More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_3231 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3220  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 206 aa  414  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.626936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3282  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 206 aa  414  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0688565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3231  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 206 aa  414  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.140653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0561  transcriptional regulator, TetR family  38.34 
 
 		 197 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2461  transcriptional regulator, TetR family  38.54 
 
 		 196 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000138739  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5737  transcriptional regulator, TetR family  32.02 
 
 		 203 aa  93.2  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4718  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 260 aa  84.7  8e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1745  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 243 aa  84  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3788  transcriptional regulator, TetR family  32.74 
 
 		 194 aa  82.8  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.263954  normal  0.238282 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13278  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 211 aa  79  0.00000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.627174 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0123  regulatory protein, TetR  32.62 
 
 		 187 aa  77.8  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.156619  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1335  TetR family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 235 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1353  TetR family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 217 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.299374  normal  0.776591 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1371  TetR family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 274 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0478  transcriptional regulator, TetR family  32.31 
 
 		 321 aa  70.9  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1398  transcriptional regulator, TetR family  32.29 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.211037  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2746  transcriptional regulator, TetR family  29.82 
 
 		 201 aa  65.1  0.0000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9268  putative transcriptional regulator, TetR family  34.95 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.596158 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4118  TetR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 181 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4112  TetR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0592835  normal  0.670519 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2434  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2233  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 187 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.749736  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1634  TetR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 209 aa  53.9  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.681802  normal  0.225704 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3721  transcriptional regulator, TetR family  27.39 
 
 		 200 aa  53.9  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3161  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 195 aa  53.1  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000174477  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11281  transcriptional regulator  27.17 
 
 		 202 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.786647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2227  TetR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 180 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.192949  normal  0.218846 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 203 aa  51.6  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 205 aa  50.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0119  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000000566826  decreased coverage  0.00000000000241144 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3300  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 204 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.161696 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0215  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 218 aa  49.3  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 197 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0438  transcriptional regulator, TetR family  27.94 
 
 		 219 aa  49.3  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 197 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1656  TetR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 196 aa  48.9  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0515046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1544  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 219 aa  48.9  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2504  putative transcriptional regulator, TetR family  45.31 
 
 		 188 aa  48.9  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 197 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  34.02 
 
 		 211 aa  48.5  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 217 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2425  TetR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 204 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.520855  normal  0.599881 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1490  TetR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 210 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1512  TetR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 210 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1488  TetR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 210 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 206 aa  48.1  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 234 aa  48.1  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1994  TetR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 173 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.187018  normal  0.996586 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2013  TetR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 173 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2059  TetR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 173 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.045167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0356  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 235 aa  48.1  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00145185  hitchhiker  0.0000223354 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5356  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 201 aa  47.4  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6030  transcriptional regulator TetR family  32.26 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  31.06 
 
 		 218 aa  47.4  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0265  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 194 aa  47.4  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  32.32 
 
 		 251 aa  47.8  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4281  TetR family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 208 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.130087  normal  0.428776 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2666  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0948  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 191 aa  47.4  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.627177  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  31.88 
 
 		 226 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3873  regulatory protein TetR  25.93 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3345  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 191 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1013  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 191 aa  47.4  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1794  transcriptional regulator  32.18 
 
 		 222 aa  47.4  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3389  transcriptional regulator, TetR family  31.86 
 
 		 187 aa  47  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3305  TetR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 195 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2468  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 198 aa  47  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2132  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 231 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0855  transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 		 223 aa  47  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.835032 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0411  transcriptional regulator, TetR family  43.48 
 
 		 196 aa  47.4  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.3269  hitchhiker  0.00212654 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  31.07 
 
 		 237 aa  47  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4292  TetR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1290  AcrR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 199 aa  47  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1789  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 210 aa  47.4  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.484582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3965  transcriptional regulator, TetR family  30.25 
 
 		 208 aa  46.2  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3637  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 228 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 205 aa  46.2  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  31.88 
 
 		 226 aa  46.6  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3310  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 256 aa  46.2  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000381613  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2010  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 184 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4366  transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 		 211 aa  46.6  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00655225  normal  0.460481 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3578  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 198 aa  46.2  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00935563  normal  0.0256006 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3824  TetR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 206 aa  46.2  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.472754 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1181  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 191 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000215765  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2156  transcriptional regulator, TetR family  30.93 
 
 		 207 aa  46.6  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.362049 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  34.33 
 
 		 207 aa  46.6  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  36.36 
 
 		 226 aa  46.6  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 271 aa  46.6  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2056  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 184 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5615  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 206 aa  46.6  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328639  normal  0.169387 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 205 aa  46.6  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1991  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 184 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.645683  normal  0.738548 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 209 aa  45.8  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 218 aa  45.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4942  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 247 aa  45.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0306  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 186 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.278171  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 		 200 aa  46.2  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0252  transcriptional regulator  31.45 
 
 		 224 aa  45.8  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>