146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5054 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5054  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 230 aa  474  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.699739 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6395  transcriptional regulator, TetR family  66.06 
 
 		 222 aa  329  2e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.264791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3458  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 213 aa  134  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2659  transcriptional regulator, TetR family  32.04 
 
 		 203 aa  125  6e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.144734  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3965  transcriptional regulator, TetR family  31.31 
 
 		 201 aa  97.4  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.396199  normal  0.986895 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0885  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 220 aa  77.4  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.126652 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1999  TetR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.897874 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1711  transcriptional regulator, TetR family  27.32 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.418522  normal  0.678609 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1515  transcriptional regulator, TetR family  26.77 
 
 		 219 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 197 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  33.75 
 
 		 220 aa  52.4  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  34.67 
 
 		 207 aa  51.6  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  37.68 
 
 		 218 aa  50.1  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2332  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 202 aa  49.7  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4301  transcriptional regulator, TetR family  23.88 
 
 		 221 aa  49.7  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 227 aa  49.3  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1637  transcriptional regulator, TetR family  38.98 
 
 		 193 aa  49.3  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.890844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14700  transcriptional regulator, TetR family  30.09 
 
 		 207 aa  49.3  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.73009e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6966  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 229 aa  48.9  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.182707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6530  transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 		 219 aa  48.9  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.051486 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  34.92 
 
 		 226 aa  48.9  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 197 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  36.54 
 
 		 211 aa  48.5  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  27.22 
 
 		 205 aa  48.5  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1946  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 191 aa  48.1  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.173435  hitchhiker  0.00972871 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0297  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 203 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0512572 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 211 aa  48.1  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 200 aa  48.1  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3809  transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 		 224 aa  47.8  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 		 221 aa  48.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 206 aa  48.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3067  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 199 aa  47.4  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  42.19 
 
 		 209 aa  47.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1862  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 213 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.349014  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3508  regulatory protein, TetR  32.76 
 
 		 200 aa  46.6  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0988004  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 215 aa  46.6  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 330 aa  47  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0994  transcriptional regulator, TetR family  46 
 
 		 214 aa  46.2  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146386  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  51.35 
 
 		 271 aa  46.2  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8610  putative transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 317 aa  46.2  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 200 aa  46.2  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4006  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 237 aa  46.2  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0583  regulatory protein, TetR  24.42 
 
 		 197 aa  46.2  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38900  transcriptional regulator, TetR family  27.33 
 
 		 226 aa  45.8  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.749862  normal  0.429215 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8504  putative transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 197 aa  46.2  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 220 aa  45.8  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2619  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 192 aa  45.8  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2973  transcriptional regulator, TetR family  29.69 
 
 		 198 aa  45.8  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2933  transcriptional regulator, TetR family  21.54 
 
 		 209 aa  45.4  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4234  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 192 aa  45.4  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0811126  normal  0.324857 
 
 
-
 
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 125 aa  45.4  0.0008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0590  transcriptional regulator, TetR family  34.33 
 
 		 189 aa  45.1  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2217  transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 		 199 aa  45.4  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1048  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 210 aa  44.7  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4135  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 194 aa  45.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1016  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 210 aa  44.3  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00988275  normal  0.688061 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2589  transcriptional regulator BetI  37.25 
 
 		 196 aa  45.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  34 
 
 		 231 aa  44.7  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 324 aa  44.7  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0015  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 214 aa  45.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4577  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 247 aa  45.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 193 aa  44.7  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5646  TetR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 233 aa  44.7  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.176197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 220 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4577  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 196 aa  44.7  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.957651 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0175  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 203 aa  44.3  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 218 aa  44.3  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0411  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 196 aa  43.5  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.3269  hitchhiker  0.00212654 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3101  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 230 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.359837  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3117  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 248 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2081  transcriptional regulator, TetR family  43.4 
 
 		 193 aa  43.9  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.586313 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0865  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 211 aa  43.9  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2592  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000712719  hitchhiker  0.00165626 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3241  TetR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 221 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6292  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 210 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1238  AcrR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 273 aa  44.3  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5028  transcriptional regulator, TetR family  43.14 
 
 		 194 aa  44.3  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1944  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 205 aa  43.1  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00538978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3058  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 209 aa  43.1  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.765793  normal  0.0466418 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3411  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 206 aa  43.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945663  normal  0.0722688 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0479  TetR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 207 aa  43.5  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1936  transcriptional regulator, TetR family  24.64 
 
 		 193 aa  43.5  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5796  transcriptional regulator, TetR family  39.22 
 
 		 207 aa  43.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0048122 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5045  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 198 aa  43.5  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3413  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 246 aa  43.5  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38090  TetR-family transcriptional regulatory protein  36.36 
 
 		 221 aa  43.5  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0395776  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6699  transcriptional regulator, TetR family  39.22 
 
 		 207 aa  43.5  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.678516  normal  0.427356 
 
 
-
 
NC_003296  RS01891  transcription regulator protein  29.05 
 
 		 219 aa  43.1  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0139537  normal  0.638618 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2276  TetR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 403 aa  42.7  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.276985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1674  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 192 aa  43.1  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.344236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 225 aa  43.1  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1993  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 210 aa  42.7  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209055  normal  0.134866 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3598  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 227 aa  42.7  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646734  normal  0.699465 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2226  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 223 aa  43.1  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.407434  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3271  transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 201 aa  42.7  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.377871  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 208 aa  42.7  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>