More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_5054 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_5054  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 207 aa  403  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.817621 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1035  TetR family transcriptional regulator  65.57 
 
 		 214 aa  259  3e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1008  TetR family transcriptional regulator  65.57 
 
 		 214 aa  258  4e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.535946  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1025  TetR family transcriptional regulator  65.57 
 
 		 214 aa  258  4e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.589531  normal  0.553747 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4141  TetR family transcriptional regulator  47.15 
 
 		 243 aa  162  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4584  TetR family transcriptional regulator  45.64 
 
 		 230 aa  160  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0323  TetR family transcriptional regulator  45.96 
 
 		 227 aa  160  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.939407  normal  0.953553 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4579  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 230 aa  156  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.28011 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4837  TetR family transcriptional regulator  44.57 
 
 		 237 aa  147  8e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4925  TetR family transcriptional regulator  44.57 
 
 		 237 aa  147  8e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.733021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2636  regulatory protein TetR  42.94 
 
 		 182 aa  134  8e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3021  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 210 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2454  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4442  TetR family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0830  TetR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3788  transcriptional regulator, TetR family  37.37 
 
 		 208 aa  57  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11588  regulatory protein  35.64 
 
 		 202 aa  57  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.8751e-36  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4162  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0437  TetR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 176 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.383719 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7001  transcriptional regulator, TetR family  47.27 
 
 		 221 aa  53.9  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3018  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 221 aa  53.9  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0230  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 189 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.971783  normal  0.1295 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  39.24 
 
 		 230 aa  52.8  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 		 228 aa  52.4  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5587  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 216 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5207  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 216 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5133  TetR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 195 aa  52  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0406235 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5295  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 216 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3506  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 195 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  0.0873465 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 197 aa  52  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5319  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 208 aa  51.6  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2574  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 213 aa  51.6  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4534  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3175  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  39.44 
 
 		 188 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0421  transcriptional regulator, TetR family  48.15 
 
 		 189 aa  50.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0114693  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5704  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.013286 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3260  TetR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 213 aa  50.8  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.122521  normal  0.297775 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1193  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000366279  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3836  putative transcriptional regulator, TetR family  45.28 
 
 		 179 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0612117 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  33.83 
 
 		 199 aa  50.4  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3117  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.490432 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5155  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3892  TetR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 198 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4974  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.792599  normal  0.404801 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3966  TetR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 198 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal  0.497396 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2304  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 225 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.808365 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3878  TetR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 198 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.348506 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0857  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 181 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.755905  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0874  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 181 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1669  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 225 aa  49.7  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0413702  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0863  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 181 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0008  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 205 aa  49.3  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1515  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 205 aa  49.3  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.512381  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1790  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 209 aa  49.3  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 		 224 aa  49.3  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0011  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 205 aa  49.3  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0010  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 205 aa  49.3  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.387363  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1156  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 205 aa  49.3  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1436  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 205 aa  49.3  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0010  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 205 aa  49.3  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3190  TetR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 202 aa  48.9  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000548437  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 212 aa  49.3  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4342  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 218 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0243053 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4339  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 207 aa  48.5  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00746452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3965  transcriptional regulator, TetR family  33.59 
 
 		 208 aa  48.5  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11192  transcriptional regulator  35.48 
 
 		 201 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2801  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 189 aa  48.5  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 		 192 aa  48.5  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1498  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 189 aa  48.5  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.437225  normal  0.170332 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0010  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 205 aa  48.1  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1248  AcrR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 199 aa  48.1  0.00008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2426  TetR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 205 aa  48.1  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4433  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 199 aa  48.1  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304497  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4887  putative TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 191 aa  48.1  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0109337  normal  0.0985913 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0250  transcriptional regulator, TetR family  49.02 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.804071  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4516  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 197 aa  47.4  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.125793  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1121  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 220 aa  48.1  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.2139 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2760  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 203 aa  47.8  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000891417  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4372  transcriptional regulator, TetR family  46.94 
 
 		 187 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.733694  normal  0.0486392 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0464  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3656  TetR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 207 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.311417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2800  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3287  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 195 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.443656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1938  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 225 aa  47.8  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0239  transcriptional regulator, TetR family  49.02 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0220692  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2838  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 202 aa  47.8  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1305  TetR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 181 aa  46.6  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2832  transcriptional regulator, TetR family  45.76 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2816  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 192 aa  47  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0228  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 201 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.527328  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1474  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 188 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 194 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 219 aa  47.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5297  TetR family transcriptional regulator  42 
 
 		 197 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.755351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 236 aa  46.6  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5223  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 197 aa  47  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325156 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2029  TetR family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 194 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>