149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3475 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_3475  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 229 aa  437  9.999999999999999e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.265474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5831  TetR family transcriptional regulator  47.91 
 
 		 227 aa  150  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.626315 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1475  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 238 aa  77.8  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.612168  normal  0.616204 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0447  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 226 aa  65.5  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4881  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0263857 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3723  transcriptional regulator, TetR family  28.26 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000134359  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05540  transcriptional regulator  47.54 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4082  transcriptional regulator, TetR family  34.34 
 
 		 193 aa  52.4  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.129417  normal  0.830605 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  45.28 
 
 		 204 aa  52.4  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0702  TetR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 187 aa  52.4  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0130009  normal  0.810563 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2686  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 181 aa  52  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.39833  hitchhiker  0.00361312 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5492  transcriptional regulator, TetR family  40.3 
 
 		 177 aa  52  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56711 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4501  putative transcriptional regulator, TetR family  33.62 
 
 		 198 aa  52  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.749355 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1603  transcriptional regulator, TetR family  37.23 
 
 		 189 aa  50.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 205 aa  50.8  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2189  transcriptional regulator, TetR family  38.98 
 
 		 202 aa  50.8  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3984  TetR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 191 aa  50.8  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.567303 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1884  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 189 aa  49.3  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.652086  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3373  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 211 aa  49.3  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0979  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 196 aa  49.3  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 204 aa  49.3  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0974  regulatory protein, TetR  24.82 
 
 		 205 aa  48.9  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2972  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 207 aa  48.9  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0286  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 177 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.945519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48420  putative transcriptional regulator  36.9 
 
 		 202 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0011363  normal  0.230392 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1036  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 209 aa  48.9  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0478429 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  39.19 
 
 		 223 aa  48.9  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0225  TetR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 240 aa  48.5  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0110  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 193 aa  48.5  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0833  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 182 aa  48.5  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0851  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 182 aa  48.5  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.45674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 238 aa  48.1  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0908  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 200 aa  48.1  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.376971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  35.58 
 
 		 203 aa  48.5  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3328  regulatory protein, TetR  28 
 
 		 187 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0851  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 182 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.780744  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  24.37 
 
 		 214 aa  47.4  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 		 186 aa  46.6  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2157  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 187 aa  46.6  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.105803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4006  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 237 aa  46.6  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0561  transcriptional regulator, TetR family  36.29 
 
 		 197 aa  46.2  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2192  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 191 aa  46.2  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3067  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 199 aa  46.2  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4107  transcriptional regulator  33.8 
 
 		 187 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.198218  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4161  putative transcriptional regulator  34.52 
 
 		 202 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.674844  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  23.42 
 
 		 193 aa  46.2  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0353  transcriptional regulator, TetR family  26.47 
 
 		 191 aa  46.2  0.0004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000439096  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0385  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 219 aa  46.2  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.464521 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  46 
 
 		 230 aa  46.6  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  46.3 
 
 		 193 aa  46.2  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47610  putative transcriptional regulator  33.8 
 
 		 186 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2358  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 216 aa  46.2  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3238  transcriptional regulator, TetR family  31.88 
 
 		 198 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.210945  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 200 aa  45.8  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0016  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 206 aa  45.8  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.951687  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1958  putative transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 208 aa  45.8  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0810  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 268 aa  45.4  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2610  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 207 aa  45.4  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.965658  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2654  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 207 aa  45.4  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5842  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 188 aa  45.4  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25935  normal  0.516433 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2640  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 207 aa  45.4  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1548  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 187 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.664164  normal  0.297776 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5597  TetR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 198 aa  45.1  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.143469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6428  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 217 aa  45.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  48.84 
 
 		 208 aa  45.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 196 aa  44.3  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4599  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 220 aa  44.3  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4538  putative transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 243 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.530779  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0133  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 218 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.440249 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1710  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 217 aa  43.9  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.160964  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5376  putative transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 207 aa  44.3  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0545475 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  24.63 
 
 		 208 aa  43.9  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4645  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 224 aa  43.9  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0360  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 193 aa  43.9  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0944  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 193 aa  43.9  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0944  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  41.67 
 
 		 217 aa  43.5  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0493  transcriptional regulator, TetR family  31.34 
 
 		 222 aa  43.5  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0117598 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1394  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 185 aa  44.3  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.546688  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2546  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 213 aa  44.3  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.768933 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00482  NADH dehydrogenase  47.83 
 
 		 194 aa  44.3  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4047  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 205 aa  44.3  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.866362  normal  0.450827 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4105  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 232 aa  43.9  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3753  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 207 aa  43.9  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.14772  normal  0.02252 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1856  transcriptional regulator, TetR family  44.26 
 
 		 222 aa  43.9  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0583  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 205 aa  43.5  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5533  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 222 aa  43.1  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3240  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 209 aa  43.5  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1862  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 205 aa  43.5  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2332  transcriptional regulator, TetR family  29.76 
 
 		 193 aa  43.5  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.950158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1604  AcrR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 221 aa  43.5  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.388293  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2074  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 189 aa  43.5  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.902771  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1550  transcriptional regulator, TetR family  26.12 
 
 		 201 aa  42.7  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1702  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 311 aa  43.1  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2967  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 198 aa  43.1  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.699652  normal  0.0717993 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  47.73 
 
 		 192 aa  43.1  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7871  transcriptional regulator, TetR family  36.63 
 
 		 212 aa  42.7  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.519364  normal  0.175428 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5494  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 		 141 aa  43.1  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.769028  normal  0.39499 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1052  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 215 aa  42.7  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2120  transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 		 198 aa  42.7  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3684  TetR family transcriptional regulator  24 
 
 		 202 aa  42.7  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>