50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2686 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2686  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 196 aa  385  1e-106  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5749  transcriptional regulator, TetR family  44.77 
 
 		 193 aa  111  7.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.808729 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2413  TetR family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 195 aa  109  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.311533 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2288  regulatory protein, TetR  40.82 
 
 		 205 aa  104  9e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3382  putative transcriptional regulator, TetR family  39.2 
 
 		 202 aa  95.9  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.60132 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7011  transcriptional regulator, TetR family  34.52 
 
 		 190 aa  68.6  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0394296  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2162  TetR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 209 aa  49.3  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0662359 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3410  transcriptional regulator, TetR family  23.91 
 
 		 192 aa  48.5  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.208492  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1451  transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 		 428 aa  47  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5500  transcriptional regulator, TetR family  22.56 
 
 		 190 aa  47  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.161362  decreased coverage  0.000153945 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1858  TetR family transcriptional regulator  23.2 
 
 		 234 aa  46.2  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0896  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 186 aa  45.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.678038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 203 aa  45.8  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05300  transcriptional regulator, tetR family  47.69 
 
 		 182 aa  45.8  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0778  TetR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 192 aa  45.4  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1840  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 415 aa  45.1  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1562  putative transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 		 194 aa  44.7  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.196181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5134  transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 		 197 aa  44.7  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4897  transcriptional regulator, TetR family  23.24 
 
 		 193 aa  44.3  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.684326  normal  0.293164 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1459  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 203 aa  44.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.540117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14570  transcriptional regulator, tetR family  36.05 
 
 		 184 aa  44.7  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1909  transcriptional regulator, TetR family  23.73 
 
 		 197 aa  44.3  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3554  transcriptional regulator, TetR family  27.52 
 
 		 217 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19890  transcriptional regulator  35.9 
 
 		 346 aa  43.9  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.403358  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1798  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 194 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1601  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 194 aa  43.1  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.105676  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1725  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 194 aa  43.1  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0124  transcriptional regulator, TetR family  38.75 
 
 		 298 aa  43.1  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5248  transcriptional regulator, TetR family  38.14 
 
 		 178 aa  43.5  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1775  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 194 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1553  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 194 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  25 
 
 		 200 aa  42.7  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4844  transcriptional regulator, TetR family  28.41 
 
 		 252 aa  42.4  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3603  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 205 aa  42.7  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.162578  normal  0.242533 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2609  TetR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 194 aa  42  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000163063  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1478  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 188 aa  42.4  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.182244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2085  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 210 aa  42  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1028  transcriptional regulator, TetR family  43.64 
 
 		 189 aa  42.4  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3234  transcriptional regulator, TetR family  29.87 
 
 		 191 aa  42  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9078  putative transcriptional regulator, TetR family  27.87 
 
 		 211 aa  41.6  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2940  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 188 aa  42  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.333542  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1664  transcriptional regulator, TetR family  28.37 
 
 		 197 aa  41.6  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.294171  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4302  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 223 aa  41.6  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0684  transcriptional regulator, TetR family  23.39 
 
 		 197 aa  41.2  0.009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.84339  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26800  transcriptional regulator  36.07 
 
 		 184 aa  41.2  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.463482  normal  0.288316 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0414  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 202 aa  41.2  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2948  TetR family transcriptional regulator  20.41 
 
 		 191 aa  41.2  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2120  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 195 aa  41.2  0.009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33680  transcriptional regulator  40.74 
 
 		 200 aa  41.2  0.01  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.737103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4321  regulatory protein TetR  30.94 
 
 		 194 aa  41.2  0.01  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0684654  normal  0.242009 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>