More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0919 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 215 aa  430  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  82.78 
 
 		 238 aa  356  9.999999999999999e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  60.77 
 
 		 212 aa  248  5e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  63.37 
 
 		 206 aa  248  6e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  59.33 
 
 		 212 aa  239  2e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  59.3 
 
 		 216 aa  238  5e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  59.61 
 
 		 206 aa  237  9e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  60.51 
 
 		 206 aa  235  5.0000000000000005e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  60.71 
 
 		 221 aa  233  1.0000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  60 
 
 		 206 aa  229  2e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  59.16 
 
 		 195 aa  227  1e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  57.21 
 
 		 216 aa  226  3e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  55.56 
 
 		 219 aa  225  3e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  54.85 
 
 		 222 aa  223  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  52.09 
 
 		 223 aa  211  7e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0830  transcriptional regulator, TetR family  59.09 
 
 		 214 aa  209  3e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  54.29 
 
 		 221 aa  207  9e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  49.49 
 
 		 237 aa  202  4e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  52.31 
 
 		 228 aa  196  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  50.52 
 
 		 228 aa  196  3e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3827  transcriptional regulator, TetR family  61.67 
 
 		 212 aa  194  7e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.31638 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  47.34 
 
 		 224 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  47.34 
 
 		 224 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  46.34 
 
 		 224 aa  188  5e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  48.97 
 
 		 224 aa  187  9e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  47.94 
 
 		 224 aa  187  9e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15250  transcriptional regulator, tetR family  43.13 
 
 		 218 aa  140  9.999999999999999e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.110377  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2475  transcriptional regulator, TetR family  40.81 
 
 		 222 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.260568  hitchhiker  0.0024636 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27670  transcriptional regulator  34.42 
 
 		 254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0710  transcriptional regulator, TetR family  32.6 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 197 aa  99.4  3e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 		 209 aa  99.4  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  33.02 
 
 		 215 aa  98.6  7e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 227 aa  98.6  7e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  34.8 
 
 		 226 aa  97.4  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  34.47 
 
 		 215 aa  96.3  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6979  transcriptional regulator, TetR family  35.27 
 
 		 220 aa  95.9  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.941023  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  32.31 
 
 		 205 aa  95.5  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  31.63 
 
 		 225 aa  95.5  6e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 212 aa  95.1  8e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 212 aa  95.1  8e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 212 aa  95.1  8e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 224 aa  94  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  32.52 
 
 		 271 aa  94.4  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  33 
 
 		 220 aa  93.6  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  30.46 
 
 		 220 aa  92.8  4e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  32.8 
 
 		 207 aa  92.4  5e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 217 aa  92  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  31.34 
 
 		 211 aa  92  5e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  31.55 
 
 		 211 aa  92  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10241  TetR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 204 aa  92  7e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000764085  normal  0.925652 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0236  TetR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 218 aa  91.7  8e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0269868  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0246  TetR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 218 aa  91.7  8e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0226  TetR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 218 aa  91.7  8e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.131166 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  31.63 
 
 		 218 aa  90.9  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 203 aa  90.9  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1944  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 205 aa  89.7  3e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00538978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 197 aa  89.4  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 218 aa  89.4  4e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0414  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 215 aa  89  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.462572  normal  0.0664832 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 204 aa  89  6e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  33.67 
 
 		 218 aa  88.2  9e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  32.63 
 
 		 200 aa  88.2  9e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1286  transcriptional regulator, TetR family  29.84 
 
 		 199 aa  87.8  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000123202 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 220 aa  87.8  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 216 aa  87.4  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0257  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 209 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102981 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4626  transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 		 211 aa  86.3  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  hitchhiker  0.00755279 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38900  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 226 aa  85.1  7e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.749862  normal  0.429215 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0984  transcriptional regulator, TetR family  30.53 
 
 		 245 aa  85.1  7e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.50937  hitchhiker  0.00233885 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  32.81 
 
 		 221 aa  84.7  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8610  putative transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 317 aa  83.2  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  30.54 
 
 		 205 aa  82.8  0.000000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  29.8 
 
 		 231 aa  82.4  0.000000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 225 aa  82.4  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0330  transcriptional regulator, TetR family  36.26 
 
 		 233 aa  82  0.000000000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 330 aa  81.3  0.000000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1238  AcrR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 273 aa  80.5  0.00000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  37.8 
 
 		 206 aa  80.5  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4029  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 217 aa  79  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.697639  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 216 aa  78.6  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4456  regulatory protein TetR  31.68 
 
 		 202 aa  78.2  0.00000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0166479  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06690  transcriptional regulator  31.82 
 
 		 256 aa  77  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2242  transcriptional regulator, TetR family  34.5 
 
 		 208 aa  77  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0149249  normal  0.352289 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0305  transcriptional regulator, TetR family  30.37 
 
 		 215 aa  75.5  0.0000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.437849  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  33.65 
 
 		 220 aa  73.6  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0828  transcriptional regulator, TetR family  29.1 
 
 		 275 aa  71.2  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0424  transcriptional regulator, TetR family  29.15 
 
 		 201 aa  69.3  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.315635  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  33.33 
 
 		 230 aa  69.3  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  34.59 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0972  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 233 aa  68.6  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93446  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12528  TetR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0275989 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 212 aa  68.2  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3962  putative transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 194 aa  67  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.545183  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2551  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 206 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48532  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3995  transcriptional regulator, TetR family  47.14 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200757  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1993  transcriptional regulator, TetR family  39.33 
 
 		 223 aa  65.5  0.0000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1312  TetR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 206 aa  64.7  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.278349  normal  0.387509 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 190 aa  64.7  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0807  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.271007  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>