More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3701 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3701  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 178 aa  365  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.076632  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1320  TetR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 203 aa  102  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.010897  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4211  transcriptional regulator, TetR family  36.71 
 
 		 178 aa  99.8  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.954356 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0981  TetR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 178 aa  97.4  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2794  transcriptional regulator, TetR family  34.84 
 
 		 184 aa  94  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2114  TetR family transcriptional regulator  38.01 
 
 		 183 aa  94  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.328011  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2362  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 179 aa  91.3  6e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5248  transcriptional regulator, TetR family  39.87 
 
 		 178 aa  90.9  8e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1094  transcriptional regulator, TetR family  34.93 
 
 		 168 aa  90.5  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3570  transcriptional regulator, TetR family  34.86 
 
 		 175 aa  88.2  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00083347  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0622  transcriptional regulator, TetR family  29.82 
 
 		 181 aa  86.3  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1090  TetR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 188 aa  84.7  5e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1051  TetR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 188 aa  84.7  6e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5284  TetR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 208 aa  84.3  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0597036  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2175  TetR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 205 aa  80.1  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8111  putative transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 168 aa  78.2  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5492  transcriptional regulator, TetR family  32.12 
 
 		 177 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56711 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1114  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 186 aa  76.3  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.213128 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0052  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 188 aa  74.7  0.0000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.612692  normal  0.466149 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2686  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 181 aa  74.3  0.0000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.39833  hitchhiker  0.00361312 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1451  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 428 aa  73.9  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2157  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 187 aa  72.8  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.105803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5533  transcriptional regulator, TetR family  28.81 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2620  TetR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 194 aa  68.9  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.727172  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1840  transcriptional regulator, TetR family  31.1 
 
 		 415 aa  68.2  0.00000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2838  transcriptional regulator, TetR family  36.64 
 
 		 183 aa  67  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0953  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 184 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.712721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2801  TetR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 189 aa  64.3  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0286  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 177 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.945519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1498  TetR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 189 aa  63.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.437225  normal  0.170332 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47610  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 186 aa  62  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2002  TetR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 183 aa  60.5  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.700466  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4488  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.14916  normal  0.0536152 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4859  transcriptional regulator, TetR family  30.67 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.205859 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4107  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.198218  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2511  transcriptional regulator, TetR family  39.47 
 
 		 172 aa  58.5  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1153  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 189 aa  58.2  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23421  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0439  transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 		 180 aa  58.2  0.00000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2783  TetR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 187 aa  57.8  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 238 aa  57.8  0.00000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0012  putative AcrAB operon repressor transcription regulator protein  39.19 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.631075  normal  0.0464367 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4803  transcriptional regulator, TetR family  37.37 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.539659  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4711  transcriptional regulator, TetR family  51.79 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.492793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3439  TetR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3229  putative transcriptional regulator, TetR family  50.94 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.446849 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4342  regulatory protein TetR  51.79 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.525641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2113  transcriptional regulator, TetR family  42.19 
 
 		 182 aa  56.6  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2389  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.979129  normal  0.861655 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  52 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3421  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 223 aa  55.1  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.288907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0041  TetR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 192 aa  54.7  0.0000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3587  TetR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 242 aa  54.7  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37450  transcriptional regulator  29.37 
 
 		 177 aa  54.7  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0726232  normal  0.587989 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4006  regulatory protein, TetR  34.04 
 
 		 219 aa  54.3  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.722695  normal  0.0616898 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3744  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 223 aa  54.7  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3984  TetR family transcriptional regulator  50.88 
 
 		 191 aa  54.3  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.567303 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5257  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 194 aa  53.9  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.570583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3714  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0810  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 268 aa  53.9  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1515  regulatory protein, TetR  29.17 
 
 		 208 aa  53.1  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  48.15 
 
 		 203 aa  52.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0186  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 203 aa  53.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.625871  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0693  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 207 aa  53.1  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000831417  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2034  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 228 aa  52.8  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.743283  decreased coverage  0.000716409 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0947  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 205 aa  53.1  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0946183  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5991  TetR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 244 aa  52.8  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0553876 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1819  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 203 aa  53.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.191224 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4302  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 223 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1416  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 197 aa  52.4  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.305494  hitchhiker  0.0000141576 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3979  transcriptional regulator, TetR family  47.27 
 
 		 222 aa  52.4  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.318215  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2888  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 231 aa  52.4  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.465905  normal  0.0499957 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1116  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 184 aa  52.4  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4404  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 199 aa  52  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0114676  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0502  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 221 aa  52  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2426  TetR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 205 aa  52  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3407  transcriptional regulator, TetR family  28.85 
 
 		 178 aa  52  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 210 aa  52.4  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4614  transcriptional regulator, TetR family  24.69 
 
 		 191 aa  51.6  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3096  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 202 aa  51.6  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0203472  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2349  TetR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 357 aa  51.6  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00426882  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1884  TetR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 189 aa  51.6  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.652086  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0929  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 180 aa  52  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0615031  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2205  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 202 aa  52  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270822 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2560  putative transcription regulator protein  30 
 
 		 209 aa  51.6  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0102643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 216 aa  51.6  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2546  TetR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 213 aa  51.6  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.768933 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2192  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 191 aa  51.2  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0170  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 192 aa  51.2  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652591  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3009  transcriptional regulator, TetR family  29.76 
 
 		 187 aa  50.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1601  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 194 aa  50.4  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.105676  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0827  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 179 aa  50.4  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.843783  normal  0.883408 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1553  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 194 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1941  transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 		 189 aa  50.4  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.842083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0880  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 181 aa  50.4  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1725  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 194 aa  50.4  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1636  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 200 aa  50.4  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1067  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 212 aa  50.4  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.530116 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1775  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 194 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1535  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1279  regulatory protein, TetR  46.43 
 
 		 206 aa  49.7  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.211303  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>