More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3066 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3066  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 229 aa  447  1e-125  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2962  transcriptional regulator, TetR family  94.32 
 
 		 229 aa  357  6e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2875  TetR family transcriptional regulator  85.57 
 
 		 219 aa  329  3e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 208 aa  85.1  8e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0406  transcriptional regulator, TetR family  33.67 
 
 		 206 aa  85.1  9e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0181245  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0097  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 207 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0705  regulatory protein, TetR  34.92 
 
 		 211 aa  82  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 		 209 aa  70.9  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  29.34 
 
 		 226 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1276  transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 		 214 aa  69.3  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3994  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 225 aa  69.7  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0106  transcriptional regulator  30.77 
 
 		 207 aa  68.2  0.00000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 		 222 aa  67  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4516  transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4487  transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0570  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 218 aa  65.9  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  29.19 
 
 		 217 aa  65.9  0.0000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 203 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6001  transcriptional regulator, TetR family  29.25 
 
 		 224 aa  65.5  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.903994  normal  0.20153 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1511  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 225 aa  65.5  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1400  putative transcriptional regulator  33.71 
 
 		 213 aa  65.5  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0552  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0519  TetR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 206 aa  64.7  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7149  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1279  regulatory protein, TetR  29.23 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.211303  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3407  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0155576  normal  0.84746 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16280  putative transcriptional regulator  33.91 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.450776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2329  TetR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 		 226 aa  62  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 206 aa  62  0.000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1791  regulatory protein, TetR  31.33 
 
 		 246 aa  62  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00350194  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  27.05 
 
 		 226 aa  61.6  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  28.64 
 
 		 220 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 214 aa  61.6  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
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NC_011666  Msil_2443  transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 		 237 aa  61.2  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0506357 
 
 
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NC_008751  Dvul_0496  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 202 aa  61.2  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.250936 
 
 
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NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  28.64 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  28.29 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4201  hypothetical protein  25 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2972  TetR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419953  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 244 aa  59.3  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1391  transcriptional regulator, TetR family  27.07 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5999  transcriptional regulator, TetR family  36.97 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2986  TetR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5925  transcriptional regulator, TetR family  36.47 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1019  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3130  TetR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  24.64 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2732  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1979  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 257 aa  58.5  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2432  transcriptional regulator, TetR family  34.75 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0652024 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  27.45 
 
 		 216 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3317  TetR family transcriptional regulator  41.23 
 
 		 214 aa  58.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.305506  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  27.36 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4044  TetR family transcriptional regulator  41.23 
 
 		 214 aa  58.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  28.19 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4680  transcriptional regulator, TetR family  32.77 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0050  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1869  TetR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4265  TetR/AcrR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 207 aa  57  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1443  transcriptional regulator, TetR family  30.72 
 
 		 204 aa  57  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79888  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2507  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.881075  normal  0.842438 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0299  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3880  transcriptional regulator, TetR family  30.2 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.133053 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3277  TetR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6137  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150449  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1981  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0412771  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  31.36 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  31.36 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1709  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.922562  normal  1 
 
 
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NC_009428  Rsph17025_3126  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.333802  hitchhiker  0.00150199 
 
 
-
 
NC_003296  RS05643  putative transcription regulator protein  32.76 
 
 		 233 aa  55.1  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6489  transcriptional regulator, TetR family  30.98 
 
 		 215 aa  54.7  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013456  VEA_003358  transcriptional regulator  23.96 
 
 		 251 aa  54.3  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.433364  n/a   
 
 
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NC_007333  Tfu_1467  hypothetical protein  30.71 
 
 		 213 aa  54.3  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.165444  n/a   
 
 
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NC_013521  Sked_18820  transcriptional regulator  31.47 
 
 		 225 aa  54.3  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.348199  normal  0.343375 
 
 
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NC_013947  Snas_5077  transcriptional regulator, TetR family  31.44 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  29.02 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
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NC_010581  Bind_2027  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 208 aa  54.3  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal  1 
 
 
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NC_010501  PputW619_4103  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010506  Swoo_0450  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 201 aa  54.3  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007406  Nwi_2285  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 233 aa  53.5  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.522027  normal  0.380806 
 
 
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NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
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