64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2413 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2413  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 195 aa  384  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.311533 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2288  regulatory protein, TetR  78.87 
 
 		 205 aa  308  2.9999999999999997e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5749  transcriptional regulator, TetR family  44 
 
 		 193 aa  119  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.808729 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2686  transcriptional regulator, TetR family  41.5 
 
 		 196 aa  105  4e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23720  transcriptional regulator, tetR family  35.96 
 
 		 192 aa  87  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.232738 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7011  transcriptional regulator, TetR family  34.2 
 
 		 190 aa  85.9  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0394296  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3382  putative transcriptional regulator, TetR family  36.41 
 
 		 202 aa  84.7  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.60132 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2860  regulatory protein, TetR  30.85 
 
 		 217 aa  65.1  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.409771 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3046  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 199 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3812  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 210 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.246252 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3739  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 210 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.461772  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1508  transcriptional regulator, TetR family  25.36 
 
 		 215 aa  49.7  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0994502  normal  0.123569 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3751  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2447  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 208 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4204  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 213 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5463  transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0778  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 192 aa  46.6  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3984  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 191 aa  46.6  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.567303 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1348  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 217 aa  45.4  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.054525 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0124  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 298 aa  45.4  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4571  transcriptional regulator, TetR family  26.77 
 
 		 199 aa  44.7  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1146  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 216 aa  44.7  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.390773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4180  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 204 aa  44.3  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0804485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4357  regulatory protein TetR  36.76 
 
 		 201 aa  44.3  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0747  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 206 aa  44.3  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3293  regulatory protein TetR  38.6 
 
 		 208 aa  43.9  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.147599  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1028  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 189 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4423  regulatory protein TetR  32.23 
 
 		 223 aa  43.9  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.310024  normal  0.345836 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0223  transcriptional regulator, TetR family  25.52 
 
 		 195 aa  43.1  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000853805  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0286  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 177 aa  43.1  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.945519  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0095  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 244 aa  43.1  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.222409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1747  TetR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 221 aa  43.9  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4107  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 187 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.198218  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0744  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 217 aa  43.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  36.07 
 
 		 223 aa  42.7  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3529  TetR family transcriptional regulator  23.84 
 
 		 220 aa  42.7  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.270662  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47610  putative transcriptional regulator  34.25 
 
 		 186 aa  43.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4185  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 203 aa  42.7  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2609  TetR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 194 aa  42.7  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000163063  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1609  transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 		 239 aa  42.4  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01107  predicted DNA-binding transcriptional regulator  24.21 
 
 		 210 aa  42  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1434  transcriptional regulator, TetR family  34.23 
 
 		 185 aa  42  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0583  TetR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 205 aa  42  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1909  transcriptional regulator, TetR family  37.25 
 
 		 197 aa  42  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2490  TetR family transcriptional regulator  24.21 
 
 		 210 aa  42  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000804693 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01115  hypothetical protein  24.21 
 
 		 210 aa  42  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2536  transcriptional regulator, TetR family  24.21 
 
 		 210 aa  42  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.018218  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4083  transcriptional regulator, TetR family  29.35 
 
 		 203 aa  42  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0170  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 203 aa  42  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2015  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 210 aa  42  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000283926 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1234  TetR family transcriptional regulator  24.21 
 
 		 236 aa  41.6  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0174  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 203 aa  41.6  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3410  TetR family transcriptional regulator  21.88 
 
 		 196 aa  41.6  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000655293  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1491  transcriptional regulator, TetR family  24.21 
 
 		 210 aa  41.6  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00556415 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2212  transcriptional regulator, TetR family  24.21 
 
 		 236 aa  41.6  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1561  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 200 aa  41.6  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.478798  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1585  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 200 aa  41.6  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1756  transcriptional regulator, TetR family  29.69 
 
 		 205 aa  41.6  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000229906 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0193  TetR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 203 aa  41.6  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1531  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 200 aa  41.6  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2940  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 188 aa  41.2  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.333542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2619  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 		 221 aa  41.2  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1944  AcrR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 195 aa  41.2  0.009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0039  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 228 aa  41.2  0.01  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.618128  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>