78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0230 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_0230  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 189 aa  368  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.971783  normal  0.1295 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0437  TetR family transcriptional regulator  77.46 
 
 		 176 aa  262  3e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.383719 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0863  TetR family transcriptional regulator  47.59 
 
 		 181 aa  138  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0857  TetR family transcriptional regulator  46.99 
 
 		 181 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.755905  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0874  TetR family transcriptional regulator  46.99 
 
 		 181 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19500  transcriptional regulator, tetR family  32.94 
 
 		 181 aa  94  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.64021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4925  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 237 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.733021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4837  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 237 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1035  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 214 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1008  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 214 aa  51.6  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.535946  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1025  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 214 aa  51.6  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.589531  normal  0.553747 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0301  transcriptional regulator, TetR family  32.54 
 
 		 199 aa  51.2  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0864199  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2314  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 213 aa  51.6  0.000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.251224 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3241  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 221 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2827  transcriptional regulator, TetR family  30.68 
 
 		 186 aa  49.7  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.05215  normal  0.803833 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  30.17 
 
 		 198 aa  48.9  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  28.45 
 
 		 191 aa  48.5  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2556  putative transcriptional regulator, TetR family  33.72 
 
 		 205 aa  48.5  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.596771  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0011  transcriptional regulator, putative  20.71 
 
 		 179 aa  47  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  26.21 
 
 		 199 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4584  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 230 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0323  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 227 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.939407  normal  0.953553 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4579  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 230 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.28011 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 193 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2959  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 200 aa  45.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2727  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 192 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109313 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1685  transcriptional regulator  32.17 
 
 		 197 aa  45.4  0.0005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21800  transcriptional regulator  32.88 
 
 		 265 aa  44.7  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.391718  normal  0.223847 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2537  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 231 aa  44.7  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3190  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 202 aa  44.7  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000548437  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1248  AcrR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 199 aa  44.3  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5054  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 207 aa  43.9  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.817621 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3965  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 208 aa  44.3  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0778  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 199 aa  44.3  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308556  normal  0.547023 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3394  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 220 aa  43.1  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.222962 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3967  transcriptional regulator, TetR family  27.87 
 
 		 213 aa  43.5  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0630357 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2789  transcriptional regulator, TetR family  25.48 
 
 		 192 aa  43.5  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0987  regulatory protein TetR  39.34 
 
 		 192 aa  43.1  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.383045  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0293  transcriptional regulator, TetR family  30.1 
 
 		 230 aa  43.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3721  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 200 aa  43.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3853  transcriptional regulator, TetR family  27.87 
 
 		 213 aa  43.5  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.26442  normal  0.765649 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3701  transcriptional regulator of TetR family protein  32.88 
 
 		 206 aa  43.1  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6592  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 225 aa  43.5  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.186395 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 199 aa  43.5  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4466  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 193 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2963  TetR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 189 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.412295 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2228  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 206 aa  43.5  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 324 aa  43.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3994  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 391 aa  43.1  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.777734 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5419  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 257 aa  43.1  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2475  TetR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 189 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0055  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 196 aa  42.7  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.727514  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4516  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 197 aa  42.7  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.125793  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1013  transcriptional regulator, TetR family  33.9 
 
 		 196 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000810233  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2430  TetR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 189 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4141  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 243 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04380  transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 		 72 aa  42.7  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2992  TetR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 191 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.385096  normal  0.373192 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13530  transcriptional regulator, TetR family  28.79 
 
 		 186 aa  42.4  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00114254  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 201 aa  42.4  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2948  TetR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 191 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4191  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 236 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.513173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2454  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 185 aa  42.4  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7116  putative transcriptional regulator, TetR family  35.16 
 
 		 183 aa  42.4  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5327  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 219 aa  42.4  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1945  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 225 aa  42.4  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  21.35 
 
 		 200 aa  42.4  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3063  regulatory protein TetR  33.64 
 
 		 191 aa  42  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01975  hypothetical protein  36.36 
 
 		 204 aa  41.6  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.10817  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3441  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 215 aa  41.6  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0042  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 196 aa  41.6  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0194  TetR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 193 aa  41.6  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3959  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 204 aa  41.6  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00461459  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1527  HTH-type transcriptional regulator, TetR family  23.16 
 
 		 185 aa  41.6  0.008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.718491  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 212 aa  41.6  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2773  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 191 aa  41.2  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.704113  normal  0.8573 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1924  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 210 aa  41.6  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.343626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 190 aa  41.2  0.01  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>