924 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2176  TetR family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000096918  n/a   
 
 
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NC_011368  Rleg2_5533  transcriptional regulator, TetR family  43.08 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.374337  normal  0.0421471 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1049  TetR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5253  transcriptional regulator, TetR family  43.08 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2441  TetR family transcriptional regulator  24.72 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.21008  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2506  transcriptional regulator, TetR family  24.43 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.733789  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2242  TetR family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.640782  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2959  transcriptional regulator, TetR family  24.43 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177797 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2162  TetR family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.116975  n/a   
 
 
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NC_007530  GBAA_2406  TetR family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00620  Transcriptional regulatory protein, TetR family  31.87 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010678  Rpic_3806  transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.238661 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3919  transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.738583 
 
 
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NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  41.79 
 
 		 251 aa  55.8  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 242 aa  55.5  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
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NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  31.48 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4433  putative transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 199 aa  55.1  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304497  hitchhiker  0.00999637 
 
 
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NC_011725  BCB4264_A2373  transcriptional regulator, TetR family  24.43 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4046  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 222 aa  54.7  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933953  normal  0.278605 
 
 
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NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  36.13 
 
 		 204 aa  54.7  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5168  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 215 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011988  Avi_5949  transcriptional regulator TetR family  29.19 
 
 		 250 aa  54.7  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008705  Mkms_5257  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 215 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5549  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 215 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012560  Avin_10080  Transcriptional regulator, TetR family  29.44 
 
 		 217 aa  54.7  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.530554  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1742  transcriptional regulator, TetR family  30.17 
 
 		 235 aa  54.3  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.666045  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  39.34 
 
 		 230 aa  53.5  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5366  transcriptional regulator, TetR family  25.12 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00158369  normal  0.823764 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3317  TetR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 214 aa  53.9  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.305506  n/a   
 
 
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NC_007974  Rmet_4265  TetR/AcrR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 228 aa  53.5  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0855  transcriptional regulator, TetR family  30.58 
 
 		 223 aa  53.5  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.835032 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5073  transcriptional regulator TetR family  31.86 
 
 		 227 aa  53.9  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.479761  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2859  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 186 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.111234  n/a   
 
 
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NC_009050  Rsph17029_4044  TetR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 214 aa  53.9  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 207 aa  53.1  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6361  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 198 aa  53.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4087  transcriptional regulator, TetR family  39.77 
 
 		 228 aa  52.8  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.98142 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05760  Transcriptional regulatory protein, TetR family  39.06 
 
 		 195 aa  52.8  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.466087  n/a   
 
 
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NC_010001  Cphy_0667  TetR family transcriptional regulator  22.09 
 
 		 200 aa  52.8  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000042492  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 231 aa  52.8  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 210 aa  52.8  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1467  hypothetical protein  29.22 
 
 		 213 aa  52.4  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.165444  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0266  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 207 aa  52.4  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.437766  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 184 aa  52.4  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1060  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 227 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2781  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 206 aa  52  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000487748 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1098  TetR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 209 aa  52  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0976848 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0340  transcriptional regulator, TetR family  36.14 
 
 		 388 aa  52  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008825  Mpe_A0992  putative transcriptional regulator of paa operon  48.98 
 
 		 208 aa  52  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.332152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2095  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 222 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.112478 
 
 
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NC_011738  PCC7424_5713  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 190 aa  51.6  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_012857  Rpic12D_4644  transcriptional regulator, TetR family  51.22 
 
 		 188 aa  52  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0446716 
 
 
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NC_009714  CHAB381_0566  transcription regulator protein  22.41 
 
 		 207 aa  52  0.000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.000000411686  n/a   
 
 
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NC_008146  Mmcs_0606  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 194 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
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NC_008705  Mkms_0619  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 194 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.594999  normal  1 
 
 
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NC_011004  Rpal_4290  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 226 aa  52  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000567463  n/a   
 
 
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NC_009077  Mjls_0597  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 194 aa  52  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  32.17 
 
 		 194 aa  52  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010678  Rpic_4512  transcriptional regulator, TetR family  51.22 
 
 		 188 aa  52  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.551086  normal  1 
 
 
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NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  32.08 
 
 		 200 aa  51.6  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_009720  Xaut_0894  TetR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 260 aa  51.6  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  33.59 
 
 		 199 aa  51.6  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
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NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  32.08 
 
 		 200 aa  51.6  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
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NC_009784  VIBHAR_06672  hypothetical protein  24.63 
 
 		 198 aa  51.6  0.000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_2219  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 207 aa  51.6  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
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NC_012848  Rleg_5086  transcriptional regulator, TetR family  24.88 
 
 		 210 aa  51.6  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423561  normal  0.0707297 
 
 
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NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  29.15 
 
 		 207 aa  51.2  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
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