More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0194 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 225 aa  449  1e-125  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  37.22 
 
 		 224 aa  129  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  41.01 
 
 		 218 aa  124  9e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6979  transcriptional regulator, TetR family  40.81 
 
 		 220 aa  123  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.941023  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  35.75 
 
 		 209 aa  122  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 206 aa  118  9e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38900  transcriptional regulator, TetR family  35.61 
 
 		 226 aa  113  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.749862  normal  0.429215 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  33.51 
 
 		 205 aa  108  8.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0236  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 218 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0269868  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0246  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 218 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0226  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 218 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.131166 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10241  TetR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 204 aa  105  6e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000764085  normal  0.925652 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0257  TetR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 209 aa  104  8e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102981 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  35.68 
 
 		 211 aa  103  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 212 aa  101  7e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0414  TetR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 215 aa  100  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.462572  normal  0.0664832 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  32.08 
 
 		 222 aa  100  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 212 aa  99  6e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 206 aa  98.6  7e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  34.72 
 
 		 206 aa  97.4  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 206 aa  98.2  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4456  regulatory protein TetR  34.63 
 
 		 202 aa  97.4  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0166479  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 206 aa  96.7  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2242  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 208 aa  95.9  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0149249  normal  0.352289 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  34.87 
 
 		 237 aa  95.5  6e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0424  transcriptional regulator, TetR family  34.33 
 
 		 201 aa  94.7  9e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.315635  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  34.87 
 
 		 216 aa  94.7  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  34.92 
 
 		 221 aa  92.4  5e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  34.48 
 
 		 220 aa  92  6e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0330  transcriptional regulator, TetR family  37.75 
 
 		 233 aa  90.5  2e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 205 aa  89.4  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 224 aa  89.4  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 224 aa  89.4  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 223 aa  89.4  5e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 224 aa  89  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 228 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 224 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  32.37 
 
 		 207 aa  86.7  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 224 aa  85.9  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 330 aa  83.6  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 215 aa  82.4  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  29.85 
 
 		 219 aa  82  0.000000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  29.55 
 
 		 215 aa  81.6  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 		 216 aa  80.9  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 228 aa  80.9  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  29.65 
 
 		 271 aa  79.7  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  29.71 
 
 		 220 aa  79.3  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 238 aa  79.3  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 227 aa  79.3  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  27.57 
 
 		 221 aa  79  0.00000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 204 aa  77.4  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3827  transcriptional regulator, TetR family  34.13 
 
 		 212 aa  77  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.31638 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  28.31 
 
 		 200 aa  77.4  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  29.48 
 
 		 218 aa  77  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 212 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 212 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 225 aa  76.6  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 212 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 220 aa  75.9  0.0000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  26.9 
 
 		 211 aa  75.9  0.0000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  29.65 
 
 		 226 aa  75.1  0.0000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  28.79 
 
 		 216 aa  74.7  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 216 aa  74.7  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0830  transcriptional regulator, TetR family  34.57 
 
 		 214 aa  74.3  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  29.51 
 
 		 203 aa  74.7  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  28.04 
 
 		 221 aa  73.9  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 195 aa  73.9  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  30.52 
 
 		 220 aa  72.8  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  27.74 
 
 		 231 aa  71.2  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 217 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 197 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4029  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 217 aa  68.9  0.00000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.697639  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 218 aa  68.6  0.00000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  40.4 
 
 		 197 aa  67.8  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 197 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06690  transcriptional regulator  28.12 
 
 		 256 aa  68.2  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8610  putative transcriptional regulator, TetR family  25.67 
 
 		 317 aa  66.6  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27670  transcriptional regulator  34.68 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7871  transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 		 212 aa  64.7  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.519364  normal  0.175428 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 228 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0984  transcriptional regulator, TetR family  25.9 
 
 		 245 aa  63.9  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.50937  hitchhiker  0.00233885 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1286  transcriptional regulator, TetR family  26.22 
 
 		 199 aa  63.9  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000123202 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3644  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.106311  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3750  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 236 aa  63.2  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178814  decreased coverage  0.0038225 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4626  transcriptional regulator, TetR family  31.1 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  hitchhiker  0.00755279 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4599  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 220 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11567  transcriptional regulator  30.23 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2592  transcriptional regulator, TetR family  29.14 
 
 		 192 aa  62  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119823  normal  0.0690788 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2175  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 218 aa  62  0.000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  41.57 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1231  TetR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 289 aa  61.2  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00074883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  42.7 
 
 		 241 aa  61.6  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2249  transcriptional regulator, TetR family  51.92 
 
 		 228 aa  61.2  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115177  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 216 aa  61.2  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3020  transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000370253  normal  0.25528 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1238  AcrR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 273 aa  60.5  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1941  transcriptional regulator, TetR family  24.88 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000874649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0710  transcriptional regulator, TetR family  39.08 
 
 		 248 aa  60.1  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>