90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1381 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR1381  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 213 aa  428  1e-119  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.637245  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1338  TetR family transcriptional regulator  99.06 
 
 		 213 aa  422  1e-117  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00412049  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1812  TetR family transcriptional regulator  90.61 
 
 		 213 aa  390  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.436202  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5326  TetR family transcriptional regulator  55.22 
 
 		 218 aa  208  4e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.256565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0360  transcriptional regulator, TetR family  56.72 
 
 		 215 aa  199  3e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2493  transcriptional regulator, TetR family  54.31 
 
 		 221 aa  194  8.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.464185 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2750  transcriptional regulator, TetR family  53.81 
 
 		 216 aa  193  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.622504 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1963  TetR family transcriptional regulator  53.54 
 
 		 215 aa  192  3e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.538053  normal  0.517781 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0328  transcriptional regulator, TetR family  54.59 
 
 		 215 aa  190  1e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.478904  normal  0.0897822 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0284  regulatory protein TetR  54.59 
 
 		 215 aa  190  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2780  transcriptional regulator TetR family  52.26 
 
 		 212 aa  188  7e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1495  TetR family transcriptional regulator  49.03 
 
 		 219 aa  187  1e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.12027  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0705  regulatory protein, TetR  27 
 
 		 211 aa  85.1  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0406  transcriptional regulator, TetR family  27.47 
 
 		 206 aa  77  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0181245  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0097  TetR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 207 aa  71.6  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 208 aa  67  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0518509 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 234 aa  61.6  0.000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1511  TetR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 212 aa  58.2  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  26.79 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.6413 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2432  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 220 aa  54.3  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0652024 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  27.41 
 
 		 220 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  27.41 
 
 		 220 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1447  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 214 aa  52  0.000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.268108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5954  transcriptional regulator TetR family  26.94 
 
 		 219 aa  51.6  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2443  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 		 237 aa  50.4  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0506357 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0667  TetR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000042492  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  29.02 
 
 		 218 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4201  hypothetical protein  28.17 
 
 		 201 aa  49.7  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4208  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 213 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.826614 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3999  regulatory protein, TetR  31.4 
 
 		 258 aa  49.3  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163281  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 257 aa  48.9  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 210 aa  48.9  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1515  TetR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 213 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8304  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 223 aa  48.5  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.505381  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0509  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 191 aa  48.1  0.00009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  23.98 
 
 		 220 aa  48.1  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  25.83 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1516  transcriptional regulator, TetR family  32.84 
 
 		 203 aa  47.4  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0747  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4103  TetR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 209 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1119  TetR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 213 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0758  transcriptional regulator, TetR family  32.08 
 
 		 229 aa  46.6  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.685577  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2049  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 198 aa  45.8  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  24.08 
 
 		 212 aa  45.8  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 208 aa  45.8  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6001  transcriptional regulator, TetR family  22.83 
 
 		 224 aa  45.4  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.903994  normal  0.20153 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1536  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 217 aa  45.4  0.0006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000773904  normal  0.689031 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0093  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 229 aa  45.4  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.247373  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2659  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 203 aa  45.1  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.144734  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  26.7 
 
 		 215 aa  45.4  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1053  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 255 aa  45.1  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.65463  normal  0.0546108 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16280  putative transcriptional regulator  27.67 
 
 		 213 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.450776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4942  transcriptional regulator, TetR family  36.47 
 
 		 247 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0380  transcriptional regulator, TetR family  32.86 
 
 		 216 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.50033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7871  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 212 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.519364  normal  0.175428 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003358  transcriptional regulator  23.04 
 
 		 251 aa  44.3  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.433364  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3129  transcriptional regulator, TetR family  37.88 
 
 		 191 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3066  transcriptional regulator, TetR family  27.11 
 
 		 229 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7149  transcriptional regulator, TetR family  24.77 
 
 		 224 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5356  transcriptional regulator, TetR family  29.26 
 
 		 201 aa  44.3  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2962  transcriptional regulator, TetR family  25.83 
 
 		 229 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5065  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 202 aa  43.5  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174952  normal  0.51505 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 210 aa  43.9  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1884  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 189 aa  44.3  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.652086  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0136  transcriptional regulator, TetR family  44.68 
 
 		 243 aa  43.9  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.30147  normal  0.0856805 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1019  TetR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 200 aa  43.9  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2256  TetR family transcriptional regulator  23.43 
 
 		 207 aa  43.1  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0681818  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2548  TetR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 236 aa  43.1  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000944763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0400  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 205 aa  43.1  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0550  TetR family transcriptional regulator  23.78 
 
 		 283 aa  43.5  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 209 aa  43.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2498  transcriptional regulator, TetR family  37.88 
 
 		 184 aa  43.5  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0092  transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 210 aa  42.7  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.367108  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0073  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 210 aa  42.7  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  22.56 
 
 		 231 aa  42.7  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1456  transcriptional regulator, TetR family  26.6 
 
 		 211 aa  42.4  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  27.01 
 
 		 226 aa  42.4  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4427  TetR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 216 aa  42  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  25.45 
 
 		 226 aa  42  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1789  TetR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 210 aa  42  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.484582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1869  TetR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 215 aa  42  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2192  transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 		 191 aa  42  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0202  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 186 aa  42  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1400  putative transcriptional regulator  28.69 
 
 		 213 aa  41.6  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48420  putative transcriptional regulator  39.44 
 
 		 202 aa  41.6  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0011363  normal  0.230392 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 210 aa  41.6  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>