More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0561 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_0561  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 197 aa  391  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3231  TetR family transcriptional regulator  38.34 
 
 		 206 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.140653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3220  TetR family transcriptional regulator  38.34 
 
 		 206 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.626936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3282  TetR family transcriptional regulator  38.34 
 
 		 206 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0688565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2461  transcriptional regulator, TetR family  41.34 
 
 		 196 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000138739  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5737  transcriptional regulator, TetR family  34.83 
 
 		 203 aa  112  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3788  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 194 aa  110  9e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.263954  normal  0.238282 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4718  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 260 aa  104  9e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0123  regulatory protein, TetR  37.99 
 
 		 187 aa  103  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.156619  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1745  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 243 aa  99.8  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13278  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 211 aa  99.4  3e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.627174 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1353  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 217 aa  91.7  6e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.299374  normal  0.776591 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1335  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 235 aa  91.7  7e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1371  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 274 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1398  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 193 aa  80.5  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.211037  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2746  transcriptional regulator, TetR family  28.32 
 
 		 201 aa  77.8  0.00000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0478  transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 		 321 aa  67  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0364  TetR family transcriptional regulator  34.32 
 
 		 220 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.113387 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3721  transcriptional regulator, TetR family  28.98 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 197 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0372  TetR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462449 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1317  regulatory protein TetR  31.9 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3234  TetR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1488  TetR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1490  TetR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3223  TetR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5157  putative transcriptional regulator, TetR family  33.72 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23435  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1512  TetR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3285  TetR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4624  TetR family transcriptional regulator  38 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4360  regulatory protein TetR  37.88 
 
 		 200 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4466  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 193 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1958  putative transcriptional regulator, TetR family  45.76 
 
 		 208 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4400  regulatory protein TetR  30 
 
 		 184 aa  53.1  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0106  transcriptional regulator, TetR family  32.54 
 
 		 227 aa  52.8  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0170  transcriptional regulator, TetR family  31.78 
 
 		 201 aa  52.4  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.307357  hitchhiker  0.00190078 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 202 aa  52  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9268  putative transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 193 aa  52  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.596158 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0929  TetR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 205 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.99421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11281  transcriptional regulator  29.81 
 
 		 202 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.786647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  30.93 
 
 		 222 aa  50.4  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1681  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 216 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.977422 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 230 aa  49.7  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2228  TetR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0369  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 190 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.87327 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6912  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 236 aa  48.9  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.830717  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 		 218 aa  49.3  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2327  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 199 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.194102 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0175  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 203 aa  48.9  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  40.26 
 
 		 221 aa  48.9  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0604  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 205 aa  48.9  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229279 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 210 aa  48.9  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0239  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 229 aa  48.9  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0257  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 209 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102981 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1388  regulatory protein, TetR  32.89 
 
 		 196 aa  48.5  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 203 aa  48.5  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3963  TetR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 193 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4037  TetR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 193 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3977  TetR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 193 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698976  normal  0.0354344 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2556  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 208 aa  48.1  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489141  normal  0.182844 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3540  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 250 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3779  transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 		 194 aa  47.8  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4118  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 181 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1484  TetR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 205 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35560  transcriptional regulator  30.84 
 
 		 200 aa  47.8  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4572  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 234 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1036  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 209 aa  47  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0478429 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 207 aa  46.6  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0987  regulatory protein TetR  27.59 
 
 		 192 aa  47  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.383045  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3067  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 199 aa  47  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0675  transcriptional regulator, TetR family  30.7 
 
 		 271 aa  47  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.886772  normal  0.300779 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1279  regulatory protein, TetR  40 
 
 		 206 aa  46.6  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.211303  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5248  transcriptional regulator, TetR family  34.57 
 
 		 178 aa  46.6  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0120  transcription regulator protein  30.99 
 
 		 209 aa  47  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3780  TetR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 178 aa  47  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.73638 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0414  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 215 aa  47  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.462572  normal  0.0664832 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0521  putative transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 215 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4281  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 208 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.130087  normal  0.428776 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05195  transcriptional regulator  37.29 
 
 		 195 aa  46.2  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5345  transcriptional regulator, TetR family  35.8 
 
 		 196 aa  46.2  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.745934  normal  0.0675507 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0908  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 200 aa  46.2  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.376971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1384  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 225 aa  46.2  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00670258  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0394  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 186 aa  46.2  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.509635  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2461  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 234 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.460998  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1486  TetR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 205 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1508  TetR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 205 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  35.82 
 
 		 198 aa  45.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4193  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 200 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8304  transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 		 223 aa  45.4  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.505381  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4221  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 206 aa  45.4  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.360052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2227  TetR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 180 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.192949  normal  0.218846 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2425  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 204 aa  45.1  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.520855  normal  0.599881 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 210 aa  45.1  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0736  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 198 aa  45.1  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2962  TetR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 201 aa  45.4  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1606  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 206 aa  45.1  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0686792  normal  0.0717181 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  32.86 
 
 		 224 aa  45.1  0.0007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3964  TetR family transcriptional regulator  29 
 
 		 206 aa  45.1  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4403  TetR family transcriptional regulator  29 
 
 		 206 aa  45.1  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.504175 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 190 aa  45.1  0.0007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>