59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_36230 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_36230  transcriptional regulator, tetR family  100 
 
 		 187 aa  365  1e-100  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.552235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1746  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 195 aa  68.6  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0756  transcriptional regulator, TetR family  32.52 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0490671  hitchhiker  0.00390743 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2791  transcriptional regulator, TetR family  32.24 
 
 		 179 aa  63.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0498078  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0994  transcriptional regulator, TetR family  32.91 
 
 		 184 aa  62  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.885114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36720  transcriptional regulator  34.93 
 
 		 179 aa  58.9  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.72942 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3520  TetR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 236 aa  50.4  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2859  transcriptional regulator, TetR family  31.1 
 
 		 186 aa  50.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.111234  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2205  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270822 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4090  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 342 aa  47.8  0.00009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.729082 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3958  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 260 aa  47  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3494  transcriptional regulator, TetR family  36.99 
 
 		 208 aa  46.2  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02639  transcriptional regulator  26.67 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0794  transcriptional regulator, TetR family  23.08 
 
 		 221 aa  46.6  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1341  TetR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 224 aa  46.6  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1225  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 269 aa  47  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0421  transcriptional regulator, TetR family  37.33 
 
 		 198 aa  46.2  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0570  transcriptional regulator, TetR family  44 
 
 		 221 aa  46.2  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3170  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 202 aa  45.4  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  29.01 
 
 		 203 aa  45.4  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0376  TetR family transcriptional regulator  24.08 
 
 		 194 aa  45.1  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0809  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 233 aa  45.1  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0591  TetR family transcriptional regulator  42 
 
 		 221 aa  44.7  0.0008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.581087 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4869  transcriptional regulator, TetR family  34.85 
 
 		 193 aa  44.7  0.0009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 205 aa  44.7  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1044  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 180 aa  43.9  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0206033 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0370  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 193 aa  43.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3452  transcriptional regulator, TetR family  46.94 
 
 		 227 aa  43.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000897017  hitchhiker  0.00397123 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1976  putative transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 181 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0503  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 193 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3099  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 221 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00451486  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0455  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 193 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0937341  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0503  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 193 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0420  TetR family regulatory protein  36.36 
 
 		 226 aa  43.1  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.418633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0230  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 189 aa  42.4  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.971783  normal  0.1295 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2497  TetR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 201 aa  42.4  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.55388 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1790  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 220 aa  42  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.536923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0433  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 193 aa  42  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0375  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 193 aa  42  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1088  transcriptional regulator, TetR family  24.05 
 
 		 193 aa  42  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1985  transcriptional regulator, TetR family  34.34 
 
 		 206 aa  41.6  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0366  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 193 aa  42  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.100088  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1087  transcriptional regulator, TetR family  36.96 
 
 		 215 aa  42  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.9461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0363  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 193 aa  41.6  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0389  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 193 aa  42  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3478  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 247 aa  41.6  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.346656  normal  0.546304 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3349  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 209 aa  41.2  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.545743 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4217  transcriptional regulator, TetR family  27.12 
 
 		 193 aa  41.2  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.152492 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2734  putative transcriptional regulator, TetR family  34.57 
 
 		 206 aa  41.2  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.596696  normal  0.79417 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1499  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 211 aa  41.2  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.508077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6913  putative transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 183 aa  41.2  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4033  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 219 aa  41.2  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000937448 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2314  transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 		 213 aa  41.2  0.009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.251224 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1938  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 225 aa  41.2  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1534  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 211 aa  41.2  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114781  normal  0.468022 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2026  transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 		 218 aa  41.2  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.148832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5796  transcriptional regulator, TetR family  35.37 
 
 		 207 aa  41.2  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0048122 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  27.91 
 
 		 201 aa  41.2  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>