More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7871 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7871  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 212 aa  415  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.519364  normal  0.175428 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0584  transcriptional regulator, TetR family  33.82 
 
 		 207 aa  79.3  0.00000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3682  transcriptional regulator, TetR family  34.01 
 
 		 215 aa  73.2  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.7622  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1794  transcriptional regulator  29.5 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 		 225 aa  64.7  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10241  TetR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 204 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000764085  normal  0.925652 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38900  transcriptional regulator, TetR family  27.92 
 
 		 226 aa  61.2  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.749862  normal  0.429215 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0257  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102981 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0414  TetR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.462572  normal  0.0664832 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0236  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0269868  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0246  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0226  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.131166 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  45.76 
 
 		 220 aa  57  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2004  regulatory protein TetR  32.76 
 
 		 216 aa  57  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.84069  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  30.83 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2823  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 208 aa  53.9  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00548665  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0850  TetR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 209 aa  52.8  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0204358 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1656  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 196 aa  53.1  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0515046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31350  hypothetical protein  29.69 
 
 		 203 aa  52.4  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112877  normal  0.357558 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5420  TetR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 202 aa  52.4  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.66162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1231  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 289 aa  52  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00074883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  29.91 
 
 		 231 aa  52  0.000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4456  regulatory protein TetR  26.16 
 
 		 202 aa  51.6  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0166479  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3632  TetR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 207 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3705  TetR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 207 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4092  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 206 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  25.81 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 125 aa  50.8  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  31.01 
 
 		 225 aa  50.8  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2260  regulatory protein TetR  41.07 
 
 		 199 aa  50.8  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.535255  normal  0.350629 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6216  transcriptional regulator, TetR family  29.85 
 
 		 208 aa  50.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3637  TetR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 207 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.262942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0330  transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 		 233 aa  50.4  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0424  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 201 aa  49.7  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.315635  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  40.32 
 
 		 223 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1061  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 234 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.464557  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 206 aa  50.1  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3501  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 209 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.191946  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4865  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 209 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3073  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 198 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  49.09 
 
 		 200 aa  49.7  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2242  transcriptional regulator, TetR family  28.26 
 
 		 208 aa  50.1  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0149249  normal  0.352289 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3036  regulatory protein, TetR  37.23 
 
 		 216 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0300267  normal  0.0658454 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 211 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2036  regulatory protein, TetR  28.57 
 
 		 206 aa  49.3  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.284785 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3389  transcriptional regulator, TetR family  36.94 
 
 		 187 aa  49.3  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  44 
 
 		 186 aa  49.3  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14200  transcriptional regulator, TetR family  36.26 
 
 		 227 aa  49.3  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000918467  decreased coverage  0.00704922 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  30.28 
 
 		 216 aa  49.3  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  41.79 
 
 		 220 aa  49.3  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3412  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 206 aa  48.9  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.430092  normal  0.661157 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2704  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 203 aa  48.9  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.187148 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6592  TetR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 225 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.186395 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 220 aa  49.3  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7097  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 206 aa  48.9  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1991  transcriptional regulator, TetR family  44.26 
 
 		 188 aa  48.9  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 222 aa  48.9  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1430  regulatory protein TetR  44.44 
 
 		 236 aa  48.9  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  51.67 
 
 		 193 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2551  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 206 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48532  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 213 aa  48.5  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2202  transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 		 186 aa  48.5  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  29.2 
 
 		 203 aa  48.5  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 202 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 188 aa  48.5  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3216  TetR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 197 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.278224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2186  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 214 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0785456  normal  0.820524 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3205  TetR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 197 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3267  TetR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 197 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0261097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2169  transcriptional regulator, TetR family  38.03 
 
 		 207 aa  48.5  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0836  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 199 aa  48.5  0.00008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6979  transcriptional regulator, TetR family  34.94 
 
 		 220 aa  48.5  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.941023  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 224 aa  48.1  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 212 aa  48.1  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3020  transcriptional regulator, TetR family  33.88 
 
 		 213 aa  48.1  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000370253  normal  0.25528 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 212 aa  47.4  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3171  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 216 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.323724  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3240  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 209 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  36.49 
 
 		 216 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  34.07 
 
 		 212 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1924  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 210 aa  48.1  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.343626  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0541  transcriptional regulator, TetR family  48.39 
 
 		 192 aa  48.1  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.451413  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 219 aa  47.8  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12528  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0275989 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 190 aa  47.8  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1067  transcriptional regulator, TetR family  48 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.530116 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35780  TetR family regulatory protein  33.86 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4944  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 199 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0340  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 388 aa  48.1  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5032  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 199 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  30.25 
 
 		 207 aa  47.4  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3539  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 203 aa  47.8  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318561 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2995  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428403  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3394  transcriptional regulator, TetR family  45.9 
 
 		 220 aa  46.6  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.222962 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1071  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 240 aa  46.6  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457023 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>