More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4778 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 217 aa  441  1e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  97.46 
 
 		 197 aa  391  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  89.05 
 
 		 212 aa  386  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  89.05 
 
 		 212 aa  386  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  89.05 
 
 		 212 aa  386  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  89.34 
 
 		 197 aa  362  2e-99  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  75 
 
 		 220 aa  315  5e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  66.49 
 
 		 200 aa  266  1e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  62.69 
 
 		 218 aa  263  1e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  58.49 
 
 		 227 aa  263  2e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  59.33 
 
 		 226 aa  262  3e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  62.37 
 
 		 221 aa  261  4e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  62.19 
 
 		 215 aa  261  8e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  61.93 
 
 		 330 aa  261  8e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  61.54 
 
 		 216 aa  259  2e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  61.81 
 
 		 205 aa  258  4e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  59.22 
 
 		 218 aa  258  5.0000000000000005e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  63.45 
 
 		 220 aa  258  6e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  60.5 
 
 		 211 aa  254  6e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  59.11 
 
 		 231 aa  254  8e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0984  transcriptional regulator, TetR family  60.51 
 
 		 245 aa  250  1e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.50937  hitchhiker  0.00233885 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8610  putative transcriptional regulator, TetR family  61.34 
 
 		 317 aa  249  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  59.2 
 
 		 271 aa  243  9.999999999999999e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  59.6 
 
 		 225 aa  243  1.9999999999999999e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  58.91 
 
 		 204 aa  242  3.9999999999999997e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  59.9 
 
 		 207 aa  238  4e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1286  transcriptional regulator, TetR family  58.59 
 
 		 199 aa  236  3e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000123202 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1944  transcriptional regulator, TetR family  58.97 
 
 		 205 aa  236  3e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00538978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  56.8 
 
 		 215 aa  233  2.0000000000000002e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1238  AcrR family transcriptional regulator  51.53 
 
 		 273 aa  207  9e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  33.8 
 
 		 237 aa  109  4.0000000000000004e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  35.92 
 
 		 206 aa  108  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 228 aa  105  6e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  33.67 
 
 		 223 aa  102  7e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 211 aa  95.9  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 224 aa  94.7  8e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 224 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 215 aa  92  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 224 aa  91.7  8e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 224 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 224 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 238 aa  89.7  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  32.18 
 
 		 221 aa  89.7  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0828  transcriptional regulator, TetR family  33.18 
 
 		 275 aa  89  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 195 aa  88.6  7e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 218 aa  87.4  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 		 221 aa  87  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6979  transcriptional regulator, TetR family  29.91 
 
 		 220 aa  86.3  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.941023  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 224 aa  85.5  6e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  28.5 
 
 		 216 aa  84  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 228 aa  83.6  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06690  transcriptional regulator  31.1 
 
 		 256 aa  82.8  0.000000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  31.22 
 
 		 209 aa  80.9  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 206 aa  80.9  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 212 aa  80.9  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 212 aa  80.1  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  30.61 
 
 		 205 aa  79  0.00000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  27.09 
 
 		 222 aa  79  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  26.64 
 
 		 216 aa  79  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0830  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 214 aa  78.2  0.00000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0305  transcriptional regulator, TetR family  31.38 
 
 		 215 aa  78.2  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.437849  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 206 aa  76.3  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  29 
 
 		 206 aa  76.6  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0710  transcriptional regulator, TetR family  46.05 
 
 		 248 aa  75.1  0.0000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  29.15 
 
 		 220 aa  74.7  0.0000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27670  transcriptional regulator  45.78 
 
 		 254 aa  74.3  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  25.37 
 
 		 219 aa  74.3  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  28.86 
 
 		 206 aa  73.6  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 216 aa  73.6  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  27.33 
 
 		 225 aa  70.9  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0424  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 201 aa  71.2  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.315635  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2242  transcriptional regulator, TetR family  28.19 
 
 		 208 aa  70.9  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0149249  normal  0.352289 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0330  transcriptional regulator, TetR family  27.5 
 
 		 233 aa  71.2  0.00000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15250  transcriptional regulator, tetR family  30.41 
 
 		 218 aa  70.1  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.110377  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2486  transcriptional regulator, TetR family  32.09 
 
 		 200 aa  70.5  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00165208  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2475  transcriptional regulator, TetR family  43.96 
 
 		 222 aa  70.5  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.260568  hitchhiker  0.0024636 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4456  regulatory protein TetR  28.29 
 
 		 202 aa  70.1  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0166479  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38900  transcriptional regulator, TetR family  26.17 
 
 		 226 aa  69.3  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.749862  normal  0.429215 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10241  TetR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 204 aa  68.6  0.00000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000764085  normal  0.925652 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0293  transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 		 230 aa  67.8  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1434  transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 		 225 aa  67  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.185065  normal  0.789444 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0236  TetR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 218 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0269868  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4944  TetR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4626  transcriptional regulator, TetR family  30.23 
 
 		 211 aa  67  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  hitchhiker  0.00755279 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0246  TetR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 218 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5032  TetR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0226  TetR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 218 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.131166 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5325  TetR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.586018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1650  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 196 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00305011  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  24.24 
 
 		 203 aa  65.9  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  49.15 
 
 		 220 aa  65.5  0.0000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6393  TetR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 229 aa  65.5  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0255151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 208 aa  65.5  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 197 aa  64.7  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0265  TetR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 194 aa  64.7  0.0000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3981  transcriptional regulator, TetR family  28.08 
 
 		 198 aa  64.3  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000890193 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3827  transcriptional regulator, TetR family  31.72 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.31638 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2592  transcriptional regulator, TetR family  26.06 
 
 		 192 aa  64.7  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119823  normal  0.0690788 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0175  TetR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 203 aa  63.9  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  31.46 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>