More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0509 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_0509  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 191 aa  382  1e-105  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 208 aa  68.6  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0705  regulatory protein, TetR  30.2 
 
 		 211 aa  68.2  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2780  transcriptional regulator TetR family  32.46 
 
 		 212 aa  65.9  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2493  transcriptional regulator, TetR family  31.35 
 
 		 221 aa  63.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.464185 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2750  transcriptional regulator, TetR family  31.35 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.622504 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1495  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.12027  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0097  TetR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 207 aa  61.2  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  30 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1963  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.538053  normal  0.517781 
 
 
-
 
NC_004310  BR1381  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.637245  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10241  TetR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000764085  normal  0.925652 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2256  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0681818  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4680  transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 		 236 aa  58.2  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8304  transcriptional regulator, TetR family  30.23 
 
 		 223 aa  58.2  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.505381  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 125 aa  58.2  0.00000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1812  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.436202  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3066  transcriptional regulator, TetR family  32.52 
 
 		 229 aa  57.8  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1338  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00412049  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  36.9 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0406  transcriptional regulator, TetR family  27.09 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0181245  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5326  TetR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.256565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0552  transcriptional regulator, TetR family  28.99 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  30.33 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  28.1 
 
 		 200 aa  54.7  0.0000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0236  TetR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 218 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0269868  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 206 aa  53.9  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0265  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 194 aa  54.3  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0246  TetR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 218 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0226  TetR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 218 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.131166 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2962  transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 		 229 aa  53.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1400  putative transcriptional regulator  26.74 
 
 		 213 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2875  TetR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 219 aa  53.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0424  transcriptional regulator, TetR family  29.52 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.315635  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  26.06 
 
 		 226 aa  52.8  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 206 aa  52.8  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0257  TetR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 209 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102981 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 257 aa  52.4  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0519  TetR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 220 aa  52  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 208 aa  52  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0518509 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1933  AcrR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 243 aa  52  0.000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.189914  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 210 aa  52  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 226 aa  51.6  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 199 aa  51.6  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  37.66 
 
 		 221 aa  51.2  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16280  putative transcriptional regulator  32.43 
 
 		 213 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.450776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1544  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 219 aa  51.2  0.000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2161  transcriptional regulator, TetR family  33.75 
 
 		 204 aa  51.2  0.000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0414  TetR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 215 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.462572  normal  0.0664832 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1121  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 210 aa  50.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0496337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 207 aa  50.4  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 208 aa  50.8  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2962  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 201 aa  50.4  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 210 aa  50.8  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1511  TetR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 225 aa  50.4  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3389  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 241 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  33.8 
 
 		 286 aa  50.1  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3352  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 241 aa  50.1  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000543998  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  29.17 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6485  regulatory protein, TetR  37.97 
 
 		 278 aa  50.4  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1119  TetR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 213 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2027  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 208 aa  50.1  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3198  TetR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 215 aa  50.1  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00193732  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1993  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209055  normal  0.134866 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3915  transcriptional regulator, TetR family  26.26 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3280  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0233273  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2666  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 213 aa  49.3  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 209 aa  49.3  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3612  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 197 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000248131  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4201  hypothetical protein  25.17 
 
 		 201 aa  49.7  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0284  regulatory protein TetR  30.66 
 
 		 215 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8103  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 223 aa  49.7  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0328  transcriptional regulator, TetR family  30.66 
 
 		 215 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.478904  normal  0.0897822 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3605  transcriptional regulator, TetR family  36.21 
 
 		 197 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.02462e-25 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3623  regulatory protein TetR  26.11 
 
 		 193 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.755125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3654  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 197 aa  49.7  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.786622  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0658  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 195 aa  49.7  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.609022  normal  0.929409 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0736  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 198 aa  49.3  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0360  transcriptional regulator, TetR family  34.81 
 
 		 215 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 330 aa  49.7  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 203 aa  49.3  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3297  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 98 aa  48.9  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.368335  normal  0.535572 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 197 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3621  transcriptional regulator, TetR family  36.21 
 
 		 197 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000265617  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2443  transcriptional regulator, TetR family  27.88 
 
 		 237 aa  48.9  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0506357 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 214 aa  48.5  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 227 aa  48.9  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0760  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 192 aa  48.9  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0913287  normal  0.16222 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>