20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1028 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_1028  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 189 aa  373  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0896  transcriptional regulator, TetR family  91.3 
 
 		 186 aa  329  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.678038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2860  regulatory protein, TetR  27.55 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.409771 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2528  putative transcriptional regulator  31.14 
 
 		 163 aa  52  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.6274  normal  0.674714 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0868  putative transcriptional regulator  29.94 
 
 		 163 aa  50.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2288  regulatory protein, TetR  28.87 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0153  hypothetical protein  29.38 
 
 		 163 aa  47.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2413  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 195 aa  45.4  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.311533 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7011  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 190 aa  45.1  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0394296  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2120  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 195 aa  43.9  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5749  transcriptional regulator, TetR family  31.32 
 
 		 193 aa  43.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.808729 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 230 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  31.06 
 
 		 188 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0325  TetR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 202 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.690003 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5165  transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 		 194 aa  42  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.707616 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0346  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 202 aa  42  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.617335 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0336  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 204 aa  42  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.153342  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2686  transcriptional regulator, TetR family  43.64 
 
 		 196 aa  41.6  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1475  transcriptional regulator, TetR family  40.32 
 
 		 238 aa  42  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.612168  normal  0.616204 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5162  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 193 aa  41.6  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.186575 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>