104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2493 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2493  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 221 aa  441  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.464185 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2750  transcriptional regulator, TetR family  99.07 
 
 		 216 aa  429  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.622504 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2780  transcriptional regulator TetR family  71.77 
 
 		 212 aa  300  1e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1963  TetR family transcriptional regulator  71.7 
 
 		 215 aa  284  5.999999999999999e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.538053  normal  0.517781 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1495  TetR family transcriptional regulator  66.33 
 
 		 219 aa  249  2e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.12027  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1338  TetR family transcriptional regulator  54.82 
 
 		 213 aa  197  1.0000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00412049  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1812  TetR family transcriptional regulator  53.81 
 
 		 213 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.436202  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1381  TetR family transcriptional regulator  54.31 
 
 		 213 aa  194  9e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.637245  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5326  TetR family transcriptional regulator  46.8 
 
 		 218 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.256565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0360  transcriptional regulator, TetR family  46.08 
 
 		 215 aa  150  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0284  regulatory protein TetR  43.22 
 
 		 215 aa  148  6e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0328  transcriptional regulator, TetR family  43.22 
 
 		 215 aa  147  8e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.478904  normal  0.0897822 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0406  transcriptional regulator, TetR family  26.29 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0181245  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 212 aa  68.2  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0097  TetR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  27.6 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4201  hypothetical protein  22.56 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0705  regulatory protein, TetR  27.59 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  31.22 
 
 		 218 aa  58.2  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0496  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 202 aa  54.7  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 216 aa  53.5  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.6413 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4208  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.826614 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1515  TetR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 213 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  24.75 
 
 		 207 aa  53.1  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  28.79 
 
 		 222 aa  53.5  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0509  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 191 aa  52.8  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003358  transcriptional regulator  23.83 
 
 		 251 aa  52.8  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.433364  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  23.33 
 
 		 208 aa  52.4  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0518509 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1119  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 213 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 211 aa  52.4  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1276  transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 		 214 aa  51.6  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 257 aa  51.2  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0570  TetR family transcriptional regulator  24.63 
 
 		 209 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 208 aa  50.8  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4103  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 209 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2432  transcriptional regulator, TetR family  25.39 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0652024 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1641  transcriptional regulator, TetR family protein  22.05 
 
 		 145 aa  49.3  0.00004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.216203  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  26.83 
 
 		 226 aa  49.7  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8304  transcriptional regulator, TetR family  28.16 
 
 		 223 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.505381  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6667  TetR family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 217 aa  48.5  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.33995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  22.61 
 
 		 234 aa  47.8  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0202  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 186 aa  47  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  21.24 
 
 		 217 aa  47  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  24.38 
 
 		 226 aa  47.8  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1456  transcriptional regulator, TetR family  26.26 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4942  transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 		 247 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5823  TetR family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 217 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6188  TetR family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 217 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.301672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4255  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 216 aa  46.2  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.323719 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2443  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 237 aa  46.6  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0506357 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0519  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 220 aa  46.2  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0136  transcriptional regulator, TetR family  44 
 
 		 243 aa  46.2  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.30147  normal  0.0856805 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2537  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 231 aa  45.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16280  putative transcriptional regulator  29.03 
 
 		 213 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.450776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0093  TetR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 229 aa  45.4  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.247373  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0300  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 214 aa  45.4  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.948594  normal  0.297799 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1400  putative transcriptional regulator  28.23 
 
 		 213 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  24.5 
 
 		 211 aa  44.7  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  24.87 
 
 		 226 aa  44.3  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0120  transcription regulator protein  22.83 
 
 		 209 aa  44.7  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1019  TetR family transcriptional regulator  22.89 
 
 		 200 aa  44.7  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11588  regulatory protein  38.89 
 
 		 202 aa  44.7  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.8751e-36  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  26 
 
 		 244 aa  44.7  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0758  transcriptional regulator, TetR family  38 
 
 		 229 aa  44.7  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.685577  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0464  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 215 aa  44.7  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3092  transcriptional regulator, TetR family  34.44 
 
 		 185 aa  43.9  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0725563 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2256  TetR family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 207 aa  44.3  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0681818  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2049  TetR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 198 aa  43.9  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0050  TetR family transcriptional regulator  20.9 
 
 		 210 aa  44.3  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0400  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1053  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 255 aa  43.9  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.65463  normal  0.0546108 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1844  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 242 aa  44.3  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000808903 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  25.66 
 
 		 200 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  25.66 
 
 		 200 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0743  TetR family transcriptional regulator  23.33 
 
 		 216 aa  43.1  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 206 aa  43.1  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5954  transcriptional regulator TetR family  26.06 
 
 		 219 aa  43.5  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1516  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 203 aa  43.1  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  30.7 
 
 		 205 aa  43.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0547  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 249 aa  43.1  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2548  TetR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 236 aa  42.7  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000944763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4245  regulatory protein, TetR  37.25 
 
 		 221 aa  42.7  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0073  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 210 aa  42.7  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0092  transcriptional regulator, TetR family  37.1 
 
 		 210 aa  42.7  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.367108  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  28.86 
 
 		 208 aa  42.7  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2498  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 184 aa  42.4  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  39.71 
 
 		 207 aa  42.7  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1789  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 210 aa  42.4  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.484582  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 192 aa  42  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6158  TetR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 212 aa  42  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.488727  normal  0.104212 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0552  transcriptional regulator, TetR family  26.02 
 
 		 208 aa  42  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 191 aa  42  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3999  regulatory protein, TetR  35.82 
 
 		 258 aa  42  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163281  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 212 aa  41.6  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  24.12 
 
 		 215 aa  42  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21800  transcriptional regulator  32.79 
 
 		 265 aa  42  0.008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.391718  normal  0.223847 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5159  transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 202 aa  42  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1825  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 198 aa  41.6  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1884  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 189 aa  41.6  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.652086  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>