More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1746 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1746  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 195 aa  375  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0994  transcriptional regulator, TetR family  62.84 
 
 		 184 aa  208  4e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.885114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2791  transcriptional regulator, TetR family  52.87 
 
 		 179 aa  167  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0498078  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36720  transcriptional regulator  45.03 
 
 		 179 aa  136  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.72942 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2859  transcriptional regulator, TetR family  43.17 
 
 		 186 aa  126  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.111234  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0756  transcriptional regulator, TetR family  46.01 
 
 		 206 aa  120  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0490671  hitchhiker  0.00390743 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36230  transcriptional regulator, tetR family  39.86 
 
 		 187 aa  71.6  0.000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.552235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1933  AcrR family transcriptional regulator  43.3 
 
 		 243 aa  61.6  0.000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.189914  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  43.04 
 
 		 280 aa  61.6  0.000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 241 aa  61.6  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0855  transcriptional regulator, TetR family  33.59 
 
 		 223 aa  61.2  0.000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.835032 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6913  putative transcriptional regulator, TetR family  55.74 
 
 		 183 aa  60.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3694  TetR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27500  transcriptional regulator  42.34 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2496  transcriptional regulator, TetR family  33.61 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.40575  normal  0.202338 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19890  transcriptional regulator  43.66 
 
 		 346 aa  57.4  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.403358  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1976  putative transcriptional regulator, TetR family  32.69 
 
 		 181 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2186  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 214 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0785456  normal  0.820524 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3376  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0312  TetR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 182 aa  56.2  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19820  transcriptional regulator  42.31 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4873  transcriptional regulator, TetR family  52 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2974  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3170  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148676  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1590  transcriptional regulator, TetR family  53.45 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.299217  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4290  transcriptional regulator, TetR family  56.82 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000567463  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1023  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 269 aa  55.1  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.048156  normal  0.0140553 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1260  transcriptional regulator, TetR family  48.44 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  31.78 
 
 		 255 aa  55.1  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2355  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 201 aa  54.7  0.0000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.552854 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0466  TetR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 189 aa  54.7  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17710  transcriptional regulator  39.64 
 
 		 203 aa  54.3  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0632938  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2742  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 207 aa  53.9  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1396  transcriptional regulator, TetR family  38.4 
 
 		 175 aa  54.3  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.579641  normal  0.0426507 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3926  TetR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 258 aa  53.9  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 332 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  38.95 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4432  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 208 aa  53.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2529  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 194 aa  53.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2349  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 357 aa  53.5  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00426882  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4043  transcriptional regulator, TetR family  54.17 
 
 		 222 aa  53.5  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3617  TetR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 219 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0140  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 176 aa  53.5  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0068  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 185 aa  53.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.139926 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4750  TetR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 219 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0204514 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1508  transcriptional regulator, TetR family  48.33 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0994502  normal  0.123569 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3456  transcriptional regulator, TetR family  51.79 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.659534  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5533  TetR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 219 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.445482  normal  0.987341 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4429  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 197 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.679698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2430  transcriptional regulator, TetR family  47.54 
 
 		 207 aa  52.8  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.466149 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3695  transcriptional regulator, TetR family  49.06 
 
 		 218 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.551475  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0760  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 192 aa  52.8  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0913287  normal  0.16222 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0186  TetR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 203 aa  52.8  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.625871  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0622  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 181 aa  52.8  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2358  transcriptional regulator, TetR family  37.97 
 
 		 216 aa  53.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 194 aa  53.1  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05720  transcriptional regulator  48.15 
 
 		 221 aa  53.1  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.203838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 291 aa  52.8  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4133  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 217 aa  52.8  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.110099 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3665  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 228 aa  52.8  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1756  transcriptional regulator, TetR family  39.62 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000229906 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1819  TetR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 203 aa  52.8  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.191224 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4094  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 204 aa  52.8  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0325183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1283  transcriptional regulator, TetR family  41.79 
 
 		 212 aa  52.4  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0196213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4597  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 217 aa  52.8  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568004 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4218  TetR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 202 aa  52.4  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.135159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8489  putative transcriptional regulator, TetR family  45.36 
 
 		 203 aa  52.4  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.280909  normal  0.379927 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3052  TetR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 183 aa  52  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.186092 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 		 286 aa  52  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  45.83 
 
 		 310 aa  52  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1780  regulatory protein, TetR  54.17 
 
 		 212 aa  52  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.407505  normal  0.506261 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0018  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 196 aa  52  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3642  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 227 aa  52  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.494269 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0231  transcriptional regulator, TetR family  43.08 
 
 		 200 aa  51.6  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.336394 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1823  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 222 aa  51.6  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4153  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 234 aa  51.6  0.000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0085  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 195 aa  51.2  0.000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.0016021  decreased coverage  0.0000722764 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 213 aa  51.2  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1398  transcriptional regulator, TetR family  27.46 
 
 		 195 aa  51.2  0.000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2816  transcriptional regulator, TetR family protein  36.49 
 
 		 188 aa  51.2  0.000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26760  putative transcriptional regulator  40.54 
 
 		 198 aa  51.2  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2202  transcriptional regulator, TetR family  40.79 
 
 		 186 aa  51.2  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3036  regulatory protein, TetR  36.9 
 
 		 216 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0300267  normal  0.0658454 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1416  TetR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 197 aa  50.4  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.305494  hitchhiker  0.0000141576 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7312  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 210 aa  50.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1649  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 233 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.617035  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1742  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 235 aa  51.2  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.666045  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3328  regulatory protein, TetR  43.08 
 
 		 187 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  34.12 
 
 		 205 aa  50.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1380  transcriptional regulator, TetR family  47.92 
 
 		 214 aa  50.4  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000685689  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3360  transcriptional regulator, TetR family  52.08 
 
 		 194 aa  50.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.372466  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3493  TetR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 222 aa  50.8  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.50615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4065  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 193 aa  50.8  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0571  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 219 aa  50.8  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>