151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5326 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5326  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 218 aa  436  1e-121  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.256565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0360  transcriptional regulator, TetR family  82.27 
 
 		 215 aa  304  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0284  regulatory protein TetR  81.68 
 
 		 215 aa  303  9.000000000000001e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0328  transcriptional regulator, TetR family  80.58 
 
 		 215 aa  300  1e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.478904  normal  0.0897822 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1812  TetR family transcriptional regulator  55.77 
 
 		 213 aa  214  9e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.436202  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1338  TetR family transcriptional regulator  55.22 
 
 		 213 aa  210  1e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00412049  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1381  TetR family transcriptional regulator  55.22 
 
 		 213 aa  208  4e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.637245  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2750  transcriptional regulator, TetR family  46.8 
 
 		 216 aa  162  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.622504 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2493  transcriptional regulator, TetR family  46.8 
 
 		 221 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.464185 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1963  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 215 aa  162  5.0000000000000005e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.538053  normal  0.517781 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2780  transcriptional regulator TetR family  46.94 
 
 		 212 aa  157  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1495  TetR family transcriptional regulator  44.06 
 
 		 219 aa  148  5e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.12027  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2432  transcriptional regulator, TetR family  35.84 
 
 		 220 aa  70.9  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0652024 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  30.81 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0705  regulatory protein, TetR  28 
 
 		 211 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.6413 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0406  transcriptional regulator, TetR family  26.4 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0181245  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0097  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  35.5 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2027  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  31.64 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0518509 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2443  transcriptional regulator, TetR family  28.91 
 
 		 237 aa  60.8  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0506357 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1443  transcriptional regulator, TetR family  27.92 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79888  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  26.13 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  29.5 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2606  transcriptional regulator, TetR family  28.78 
 
 		 218 aa  57  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193859  normal  0.0512709 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  27.89 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5065  TetR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174952  normal  0.51505 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5949  transcriptional regulator TetR family  28.74 
 
 		 250 aa  56.6  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4487  transcriptional regulator, TetR family  27.09 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4516  transcriptional regulator, TetR family  27.09 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0570  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0519  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 220 aa  53.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0050  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00902  transcription regulator protein  26.37 
 
 		 209 aa  53.1  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806346  normal  0.603909 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  25.26 
 
 		 226 aa  52.8  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3994  TetR family transcriptional regulator  25.43 
 
 		 225 aa  52.4  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 211 aa  52  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0552  transcriptional regulator, TetR family  29.53 
 
 		 208 aa  52  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 206 aa  52  0.000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1515  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 213 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1993  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 210 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209055  normal  0.134866 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  26.63 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 257 aa  50.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 208 aa  50.1  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  26.89 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1544  TetR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 219 aa  50.1  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4208  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 213 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.826614 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003358  transcriptional regulator  23.86 
 
 		 251 aa  49.3  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.433364  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1981  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 227 aa  49.3  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0412771  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1119  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 213 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  24.86 
 
 		 224 aa  48.9  0.00006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 209 aa  48.9  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 234 aa  48.9  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5246  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 192 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1447  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 214 aa  48.5  0.00007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.268108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00480  transcriptional regulator TetR/acrR family  30.47 
 
 		 198 aa  48.5  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  23.32 
 
 		 217 aa  48.5  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3129  transcriptional regulator, TetR family  31.62 
 
 		 191 aa  48.1  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6292  TetR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 210 aa  48.1  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4446  TetR family transcriptional regulator  25.63 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3058  TetR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 209 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.765793  normal  0.0466418 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2416  TetR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 192 aa  47.8  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.363583 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0743  TetR family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 216 aa  48.1  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3126  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.333802  hitchhiker  0.00150199 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  33.72 
 
 		 209 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1511  TetR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 225 aa  47.8  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4046  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 222 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933953  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1945  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 225 aa  47.8  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1121  TetR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0496337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  26.07 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1187  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 221 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.49367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2972  TetR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 216 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419953  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1400  putative transcriptional regulator  31.43 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6158  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.488727  normal  0.104212 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 206 aa  46.6  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3466  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 245 aa  46.6  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4103  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 209 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  29.46 
 
 		 200 aa  45.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 221 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  29.46 
 
 		 200 aa  45.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  26.07 
 
 		 220 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0123  transcriptional regulator, TetR family  24.02 
 
 		 224 aa  45.4  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0509  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 191 aa  45.4  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012912  Dd1591_1166  transcriptional regulator, TetR family  26.29 
 
 		 215 aa  45.4  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.522591  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1391  transcriptional regulator, TetR family  26.61 
 
 		 208 aa  45.8  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009665  Shew185_2986  TetR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 216 aa  45.4  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
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NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 210 aa  45.4  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_002977  MCA2256  TetR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 207 aa  45.4  0.0007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0681818  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_16280  putative transcriptional regulator  31.43 
 
 		 213 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.450776  normal  1 
 
 
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NC_009997  Sbal195_3130  TetR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 216 aa  45.4  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009338  Mflv_2374  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 191 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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