More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1248 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1248  AcrR family transcriptional regulator  100 
 
 		 199 aa  404  1.0000000000000001e-112  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0863  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 181 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19500  transcriptional regulator, tetR family  31.15 
 
 		 181 aa  70.9  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.64021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0857  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 181 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.755905  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0874  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 181 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1252  TetR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0581191  normal  0.11609 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3998  transcriptional regulator, TetR family  29.26 
 
 		 245 aa  63.5  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000456955  normal  0.178314 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0520  transcriptional regulator, TetR family  25.31 
 
 		 197 aa  63.2  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.711752  normal  0.521102 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  27.61 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1190  TetR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.106163  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2851  TetR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 204 aa  58.2  0.00000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.313937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5159  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 226 aa  57.8  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2015  TetR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.997895  normal  0.682792 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5122  TetR family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 240 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.243003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6035  transcriptional regulator, TetR family  25.68 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2593  putative transcriptional regulator, TetR family  26.11 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0854341 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1909  transcriptional regulator, TetR family  24.68 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3771  transcriptional regulator, TetR family  26.44 
 
 		 223 aa  54.7  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 219 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2681  transcriptional regulator, TetR family  24.71 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.387724  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0422  TetR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 248 aa  54.3  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  24.16 
 
 		 198 aa  53.9  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0464  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 243 aa  53.9  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5008  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 201 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 231 aa  53.5  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1697  transcriptional regulator, TetR family  26.99 
 
 		 230 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5587  TetR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 216 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1929  transcriptional regulator, TetR family  27.72 
 
 		 214 aa  53.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5207  TetR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 216 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5031  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 248 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5295  TetR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 216 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334601  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  27.49 
 
 		 218 aa  53.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 205 aa  52.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3126  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 248 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.068587  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5241  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 248 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.927318 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1609  TetR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 254 aa  52.4  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0801  TetR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 254 aa  52.4  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0472  TetR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 254 aa  52.4  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0946  TetR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 258 aa  52.4  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.806854  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3465  TetR family transcriptional regulator  24.64 
 
 		 248 aa  52.8  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.980317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0655  TetR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 254 aa  52.4  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.64003  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2057  TetR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 254 aa  52.4  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.649855  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1961  TetR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 254 aa  52.4  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.140222  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0543  TetR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 254 aa  52.4  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.387034  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  24.42 
 
 		 199 aa  52.4  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0778  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 199 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308556  normal  0.547023 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4589  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 248 aa  52  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.954889 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1870  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 200 aa  52  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  25.54 
 
 		 214 aa  51.6  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0278  transcriptional regulator, TetR family  24.56 
 
 		 206 aa  51.6  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.72994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3721  transcriptional regulator, TetR family  44.07 
 
 		 200 aa  51.6  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  22.47 
 
 		 192 aa  51.6  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3923  TetR family transcriptional regulator  24.67 
 
 		 214 aa  51.6  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0845  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 200 aa  51.6  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  22.6 
 
 		 191 aa  51.6  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2286  transcriptional regulator, TetR family  26.95 
 
 		 188 aa  51.2  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000280215 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1007  transcription regulator protein  27.06 
 
 		 239 aa  50.8  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.605979  normal  0.178446 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 242 aa  50.8  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1327  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 191 aa  51.2  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385081  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2776  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 209 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376535  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2954  transcriptional regulator, TetR family  26.81 
 
 		 188 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3563  TetR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 254 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.473219 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4148  TetR family transcriptional regulator  22.78 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.677229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4577  TetR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 247 aa  50.8  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2827  transcriptional regulator, TetR family  28.89 
 
 		 186 aa  50.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.05215  normal  0.803833 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3527  TetR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 227 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0655225  normal  0.540257 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2991  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 188 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0384605  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2997  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 188 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000711023  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0326  Transcriptional regulator protein  39.06 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2682  TetR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 200 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0327111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05370  transcriptional regulator, TetR family  32.08 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1838  transcriptional regulator, TetR family  27.04 
 
 		 221 aa  50.1  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.834516  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2652  TetR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 200 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2095  TetR family transcriptional regulator  23.93 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0799745 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1049  TetR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 230 aa  50.4  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2743  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 188 aa  50.1  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.673676  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2697  TetR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 200 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312459  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2339  TetR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 208 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249237 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0873  transcriptional regulator, TetR family  25.88 
 
 		 231 aa  49.7  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.326269 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0301  transcriptional regulator, TetR family  26.7 
 
 		 199 aa  49.7  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0864199  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 235 aa  49.7  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2371  transcriptional regulator, TetR family  28.43 
 
 		 190 aa  49.7  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0185343  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2602  transcriptional regulator, TetR family  26.71 
 
 		 214 aa  49.7  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157273  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2247  TetR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 227 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2695  transcriptional regulator, TetR family  26.71 
 
 		 226 aa  49.3  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2951  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 188 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.418779999999999e-31 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 194 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4584  TetR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 230 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2742  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 188 aa  49.3  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.845467  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2692  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 188 aa  49.3  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0469224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2671  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 188 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.083497  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2029  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 220 aa  49.3  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 205 aa  49.3  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2401  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 223 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.853887 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0959  TetR family transcriptional regulator  23.67 
 
 		 248 aa  49.3  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0776064  normal  0.539269 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0952  TetR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0602788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3070  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 211 aa  49.3  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.519807  normal  0.499995 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>