278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5007 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4918  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 208 aa  424  1e-118  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.141388  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5007  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 208 aa  424  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.324898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5300  TetR family transcriptional regulator  99.52 
 
 		 208 aa  422  1e-117  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.104655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1270  TetR family transcriptional regulator  94.71 
 
 		 208 aa  401  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0484434 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7097  TetR family transcriptional regulator  51.71 
 
 		 206 aa  205  3e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7104  TetR family transcriptional regulator  50.25 
 
 		 206 aa  200  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0706  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 210 aa  194  7e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.25715 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0716  TetR family transcriptional regulator  44.27 
 
 		 223 aa  153  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0951056 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2972  TetR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 207 aa  151  5.9999999999999996e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3373  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 211 aa  150  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3239  TetR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 200 aa  150  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.845515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4140  TetR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 202 aa  128  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.355658  normal  0.167189 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2518  TetR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 209 aa  125  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.647945 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3240  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 209 aa  125  5e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3662  TetR family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 222 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3735  TetR family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 222 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.717952  normal  0.477586 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3675  TetR family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 222 aa  123  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0505657  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0596  TetR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 203 aa  120  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5169  TetR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 196 aa  119  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.767063 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4791  TetR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 200 aa  117  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.131161 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0331  TetR family transcriptional regulator  37.64 
 
 		 195 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0341  TetR family transcriptional regulator  37.64 
 
 		 195 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1588  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 194 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0320  TetR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 195 aa  111  6e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3220  putative regulatory protein  36.67 
 
 		 145 aa  82.8  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4463  transcriptional regulator, TetR family  42.19 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5603  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4264  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 189 aa  54.7  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9052  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 193 aa  54.7  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2194  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 188 aa  54.7  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.881672  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4909  TetR/AcrR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.194586  decreased coverage  0.000378041 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5714  TetR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 188 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.297365 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2917  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 218 aa  53.5  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5772  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 188 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6137  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 188 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.8739 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6619  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 188 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.634361  normal  0.119433 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5956  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 188 aa  53.1  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341434  normal  0.49488 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6065  TetR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 188 aa  52.8  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.340517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07900  hypothetical protein  30.66 
 
 		 186 aa  52.4  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.591065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1335  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 194 aa  52.4  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 206 aa  52  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4188  TetR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 211 aa  51.6  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1836  transcriptional regulator, TetR family  32.73 
 
 		 207 aa  51.6  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0359893  normal  0.350648 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7671  TetR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 188 aa  51.2  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.403599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0477  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 202 aa  50.8  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4291  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 189 aa  50.4  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1061  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 234 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.464557  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3421  transcriptional regulator, TetR family  24.14 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3407  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 178 aa  50.1  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3630  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 203 aa  50.8  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39380  TetR family regulatory protein  29.86 
 
 		 237 aa  50.8  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127312  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1884  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 189 aa  50.8  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.652086  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3567  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0246266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1344  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.592645 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1498  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 183 aa  49.7  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.548232  normal  0.295378 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4676  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 190 aa  49.7  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7851  transcriptional regulator, TetR family  26.88 
 
 		 165 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5390  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 189 aa  49.3  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0681  transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 		 167 aa  49.3  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0989844  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0541  transcriptional regulator, TetR family  39.44 
 
 		 192 aa  48.9  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.451413  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0744  regulatory protein TetR  38.89 
 
 		 191 aa  48.9  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6911  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 187 aa  48.9  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1502  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 241 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4896  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 187 aa  48.9  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3932  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 179 aa  48.9  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.324595  normal  0.0870807 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3267  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 187 aa  48.9  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 200 aa  48.5  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2959  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 204 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.878802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3003  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 204 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.384269 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3547  regulatory protein, TetR  29.76 
 
 		 187 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.473445  normal  0.21056 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3227  transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 		 204 aa  48.1  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3389  transcriptional regulator, TetR family  29.01 
 
 		 187 aa  48.5  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1497  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 238 aa  48.1  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.11015  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3179  regulatory protein, TetR  39.68 
 
 		 215 aa  48.1  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1102  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 234 aa  48.1  0.00009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4120  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 234 aa  48.1  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4225  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 234 aa  48.1  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2974  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 204 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.021189 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4433  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 187 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3845  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 197 aa  47.8  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4293  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 188 aa  47.4  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0268101  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2034  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 216 aa  48.1  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.480509  normal  0.0875613 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3637  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 228 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 245 aa  47.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2204  regulatory protein, TetR  30.34 
 
 		 235 aa  47  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0351  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 230 aa  47  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1087  transcriptional regulator, TetR family  27.66 
 
 		 215 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.9461  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6861  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 187 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0955  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6843  TetR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 236 aa  46.6  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.163651  normal  0.317864 
 
 
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NC_009436  Ent638_0042  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 219 aa  46.6  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664551  normal  0.814156 
 
 
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NC_011004  Rpal_2537  transcriptional regulator, TetR family  32.03 
 
 		 231 aa  46.2  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010581  Bind_0061  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 187 aa  46.2  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013165  Shel_27610  transcriptional regulator  37.88 
 
 		 221 aa  46.2  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.424005  normal  1 
 
 
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NC_013947  Snas_0096  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 186 aa  46.6  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009380  Strop_2892  regulatory protein, TetR  37.5 
 
 		 635 aa  45.8  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.794047  normal  0.565465 
 
 
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NC_007519  Dde_2537  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 87 aa  45.8  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008061  Bcen_5031  TetR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 258 aa  45.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0201359  n/a   
 
 
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NC_008543  Bcen2424_5829  TetR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 258 aa  45.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010552  BamMC406_3796  TetR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 275 aa  45.8  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
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