More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0778 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_0778  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 199 aa  390  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308556  normal  0.547023 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5008  TetR family transcriptional regulator  77.89 
 
 		 201 aa  287  7e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6035  transcriptional regulator, TetR family  41.06 
 
 		 203 aa  142  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  36.68 
 
 		 199 aa  121  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 198 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  37.08 
 
 		 191 aa  105  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 203 aa  99  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 231 aa  88.2  7e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2851  TetR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 204 aa  86.7  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.313937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  34.2 
 
 		 214 aa  85.9  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1763  TetR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 287 aa  82.8  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000686866 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3771  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 223 aa  79.7  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 224 aa  79  0.00000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 192 aa  78.6  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3998  transcriptional regulator, TetR family  33.99 
 
 		 245 aa  75.5  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000456955  normal  0.178314 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  31.98 
 
 		 204 aa  75.5  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 191 aa  75.1  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0872  transcriptional regulator, TetR family  31.63 
 
 		 212 aa  74.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.83423  normal  0.281851 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5159  transcriptional regulator, TetR family  34.13 
 
 		 202 aa  73.6  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1531  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 200 aa  72.4  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 210 aa  72  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2593  putative transcriptional regulator, TetR family  34.91 
 
 		 205 aa  71.6  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0854341 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1561  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 200 aa  71.2  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.478798  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1585  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 200 aa  71.2  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 194 aa  71.2  0.000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 194 aa  71.2  0.000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5587  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 216 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5207  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 216 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5295  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 216 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 194 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1252  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 202 aa  69.3  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0581191  normal  0.11609 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1076  TetR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 206 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 200 aa  69.3  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1684  regulatory protein TetR  29.55 
 
 		 211 aa  68.6  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.172233 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  33.75 
 
 		 204 aa  68.6  0.00000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  31.66 
 
 		 234 aa  68.2  0.00000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 		 205 aa  67.8  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2758  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 231 aa  66.6  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1870  TetR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 200 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1072  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000136093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2948  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2992  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.385096  normal  0.373192 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1144  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00178929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3063  regulatory protein TetR  35.91 
 
 		 191 aa  65.1  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3494  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 210 aa  65.1  0.0000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2963  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 189 aa  64.7  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.412295 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0845  transcriptional regulator, TetR family  29.53 
 
 		 200 aa  64.3  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1697  transcriptional regulator, TetR family  31.64 
 
 		 230 aa  63.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  28.14 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  29.07 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  31.48 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0014  TetR family transcriptional regulator  50.79 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.730336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2652  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2793  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2697  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312459  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2281  transcriptional regulator, TetR family  32.65 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2682  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0327111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2959  transcriptional regulator, TetR family  35.43 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1186  transcriptional regulator, TetR family  31.48 
 
 		 206 aa  62  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1553  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.260138 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3182  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 207 aa  62  0.000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3326  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 207 aa  62  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 218 aa  61.6  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3183  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 207 aa  62  0.000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3058  TetR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 209 aa  61.6  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.765793  normal  0.0466418 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4046  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 222 aa  61.6  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933953  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5223  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 197 aa  61.6  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325156 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1121  TetR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 210 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0496337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1993  TetR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 210 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209055  normal  0.134866 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2402  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 204 aa  61.2  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2727  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 192 aa  61.2  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109313 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3324  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 225 aa  61.2  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.748824 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4446  TetR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4754  transcriptional regulator, TetR family  38.78 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00853884  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1929  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 214 aa  60.5  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  32.99 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  29.65 
 
 		 228 aa  60.1  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3078  regulatory protein, TetR  31.73 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.745436  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2454  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4851  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5792  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  30.07 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  25.79 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  46.03 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2309  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.601552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  25.79 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26800  transcriptional regulator  29.93 
 
 		 184 aa  58.9  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.463482  normal  0.288316 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3277  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1467  hypothetical protein  45.9 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.165444  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3333  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.618946 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6292  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>