121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1475 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1475  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 238 aa  431  1e-120  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.612168  normal  0.616204 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0447  putative transcriptional regulator, TetR family  36.87 
 
 		 226 aa  85.5  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4881  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 195 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0263857 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3475  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 229 aa  67.8  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.265474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1548  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 187 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.664164  normal  0.297776 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0702  TetR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 187 aa  66.6  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0130009  normal  0.810563 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5831  TetR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 227 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.626315 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2527  TetR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 194 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.490074  normal  0.267005 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0457  TetR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 206 aa  53.1  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0583  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 205 aa  51.6  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 214 aa  50.8  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1825  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 198 aa  50.1  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3717  TetR family transcriptional regulator  29 
 
 		 191 aa  49.7  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  39.73 
 
 		 212 aa  49.3  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1637  transcriptional regulator, TetR family  29.13 
 
 		 227 aa  48.9  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0178246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10300  transcriptional regulator, tetR family  30.97 
 
 		 200 aa  48.9  0.00007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1490  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 210 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1512  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 210 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1488  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 210 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10308  TetR/AcrR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 210 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000336223  normal  0.125099 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4287  transcriptional regulator, TetR family  31.31 
 
 		 205 aa  48.5  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1176  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 204 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1100  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 204 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3536  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 208 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296099 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2355  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 201 aa  47  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.552854 
 
 
-
 
NC_003296  RS03014  putative transcription regulator protein  37.68 
 
 		 216 aa  46.6  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.262128 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1447  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 214 aa  46.2  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.268108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3220  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 206 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.626936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3282  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 206 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0688565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3231  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 206 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.140653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0944  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 193 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3459  putative transcriptional regulator  29.25 
 
 		 193 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.429515  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2132  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 231 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3101  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 212 aa  45.8  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 201 aa  46.2  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40790  putative transcriptional regulator  32.71 
 
 		 193 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3522  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 204 aa  45.8  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3721  transcriptional regulator, TetR family  37.89 
 
 		 200 aa  45.4  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2836  transcriptional regulator, TetR family  33 
 
 		 207 aa  45.4  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00562159  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3684  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 202 aa  45.4  0.0009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 201 aa  45.4  0.0009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 201 aa  45.1  0.0009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 		 207 aa  44.7  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0658  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 232 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2387  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 232 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2529  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 194 aa  44.7  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0807  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 204 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1771  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 204 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0030  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 193 aa  44.7  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.19641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0331  transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 209 aa  44.7  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3853  transcriptional regulator, TetR family  34.57 
 
 		 213 aa  45.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.26442  normal  0.765649 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2789  transcriptional regulator  39.66 
 
 		 206 aa  45.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3967  transcriptional regulator, TetR family  34.57 
 
 		 213 aa  45.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0630357 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1393  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 194 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.661714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8304  transcriptional regulator, TetR family  33.66 
 
 		 223 aa  43.9  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.505381  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1028  transcriptional regulator, TetR family  33.9 
 
 		 189 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01107  predicted DNA-binding transcriptional regulator  32 
 
 		 210 aa  43.1  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0561  transcriptional regulator, TetR family  32.33 
 
 		 197 aa  43.1  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2536  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 210 aa  43.5  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.018218  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1146  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 216 aa  43.5  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.390773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4909  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 237 aa  43.5  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.69589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0024  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 193 aa  43.5  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0782  transcriptional regulator, TetR family  31.31 
 
 		 295 aa  43.5  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876045  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3992  transcriptional regulator, TetR family  35.21 
 
 		 194 aa  43.5  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.985072 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1234  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 236 aa  43.5  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2490  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 210 aa  43.1  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000804693 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2212  transcriptional regulator, TetR family  30.19 
 
 		 236 aa  43.5  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2408  transcriptional regulator, TetR family  28.92 
 
 		 239 aa  43.5  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.616889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5376  putative transcriptional regulator, TetR family  33.98 
 
 		 207 aa  43.5  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0545475 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01115  hypothetical protein  32 
 
 		 210 aa  43.1  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0186  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 203 aa  43.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.625871  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0707  TetR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 219 aa  42.7  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1398  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 191 aa  42.7  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1819  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 203 aa  43.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.191224 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3410  TetR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 196 aa  42.7  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000655293  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1884  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 189 aa  43.1  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.652086  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3373  TetR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 211 aa  43.1  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 203 aa  42.7  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2015  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 210 aa  43.1  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000283926 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4065  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 193 aa  43.1  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0336  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 191 aa  43.1  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.510139 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2816  transcriptional regulator, TetR family protein  32.05 
 
 		 188 aa  42.7  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1006  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 189 aa  42.7  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1394  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 214 aa  42.7  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3358  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 190 aa  42.7  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2972  TetR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 207 aa  42.7  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0896  transcriptional regulator, TetR family  40.3 
 
 		 186 aa  42.7  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.678038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5492  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 177 aa  42.7  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56711 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 333 aa  42.4  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5338  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 213 aa  42.4  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5427  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 213 aa  42.4  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.926308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0230  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 189 aa  42.4  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.971783  normal  0.1295 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5717  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 213 aa  42.4  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2983  TetR family transcriptional regulator  22.87 
 
 		 190 aa  42.4  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5327  TetR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 219 aa  42.4  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1491  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 210 aa  42.4  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00556415 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 		 206 aa  42.4  0.006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 206 aa  42.4  0.007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33680  transcriptional regulator  29.36 
 
 		 200 aa  42.4  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.737103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1805  transcriptional regulator UidR  38.98 
 
 		 196 aa  42  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.947665  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>