More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_19890 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_19890  transcriptional regulator  100 
 
 		 346 aa  690    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.403358  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19820  transcriptional regulator  66.32 
 
 		 260 aa  256  4e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  50.7 
 
 		 280 aa  181  1e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2430  transcriptional regulator, TetR family  38.92 
 
 		 207 aa  92.8  8e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.466149 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2974  transcriptional regulator, TetR family  35.8 
 
 		 199 aa  92.4  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3500  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 209 aa  88.2  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00016281 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2742  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 207 aa  87  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2496  transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 		 226 aa  85.5  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.40575  normal  0.202338 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35350  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 223 aa  76.3  0.0000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.147408 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2977  transcriptional regulator, TetR family  37.38 
 
 		 196 aa  74.3  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1508  transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 		 215 aa  72.8  0.000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0994502  normal  0.123569 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  33.75 
 
 		 197 aa  72.4  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8489  putative transcriptional regulator, TetR family  39.42 
 
 		 203 aa  72  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.280909  normal  0.379927 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 205 aa  72  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0994293 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4429  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 197 aa  70.9  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.679698  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3319  transcriptional regulator, TetR family  34.44 
 
 		 214 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00311946  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3154  regulatory protein, TetR  31.98 
 
 		 214 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0193225  normal  0.108939 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1780  regulatory protein, TetR  31.9 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.407505  normal  0.506261 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4786  transcriptional regulator, TetR family  35.38 
 
 		 211 aa  69.7  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.187473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27500  transcriptional regulator  36.77 
 
 		 214 aa  69.3  0.00000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 203 aa  68.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3720  transcriptional regulator, TetR family  35.94 
 
 		 200 aa  68.2  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.91394  normal  0.0177543 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05720  transcriptional regulator  35.21 
 
 		 221 aa  68.2  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.203838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17710  transcriptional regulator  33.97 
 
 		 203 aa  68.2  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0632938  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0466  TetR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 189 aa  67.4  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4432  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21103  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4700  transcriptional regulator, TetR family  31.09 
 
 		 224 aa  67  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0565878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 291 aa  65.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02720  transcriptional regulator, tetR family  30.51 
 
 		 211 aa  65.1  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.460979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6256  Transcriptional regulator  27.06 
 
 		 219 aa  64.3  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.109242  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4066  transcriptional regulator, TetR family  29.81 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2619  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34550  transcriptional regulator, TetR family  33.09 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00167706  normal  0.63182 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3695  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.551475  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3036  regulatory protein, TetR  30.77 
 
 		 216 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0300267  normal  0.0658454 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1756  transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 		 205 aa  61.6  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000229906 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  30.56 
 
 		 237 aa  61.6  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2546  transcriptional regulator, TetR family  31.14 
 
 		 207 aa  61.2  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0140  TetR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 182 aa  61.2  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4043  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 		 222 aa  61.2  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6181  transcriptional regulator, TetR family  32.48 
 
 		 202 aa  61.2  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0781  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30260  transcriptional regulator  32.41 
 
 		 400 aa  60.8  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.473296 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 125 aa  60.5  0.00000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 332 aa  60.5  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0445  transcriptional regulator, TetR family  32.29 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.740524  decreased coverage  0.00376288 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30540  transcriptional regulator, TetR family  34.94 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04710  hypothetical protein  37.23 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.886082  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0030  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.19641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5005  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 229 aa  58.9  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.143864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2292  transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 		 186 aa  58.5  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.030142  hitchhiker  0.00610108 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36720  transcriptional regulator  34.94 
 
 		 179 aa  59.3  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.72942 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2007  TetR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 193 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3756  TetR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 193 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3562  transcriptional regulator, TetR family  42.03 
 
 		 237 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.108326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 231 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4873  transcriptional regulator, TetR family  33.64 
 
 		 193 aa  58.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 221 aa  58.5  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2147  TetR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 193 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.576982  hitchhiker  0.00198138 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0839  transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1427  TetR family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 204 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.286714  hitchhiker  0.000126282 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0906  transcriptional regulator, TetR family  37.23 
 
 		 232 aa  58.2  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.052988  normal  0.0196 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 188 aa  58.5  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  30.9 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  22.55 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2186  TetR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0785456  normal  0.820524 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0280  hypothetical protein  38.78 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 195 aa  57.8  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0934  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 218 aa  57  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1746  transcriptional regulator, TetR family  42.65 
 
 		 195 aa  57  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1292  regulatory protein TetR  40.26 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.413674  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1590  transcriptional regulator, TetR family  37.97 
 
 		 231 aa  57  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.299217  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1454  transcriptional regulator, TetR family  40.26 
 
 		 231 aa  57  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.901974 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4525  transcriptional regulator, TetR family  35.11 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.397871 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3739  TetR family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.461772  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3812  TetR family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.246252 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3751  TetR family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0024  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3171  transcriptional regulator, TetR family  30.2 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.323724  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2041  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  38 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  35.96 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1898  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.643398 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 245 aa  56.2  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  39.36 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1493  TetR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2510  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 245 aa  55.8  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4951  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 239 aa  55.8  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.717286  normal  0.572747 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3170  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 202 aa  55.8  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0140  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 176 aa  55.5  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4041  TetR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 182 aa  55.5  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.449289  normal  0.0505107 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0312  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 182 aa  55.8  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1416  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 197 aa  55.8  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.305494  hitchhiker  0.0000141576 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>