More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0429 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 213 aa  418  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  83.89 
 
 		 223 aa  358  5e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6941  transcriptional regulator, TetR family  43.22 
 
 		 221 aa  151  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0464  transcriptional regulator, TetR family  46.41 
 
 		 211 aa  144  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.128175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0395  regulatory protein TetR  44.75 
 
 		 211 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.796791 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1372  TetR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 212 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027491 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0428  transcriptional regulator, TetR family  44.2 
 
 		 211 aa  137  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5773  TetR family transcriptional regulator  37.43 
 
 		 198 aa  95.5  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6138  TetR family transcriptional regulator  37.43 
 
 		 198 aa  95.5  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.890581 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  37.43 
 
 		 194 aa  94.7  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7672  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 198 aa  94  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245363  normal  0.688993 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 222 aa  94  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3781  TetR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 214 aa  94  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0018  TetR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 196 aa  87  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 199 aa  87.4  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1493  transcriptional regulator, TetR family  38.07 
 
 		 198 aa  85.9  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1843  transcriptional regulatory protein  32.8 
 
 		 201 aa  85.5  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.677238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7736  putative transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 		 205 aa  85.5  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1173  regulatory protein, TetR  34.92 
 
 		 202 aa  83.2  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.959952 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1440  TetR family transcriptional regulator  40.88 
 
 		 213 aa  82.4  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0208928 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2134  TetR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 205 aa  82  0.000000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.269562  normal  0.11419 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2853  TetR family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 213 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.788684  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1090  transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 		 204 aa  80.1  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2111  transcriptional regulator, TetR family  32.45 
 
 		 214 aa  79.7  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.780559 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1015  transcriptional regulator, TetR family  33.17 
 
 		 201 aa  79.3  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0700  TetR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 178 aa  79  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2962  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 201 aa  78.6  0.00000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0995  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 192 aa  78.2  0.00000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1426  transcriptional regulator, TetR family  31.14 
 
 		 204 aa  77.8  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0803354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1419  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 220 aa  77  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1191  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 198 aa  77.4  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1503  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 215 aa  76.3  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0825242 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1719  transcriptional regulator, TetR family  33.54 
 
 		 196 aa  75.9  0.0000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4533  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 218 aa  75.1  0.0000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.505005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  28.49 
 
 		 198 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2513  transcriptional regulator, TetR family  31.49 
 
 		 199 aa  70.9  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4820  transcriptional regulator, TetR family  34.34 
 
 		 203 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1805  transcriptional regulator UidR  27.27 
 
 		 196 aa  70.1  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.947665  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1926  transcriptional regulator EefR  29.71 
 
 		 188 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0902915  hitchhiker  0.0000000455593 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1826  transcriptional regulator UidR  27.27 
 
 		 196 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01587  DNA-binding transcriptional repressor  27.27 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2012  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.952906  normal  0.615913 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2330  transcriptional regulator UidR  27.27 
 
 		 195 aa  69.3  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01577  hypothetical protein  27.27 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1693  transcriptional regulator UidR  27.27 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1837  transcriptional regulator EefR  29.31 
 
 		 188 aa  69.3  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000033131 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1333  TetR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 201 aa  69.3  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.103575  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2024  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 192 aa  68.9  0.00000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180766  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1581  transcriptional regulator UidR  27.27 
 
 		 192 aa  68.9  0.00000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3998  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 205 aa  69.3  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0825494  normal  0.0160725 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3772  TetR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 201 aa  68.6  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.392718  normal  0.705056 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2237  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 228 aa  65.5  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 216 aa  65.1  0.0000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2825  TetR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0304388 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1358  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.824963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1473  TetR family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 187 aa  62.4  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 206 aa  62  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 224 aa  61.6  0.000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2216  TetR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 203 aa  61.6  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0817319 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3471  transcriptional regulator, TetR family  42.67 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2750  TetR family transcriptional regulator  52.83 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.172363  normal  0.153941 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3759  transcriptional regulator, TetR family  42.67 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.341264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16270  transcriptional regulator  28.14 
 
 		 287 aa  59.7  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1780  transcriptional regulator, TetR family  46.88 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0184  TetR family transcriptional regulator  23.28 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4377  transcriptional regulator, TetR family  52.83 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314155  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0332  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2430  transcriptional regulator, TetR family  30.57 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.466149 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  49.18 
 
 		 186 aa  58.2  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2980  TetR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 203 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5157  putative transcriptional regulator, TetR family  46.03 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23435  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2695  transcriptional regulator, TetR family  27.5 
 
 		 185 aa  58.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000333836  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5473  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.968436  normal  0.0284284 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  47.27 
 
 		 222 aa  57  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1451  transcriptional regulator, TetR family  33.06 
 
 		 428 aa  57  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4220  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.267151 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4072  TetR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.404237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5076  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 209 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1776  transcriptional regulator, TetR family  35.25 
 
 		 218 aa  57  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0293549  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4900  transcriptional regulator, TetR family  44.62 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.909356  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5784  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 209 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0369  transcriptional regulator, TetR family  24.75 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.238864 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3666  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 187 aa  57  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.356922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1225  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.657492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3573  transcriptional regulator, TetR family  30.29 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1083  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.243709  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0059  transcriptional regulator, TetR family  19.54 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00007304  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10241  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000764085  normal  0.925652 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1604  AcrR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.388293  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>