147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0885 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0885  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 220 aa  436  1e-121  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.126652 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1999  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 219 aa  91.3  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.897874 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3965  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 201 aa  88.6  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.396199  normal  0.986895 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2659  transcriptional regulator, TetR family  24.29 
 
 		 203 aa  80.1  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.144734  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6395  transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 		 222 aa  76.6  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.264791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5054  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 230 aa  77.4  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.699739 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1711  transcriptional regulator, TetR family  31.66 
 
 		 219 aa  77.4  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.418522  normal  0.678609 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1515  transcriptional regulator, TetR family  31.16 
 
 		 219 aa  75.5  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3458  transcriptional regulator, TetR family  29 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1637  transcriptional regulator, TetR family  42.65 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.890844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3501  TetR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.191946  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4865  TetR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3373  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5420  TetR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 202 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.66162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  34.67 
 
 		 220 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6222  transcriptional regulator, TetR family  35.37 
 
 		 186 aa  51.6  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.366462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1190  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 209 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.106163  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2972  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 207 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0850  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0204358 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3656  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 207 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.311417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2011  transcriptional regulator, TetR family  27.6 
 
 		 213 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.27798 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2973  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 198 aa  49.7  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4427  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 216 aa  50.1  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2933  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 209 aa  49.3  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35780  TetR family regulatory protein  29.35 
 
 		 205 aa  48.5  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0425  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 216 aa  48.5  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2681  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 209 aa  48.5  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.387724  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0865  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 211 aa  48.5  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2776  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 209 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376535  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1562  putative transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 194 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.196181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5646  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 233 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.176197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6361  transcriptional regulator, TetR family  30.68 
 
 		 229 aa  48.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.439154 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 200 aa  47.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1981  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 227 aa  47.4  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0412771  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8504  putative transcriptional regulator, TetR family  38.6 
 
 		 197 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4626  transcriptional regulator, TetR family  48.98 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  hitchhiker  0.00755279 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4463  transcriptional regulator, TetR family  34.85 
 
 		 198 aa  46.6  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3533  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 211 aa  47  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1353  normal  0.182077 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0675  regulatory protein, TetR  35.14 
 
 		 220 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3967  transcriptional regulator, TetR family  35.9 
 
 		 213 aa  46.2  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0630357 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4003  transcriptional regulator, TetR family  34.94 
 
 		 242 aa  46.2  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4343  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 225 aa  46.2  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0349599  decreased coverage  0.000000750918 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0472  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 206 aa  45.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.530719 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3853  transcriptional regulator, TetR family  35.9 
 
 		 213 aa  46.2  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.26442  normal  0.765649 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3958  transcriptional regulator, TetR family  34.94 
 
 		 242 aa  46.2  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1169  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 214 aa  46.2  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4887  putative TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 191 aa  45.8  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0109337  normal  0.0985913 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3205  TetR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 197 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3267  TetR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 197 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0261097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3216  TetR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 197 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.278224  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5928  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 215 aa  45.8  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5297  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 197 aa  45.4  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.755351  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1434  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 225 aa  45.4  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.185065  normal  0.789444 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2967  regulatory protein, TetR  42.59 
 
 		 205 aa  45.4  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3475  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 197 aa  45.4  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.213074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3699  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 220 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4065  transcriptional regulator, TetR family  21.66 
 
 		 208 aa  45.1  0.0008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2732  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 222 aa  45.1  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3330  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 225 aa  45.1  0.0009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648103  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  38.03 
 
 		 230 aa  45.1  0.0009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0594  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 247 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0201579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8304  transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 223 aa  45.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.505381  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3587  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 206 aa  45.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2606  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 206 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.613239  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0499  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 206 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2285  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 213 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4161  putative transcriptional regulator  31.25 
 
 		 202 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.674844  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2556  transcriptional regulator, TetR family  43.48 
 
 		 208 aa  44.3  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489141  normal  0.182844 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3962  putative transcriptional regulator, TetR family  45.1 
 
 		 194 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.545183  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4828  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 207 aa  45.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1933  AcrR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 243 aa  44.7  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.189914  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4014  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 225 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0771  transcriptional regulator, TetR family  35.82 
 
 		 218 aa  43.9  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.353788  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2807  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 214 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0303  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 200 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.130246 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 241 aa  43.9  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1293  TetR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 199 aa  43.5  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0031  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 214 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1735  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 214 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3169  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 214 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0634  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 220 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000435144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4105  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 		 232 aa  43.9  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3240  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 209 aa  43.9  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0639  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 220 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.307578  hitchhiker  0.000146714 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4569  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 220 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000245113  hitchhiker  0.00602594 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3614  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 218 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0683  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 216 aa  43.5  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000557469  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38090  TetR-family transcriptional regulatory protein  36.84 
 
 		 221 aa  43.1  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0395776  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1823  hypothetical protein  23.89 
 
 		 255 aa  43.1  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0181821  decreased coverage  0.0000000000816983 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3603  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 214 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3628  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 214 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1270  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 208 aa  43.1  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0484434 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3239  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 200 aa  43.1  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.845515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6912  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 236 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.830717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 222 aa  43.5  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4218  transcriptional regulator, TetR family  30.08 
 
 		 208 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566415  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1864  transcriptional regulator, TetR family  33.82 
 
 		 218 aa  43.1  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2832  transcriptional regulator, TetR family  34 
 
 		 210 aa  43.1  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>