259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_35780 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_35780  TetR family regulatory protein  100 
 
 		 205 aa  412  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3067  TetR family transcriptional regulator  69.68 
 
 		 199 aa  256  1e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2442  transcriptional regulator, TetR family  64.22 
 
 		 223 aa  256  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4161  putative transcriptional regulator  61.69 
 
 		 202 aa  241  6e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.674844  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48420  putative transcriptional regulator  63.54 
 
 		 202 aa  238  5e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0011363  normal  0.230392 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3535  TetR family transcriptional regulator  63.86 
 
 		 210 aa  229  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.926686  normal  0.288543 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4995  transcriptional regulator, TetR family  58.24 
 
 		 198 aa  220  9.999999999999999e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3641  transcriptional regulator, TetR family  56.91 
 
 		 197 aa  218  3e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.334684 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3539  TetR family transcriptional regulator  54.19 
 
 		 203 aa  216  1e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318561 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3073  TetR family transcriptional regulator  57.81 
 
 		 198 aa  214  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0121  regulatory protein, TetR  52.45 
 
 		 209 aa  213  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.602969 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0836  transcriptional regulator, TetR family  53.97 
 
 		 199 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2069  TetR family transcriptional regulator  56.16 
 
 		 198 aa  201  7e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19560  transcriptional regulator, tetR family  45.7 
 
 		 205 aa  167  1e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.186862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3389  transcriptional regulator, TetR family  42.08 
 
 		 187 aa  145  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0771  TetR family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 204 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 204 aa  61.2  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  36.54 
 
 		 271 aa  59.7  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  37.97 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 330 aa  57.4  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  33.94 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  37.7 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  35.51 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8610  putative transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 317 aa  55.5  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 		 218 aa  54.3  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  34.45 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 221 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 220 aa  53.9  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 227 aa  53.9  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  35.87 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1286  transcriptional regulator, TetR family  35.56 
 
 		 199 aa  53.1  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000123202 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  32.04 
 
 		 231 aa  53.1  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 		 211 aa  52.8  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  38.1 
 
 		 220 aa  52.4  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 211 aa  52.4  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  36.59 
 
 		 225 aa  52  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 224 aa  52  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1597  putative transcriptional regulator, TetR family  47.92 
 
 		 174 aa  52  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 216 aa  52  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  34.65 
 
 		 206 aa  52  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5623  putative transcriptional regulator, TetR family  28.82 
 
 		 180 aa  51.6  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118423  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17920  transcriptional regulator, tetR family  34 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.330701  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 224 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 224 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 224 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2468  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 198 aa  50.4  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  36.52 
 
 		 222 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3999  regulatory protein, TetR  39.02 
 
 		 258 aa  50.8  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163281  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 224 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 257 aa  50.8  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 218 aa  50.1  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  35.29 
 
 		 226 aa  50.4  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 224 aa  50.4  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3962  putative transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 		 194 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.545183  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 215 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0620  TetR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 193 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0633  TetR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 193 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0611  TetR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 193 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  43.4 
 
 		 220 aa  49.7  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3256  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 220 aa  49.3  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.757999  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 197 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  34.57 
 
 		 216 aa  49.3  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 197 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0340  transcriptional regulator, TetR family  34.41 
 
 		 388 aa  48.5  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0953  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 184 aa  48.9  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.712721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0885  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 220 aa  48.5  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.126652 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  43.28 
 
 		 230 aa  48.5  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 206 aa  48.5  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  24.26 
 
 		 221 aa  48.5  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 215 aa  48.1  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 206 aa  48.1  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2973  transcriptional regulator, TetR family  37.66 
 
 		 198 aa  48.1  0.00009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 212 aa  48.1  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0710  transcriptional regulator, TetR family  36.49 
 
 		 248 aa  47.8  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0658  TetR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 195 aa  47.8  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.609022  normal  0.929409 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7871  transcriptional regulator, TetR family  33.86 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.519364  normal  0.175428 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4944  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 199 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3540  TetR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 250 aa  47.4  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5032  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 199 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5325  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 199 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.586018  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0162  transcription regulator protein  36.84 
 
 		 233 aa  47  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.1146  normal  0.445023 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1792  regulatory protein, TetR  29.82 
 
 		 238 aa  47.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0286  TetR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 177 aa  47  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.945519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0041  TetR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 175 aa  47  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1005  transcriptional regulator, TetR family  31.09 
 
 		 218 aa  46.6  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1944  transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 		 205 aa  46.6  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00538978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1035  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 214 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1238  AcrR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 273 aa  46.6  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2095  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 222 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.112478 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8864  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 202 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0984  transcriptional regulator, TetR family  34.44 
 
 		 245 aa  47  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.50937  hitchhiker  0.00233885 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2172  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 		 199 aa  46.2  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 		 186 aa  46.6  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>