More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_27670 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_27670  transcriptional regulator  100 
 
 		 254 aa  506  9.999999999999999e-143  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0710  transcriptional regulator, TetR family  47.74 
 
 		 248 aa  187  1e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2475  transcriptional regulator, TetR family  45.96 
 
 		 222 aa  158  8e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.260568  hitchhiker  0.0024636 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  37.96 
 
 		 206 aa  129  6e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  36.44 
 
 		 216 aa  128  8.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  37.85 
 
 		 206 aa  124  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  35.63 
 
 		 221 aa  123  3e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 206 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  35.04 
 
 		 216 aa  118  7.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 215 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 228 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 195 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 206 aa  115  6e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  35.45 
 
 		 222 aa  115  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  38.25 
 
 		 212 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  33.8 
 
 		 221 aa  108  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 223 aa  99  6e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 228 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  32.41 
 
 		 219 aa  94.4  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0830  transcriptional regulator, TetR family  32.71 
 
 		 214 aa  94.7  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  31.25 
 
 		 237 aa  92.8  5e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 224 aa  89.7  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3827  transcriptional regulator, TetR family  36.14 
 
 		 212 aa  87.8  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.31638 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 224 aa  85.5  8e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 224 aa  85.5  8e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 224 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 224 aa  82.4  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  38.41 
 
 		 206 aa  77  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  48.57 
 
 		 220 aa  75.9  0.0000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  43.68 
 
 		 212 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  43.68 
 
 		 212 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  43.68 
 
 		 212 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  45.78 
 
 		 217 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 216 aa  73.2  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  44.87 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  43.37 
 
 		 218 aa  72.8  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  41.98 
 
 		 231 aa  71.6  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0330  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 233 aa  69.7  0.00000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 227 aa  69.7  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  46.58 
 
 		 205 aa  69.3  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  42.67 
 
 		 220 aa  68.9  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  34.68 
 
 		 225 aa  68.6  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  27.01 
 
 		 211 aa  67.8  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 197 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 330 aa  67.8  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  45.33 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  39.02 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0257  TetR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 209 aa  65.9  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102981 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  40 
 
 		 226 aa  65.5  0.0000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 218 aa  65.5  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15250  transcriptional regulator, tetR family  32.37 
 
 		 218 aa  65.5  0.0000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.110377  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4456  regulatory protein TetR  26.27 
 
 		 202 aa  65.1  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0166479  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  26.61 
 
 		 209 aa  65.1  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0236  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 218 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0269868  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0246  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 218 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0226  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 218 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.131166 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3709  TetR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 221 aa  63.9  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0975739  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  52.54 
 
 		 197 aa  64.3  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0984  transcriptional regulator, TetR family  33.01 
 
 		 245 aa  63.5  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.50937  hitchhiker  0.00233885 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0414  TetR family transcriptional regulator  24.65 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.462572  normal  0.0664832 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  38.96 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10241  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000764085  normal  0.925652 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  40.96 
 
 		 271 aa  62  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 224 aa  62  0.000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1944  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 205 aa  62  0.000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00538978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1238  AcrR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 273 aa  61.6  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 218 aa  61.6  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0424  transcriptional regulator, TetR family  26.05 
 
 		 201 aa  61.2  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.315635  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6979  transcriptional regulator, TetR family  41.43 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.941023  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  34.91 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8610  putative transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 317 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  38.26 
 
 		 197 aa  61.2  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 		 216 aa  61.2  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6808  TetR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3702  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  32.61 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0122  transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.288839  decreased coverage  0.00195597 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2256  TetR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0681818  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  40.28 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0030  TetR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 193 aa  58.2  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.19641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0905  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.938127  normal  0.145255 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38900  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.749862  normal  0.429215 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  40.28 
 
 		 203 aa  57  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5954  transcriptional regulator TetR family  38.33 
 
 		 219 aa  57  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 222 aa  57  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 206 aa  57  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0571  TetR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 428 aa  57  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.108649  hitchhiker  0.00715519 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0549  TetR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 451 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.166167  normal  0.823365 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0013  TetR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 424 aa  57  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0542947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30540  transcriptional regulator, TetR family  29.33 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4179  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 396 aa  56.6  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>