230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2659 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2659  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 203 aa  409  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.144734  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6395  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 222 aa  139  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.264791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5054  transcriptional regulator, TetR family  32.04 
 
 		 230 aa  125  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.699739 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3458  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 		 213 aa  87  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0885  TetR family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 220 aa  80.1  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.126652 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1999  TetR family transcriptional regulator  23.12 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.897874 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3965  transcriptional regulator, TetR family  24.87 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.396199  normal  0.986895 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3373  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2933  transcriptional regulator, TetR family  28.99 
 
 		 209 aa  52.4  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2556  putative transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.596771  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3240  TetR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1711  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 219 aa  50.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.418522  normal  0.678609 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2972  TetR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0716  TetR family transcriptional regulator  23.9 
 
 		 223 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0951056 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  39.62 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 125 aa  49.3  0.00004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3229  putative transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 		 206 aa  49.3  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.446849 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 206 aa  49.3  0.00004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  37.74 
 
 		 220 aa  48.9  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0331  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 195 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0341  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 195 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 211 aa  48.9  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03010  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 222 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000381229 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 231 aa  48.5  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0320  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 195 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14700  transcriptional regulator, TetR family  49.09 
 
 		 207 aa  48.5  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.73009e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0092  transcriptional regulator, TetR family  25.17 
 
 		 207 aa  47.4  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00302716  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 238 aa  47.8  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1515  transcriptional regulator, TetR family  38.33 
 
 		 219 aa  47.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0439  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 180 aa  47.4  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0355  transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  35.82 
 
 		 271 aa  47.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7226  putative transcriptional regulator, TetR family  23.26 
 
 		 209 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.373834 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2226  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 223 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.145555  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0584  transcriptional regulator, TetR family  32.08 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2249  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 227 aa  46.6  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.111246  normal  0.0445772 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8504  putative transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 197 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1812  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 213 aa  46.6  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.436202  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6912  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 236 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.830717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 216 aa  46.2  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 238 aa  46.6  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03760  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 201 aa  46.2  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.599281  normal  0.484799 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2401  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 223 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.853887 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  37.74 
 
 		 221 aa  46.2  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0194  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 193 aa  46.2  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1516  transcriptional regulator BetI  38.46 
 
 		 197 aa  45.8  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.026336  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0873  TetR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 186 aa  45.8  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5257  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 194 aa  45.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.570583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2249  transcriptional regulator, TetR family  26.47 
 
 		 228 aa  45.8  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115177  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1637  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 193 aa  45.4  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.890844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2681  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 209 aa  45.4  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.387724  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 208 aa  45.4  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4105  transcriptional regulator, TetR family  35.82 
 
 		 232 aa  45.8  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2306  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 189 aa  45.4  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 225 aa  45.4  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3527  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 227 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0655225  normal  0.540257 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0180  TetR/AcrR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 193 aa  45.4  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0296493  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0183  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 193 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2776  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 209 aa  45.4  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376535  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4466  transcriptional regulator, TetR family  29.2 
 
 		 204 aa  45.4  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575375  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1190  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 209 aa  45.1  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.106163  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  35.85 
 
 		 218 aa  45.4  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4918  TetR family transcriptional regulator  24.4 
 
 		 208 aa  45.1  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.141388  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4186  TetR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 195 aa  45.4  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5007  TetR family transcriptional regulator  24.4 
 
 		 208 aa  45.1  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.324898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2247  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 227 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0212  transcription regulator TetR/AcrR family protein  30.91 
 
 		 193 aa  45.1  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1381  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 213 aa  45.1  0.0007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.637245  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5646  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 233 aa  45.1  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.176197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 		 206 aa  45.1  0.0007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9154  putative transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 226 aa  45.1  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4104  TetR family transcriptional regulator  20.47 
 
 		 438 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1574  regulatory protein, TetR  36.96 
 
 		 200 aa  45.1  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.979673 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 208 aa  45.1  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2722  TetR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 237 aa  45.1  0.0008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 218 aa  45.1  0.0008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5300  TetR family transcriptional regulator  24.4 
 
 		 208 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.104655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  23.29 
 
 		 226 aa  45.1  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0136  transcriptional regulator, TetR family  37.74 
 
 		 243 aa  45.1  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.30147  normal  0.0856805 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1448  transcriptional regulator, TetR family  39.62 
 
 		 182 aa  45.1  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0355171  normal  0.193745 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  29.51 
 
 		 219 aa  45.1  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 222 aa  44.7  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4006  transcriptional regulator, TetR family  45.65 
 
 		 202 aa  44.7  0.0009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2741  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 215 aa  44.7  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 194 aa  44.7  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3936  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 197 aa  44.3  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0494347  normal  0.157135 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0810  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 268 aa  44.3  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0106  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 227 aa  44.3  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1335  transcriptional regulator, TetR family  26.98 
 
 		 194 aa  44.7  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5169  TetR family transcriptional regulator  21.61 
 
 		 196 aa  44.3  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.767063 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3842  transcriptional regulator BetI  32.69 
 
 		 197 aa  44.3  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  33.96 
 
 		 200 aa  44.7  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1338  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 213 aa  44.3  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00412049  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3008  putative transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 203 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0328  putative transcriptional regulator  25.26 
 
 		 222 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4488  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 190 aa  44.3  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.14916  normal  0.0536152 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4427  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 216 aa  44.7  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0706  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 210 aa  44.3  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.25715 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>