99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_4185 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_4185  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 203 aa  412  1e-114  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0170  TetR family transcriptional regulator  98.03 
 
 		 203 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0174  TetR family transcriptional regulator  98.03 
 
 		 203 aa  401  1e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4083  transcriptional regulator, TetR family  97.04 
 
 		 203 aa  400  1e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3546  TetR family transcriptional regulator  91.63 
 
 		 203 aa  374  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0172  TetR family transcriptional regulator  76.85 
 
 		 203 aa  309  2e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.194351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0172  TetR family transcriptional regulator  75.86 
 
 		 203 aa  309  2e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0167  TetR family transcriptional regulator  75.37 
 
 		 203 aa  305  3e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.266146 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0193  TetR family transcriptional regulator  75.37 
 
 		 203 aa  302  2.0000000000000002e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0121  putative transcriptional regulator, TetR family protein  55.78 
 
 		 204 aa  206  3e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.778342  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0132  TetR family transcriptional regulator  48.4 
 
 		 218 aa  185  4e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.817295 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0186  TetR family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 221 aa  132  3e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.240473 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01438  hypothetical protein  37.63 
 
 		 196 aa  129  3e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004024  transcriptional regulator  37.76 
 
 		 196 aa  127  9.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000690924  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1003  putative HTH-type transcriptional regulator  40.91 
 
 		 199 aa  121  8e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1551  hypothetical protein  37.11 
 
 		 196 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.494685  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3021  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 226 aa  90.1  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1943  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0676  putative transcriptional regulator, TetR family  29.21 
 
 		 205 aa  78.2  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0734  putative transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 202 aa  78.2  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.522503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1500  regulatory protein TetR  30.64 
 
 		 216 aa  72.4  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.570959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1779  regulatory protein TetR  30.64 
 
 		 208 aa  72.4  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.16684 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0668  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 196 aa  71.2  0.000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.109249  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1501  regulatory protein TetR  28.9 
 
 		 210 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0856799  normal  0.774912 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2994  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 197 aa  69.3  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.383158  normal  0.27329 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1636  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 208 aa  64.7  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.836865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5699  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.393579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  29.55 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1583  TetR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  23.62 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3010  transcriptional regulator, TetR family  27.06 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.798857 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1605  TetR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.72373  hitchhiker  0.0000763584 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 208 aa  57  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  26.9 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05540  transcriptional regulator  28.36 
 
 		 197 aa  53.1  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  22.8 
 
 		 208 aa  53.9  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  28.24 
 
 		 203 aa  53.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  25.62 
 
 		 228 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6428  transcriptional regulator, TetR family  28.71 
 
 		 217 aa  52.8  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  21.81 
 
 		 207 aa  52.8  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  25.74 
 
 		 214 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6361  transcriptional regulator, TetR family  24.04 
 
 		 229 aa  52.8  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.439154 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2935  transcriptional regulator, TetR family  25.12 
 
 		 208 aa  52  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4515  transcriptional regulator, TetR family  25.96 
 
 		 217 aa  51.6  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.302767  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4103  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 216 aa  51.6  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2260  regulatory protein TetR  22.75 
 
 		 199 aa  49.7  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.535255  normal  0.350629 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  23.63 
 
 		 204 aa  48.5  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1336  TetR family transcriptional regulator  21.94 
 
 		 200 aa  48.5  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010036 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0764  TetR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 203 aa  48.1  0.00009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0005262  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5283  transcriptional regulator, TetR family  25.16 
 
 		 184 aa  48.1  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.729406  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4581  TetR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 215 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0138954  normal  0.0554322 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2288  regulatory protein, TetR  31.58 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  28.25 
 
 		 203 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2847  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2190  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 223 aa  47.4  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6844  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  29.21 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1203  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 203 aa  46.6  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5643  putative TetR family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 232 aa  46.2  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.375487 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  27.5 
 
 		 191 aa  45.4  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2982  TetR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 232 aa  45.1  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.435152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4615  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 225 aa  45.1  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4250  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 194 aa  44.7  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.19782 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4758  TetR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 236 aa  45.1  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1696  TetR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 202 aa  45.1  0.0008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.176236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0439  TetR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 199 aa  44.7  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0784  TetR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 204 aa  44.3  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42035  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0252  transcriptional regulator  24.48 
 
 		 224 aa  44.7  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0688  TetR family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 206 aa  43.9  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.987458 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2722  TetR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 237 aa  43.5  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3222  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 		 204 aa  43.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.067896  hitchhiker  0.00000207795 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1958  putative transcriptional regulator, TetR family  23.95 
 
 		 208 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1231  transcriptional regulator, TetR family  28.18 
 
 		 212 aa  43.9  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.814793  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3517  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 236 aa  43.9  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0435497  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 200 aa  43.5  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01162  transcription regulator, TetR family protein  19.7 
 
 		 201 aa  43.9  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  24.12 
 
 		 219 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1428  TetR family transcriptional regulator  23.33 
 
 		 204 aa  43.9  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6886  TetR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 239 aa  42.7  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0975429  normal  0.0518769 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2792  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 190 aa  42.7  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.782155  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  22.91 
 
 		 204 aa  42.7  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1375  regulatory protein TetR  30.97 
 
 		 199 aa  43.1  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.852149 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2413  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 195 aa  42.7  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.311533 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1596  hypothetical protein  23.9 
 
 		 205 aa  43.1  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0318645  normal  0.570188 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  25.25 
 
 		 199 aa  42.4  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0242  transcriptional regulator, TetR family  23.89 
 
 		 197 aa  42.4  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4764  transcriptional regulator, TetR family  28.23 
 
 		 181 aa  42.4  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  24.57 
 
 		 203 aa  42  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 222 aa  41.6  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0655  TetR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 254 aa  42  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1756  transcriptional regulator, TetR family  34.67 
 
 		 205 aa  41.6  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000229906 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4646  TetR family transcriptional regulator  23.43 
 
 		 184 aa  41.6  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.874384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4558  TetR family transcriptional regulator  23.43 
 
 		 184 aa  41.6  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5095  transcriptional regulator, TetR family  21.93 
 
 		 200 aa  41.6  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.666558  normal  0.638711 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4941  TetR family transcriptional regulator  23.46 
 
 		 184 aa  41.2  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.155489 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4298  TetR family transcriptional regulator  24 
 
 		 197 aa  41.6  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  26 
 
 		 206 aa  41.2  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4101  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 204 aa  41.6  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2424  TetR family transcriptional regulator  21.16 
 
 		 195 aa  41.2  0.01  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.351018  normal  0.169274 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>