More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_1884 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009667  Oant_1884  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 189 aa  390  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.652086  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2686  TetR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 181 aa  187  1e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.39833  hitchhiker  0.00361312 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47610  putative transcriptional regulator  46.89 
 
 		 186 aa  176  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4107  transcriptional regulator  45.76 
 
 		 187 aa  174  6e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.198218  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5492  transcriptional regulator, TetR family  43.5 
 
 		 177 aa  157  9e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56711 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2192  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 191 aa  152  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0286  TetR family transcriptional regulator  43.5 
 
 		 177 aa  129  3e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.945519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2157  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 187 aa  118  6e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.105803  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1451  transcriptional regulator, TetR family  36.02 
 
 		 428 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1840  transcriptional regulator, TetR family  36.02 
 
 		 415 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5697  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.949992  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6545  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129926 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6061  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.660328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0778  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5866  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 236 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6105  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 201 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.93473  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1991  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 188 aa  61.2  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2620  TetR family transcriptional regulator  23.56 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.727172  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0124  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 298 aa  60.8  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7518  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 185 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3009  transcriptional regulator, TetR family  34.56 
 
 		 187 aa  59.7  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3984  TetR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.567303 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3570  transcriptional regulator, TetR family  40.23 
 
 		 175 aa  59.3  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00083347  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2202  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4342  regulatory protein TetR  27.43 
 
 		 186 aa  58.5  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.525641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0872  TetR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 190 aa  58.2  0.00000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.956466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1320  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 203 aa  58.2  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.010897  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4711  transcriptional regulator, TetR family  27.43 
 
 		 186 aa  57.8  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.492793  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3260  transcriptional regulator, TetR family  33.09 
 
 		 187 aa  57.8  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4859  transcriptional regulator, TetR family  28.02 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.205859 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0439  transcriptional regulator, TetR family  23.73 
 
 		 180 aa  57.4  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1116  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 184 aa  57  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2113  transcriptional regulator, TetR family  32.74 
 
 		 182 aa  57  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2114  TetR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.328011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0730  TetR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5991  TetR family transcriptional regulator  52 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0553876 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2940  TetR family transcriptional regulator  23.96 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.333542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5831  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 227 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.626315 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4211  transcriptional regulator, TetR family  31.78 
 
 		 178 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.954356 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2511  transcriptional regulator, TetR family  25.7 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0981  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13730  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 181 aa  54.7  0.0000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.839534  normal  0.161793 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2783  TetR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 187 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0827  transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 		 179 aa  53.9  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.843783  normal  0.883408 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1743  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 244 aa  54.3  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.065917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2329  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 186 aa  54.3  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.148714  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2362  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 179 aa  53.5  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2973  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 198 aa  53.1  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0583  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8111  putative transcriptional regulator, TetR family  44.07 
 
 		 168 aa  52.4  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5494  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 141 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.769028  normal  0.39499 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3692  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 244 aa  52.4  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.674174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4165  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 232 aa  52.4  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367589  normal  0.612517 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5533  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 222 aa  52.4  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5162  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 193 aa  52  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.186575 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1153  TetR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 189 aa  52  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3701  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 178 aa  52  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.076632  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4404  TetR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 199 aa  52  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0114676  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_004310  BR1090  TetR family transcriptional regulator  22.54 
 
 		 188 aa  51.6  0.000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1051  TetR family transcriptional regulator  22.54 
 
 		 188 aa  51.6  0.000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0543  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 203 aa  51.2  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.889127 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01107  predicted DNA-binding transcriptional regulator  38.24 
 
 		 210 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2536  transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 		 210 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.018218  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01115  hypothetical protein  38.24 
 
 		 210 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2015  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 210 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000283926 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0880  transcriptional regulator, TetR family  44.12 
 
 		 181 aa  50.4  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  43.28 
 
 		 225 aa  50.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4918  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 208 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.141388  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2490  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 210 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000804693 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0763  TetR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 183 aa  50.8  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.673415  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5284  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 208 aa  50.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0597036  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5007  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 208 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.324898  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2560  putative transcription regulator protein  34.74 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0102643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1234  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 236 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2175  TetR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2956  transcriptional regulator, TetR family  43.64 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2212  transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 		 236 aa  50.1  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 193 aa  49.7  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1491  transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00556415 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1798  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 194 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1094  transcriptional regulator, TetR family  31.96 
 
 		 168 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2801  TetR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 189 aa  49.7  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1498  TetR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 189 aa  49.3  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.437225  normal  0.170332 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3475  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 229 aa  49.7  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.265474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3328  regulatory protein, TetR  37.31 
 
 		 187 aa  49.3  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1270  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 208 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0484434 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1067  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.530116 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5300  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 208 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.104655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 231 aa  48.9  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  30.88 
 
 		 203 aa  49.3  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3587  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 208 aa  49.3  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.997688  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1601  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 194 aa  48.5  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.105676  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2360  regulatory protein, TetR  29.03 
 
 		 190 aa  48.5  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.173305 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20280  transcriptional regulator, TetR family  45.16 
 
 		 213 aa  48.9  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.612683  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1553  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 194 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5711  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 245 aa  48.5  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1775  transcriptional regulator, TetR family  38.18 
 
 		 194 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1725  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 194 aa  48.5  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  34.48 
 
 		 224 aa  48.5  0.00006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1233  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 236 aa  48.5  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0636137  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>