218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4851 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4851  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 194 aa  384  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 234 aa  72  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 200 aa  71.6  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 383 aa  62.8  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2281  transcriptional regulator, TetR family  41.46 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  36.23 
 
 		 204 aa  61.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0778  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308556  normal  0.547023 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  35.56 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  42.47 
 
 		 199 aa  58.2  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2374  TetR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 191 aa  57.8  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2727  TetR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 192 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109313 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4272  TetR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4754  transcriptional regulator, TetR family  46.88 
 
 		 216 aa  57  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00853884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  44.29 
 
 		 214 aa  57  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5008  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2574  TetR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  36.03 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6035  transcriptional regulator, TetR family  39.73 
 
 		 203 aa  54.3  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0038  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 191 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0047  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 191 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  48.28 
 
 		 228 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1870  TetR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 191 aa  53.9  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  28.34 
 
 		 224 aa  54.3  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0873  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00991598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1561  TetR family transcriptional regulator  51.67 
 
 		 200 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.478798  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1434  transcriptional regulator, TetR family  34.26 
 
 		 185 aa  53.5  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 198 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1585  TetR family transcriptional regulator  51.67 
 
 		 200 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0028  TetR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 191 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35435 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1531  TetR family transcriptional regulator  51.67 
 
 		 200 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4496  TetR family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0468943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3363  transcriptional regulator, TetR family  29.49 
 
 		 199 aa  53.9  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 231 aa  52.8  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1929  transcriptional regulator, TetR family  39.56 
 
 		 214 aa  52.4  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2758  TetR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 231 aa  52.4  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4603  regulatory protein TetR  41.94 
 
 		 211 aa  51.6  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204139  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3333  transcriptional regulator, TetR family  45.9 
 
 		 211 aa  51.6  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.618946 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  52.94 
 
 		 224 aa  51.2  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 192 aa  51.2  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5159  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3344  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 202 aa  50.4  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.685113 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13188  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 208 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.166406 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4993  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.309228 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 191 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 		 215 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6592  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 225 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.186395 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  31.1 
 
 		 194 aa  49.3  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2186  regulatory protein, TetR  36.19 
 
 		 237 aa  49.7  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 205 aa  49.3  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3813  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 222 aa  49.7  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0327168  normal  0.449726 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28220  transcriptional regulator  36.25 
 
 		 195 aa  49.3  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1763  TetR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 287 aa  48.9  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000686866 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3202  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 209 aa  49.3  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3441  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 215 aa  48.9  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3260  TetR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 213 aa  48.9  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.122521  normal  0.297775 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11588  regulatory protein  40.58 
 
 		 202 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.8751e-36  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 217 aa  48.5  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1553  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 212 aa  48.5  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.260138 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11192  transcriptional regulator  38.89 
 
 		 201 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0509  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 191 aa  47.8  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5237  TetR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 233 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.139236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0232  TetR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 230 aa  47.4  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3021  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 210 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0326  Transcriptional regulator protein  26.09 
 
 		 217 aa  47.8  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2851  TetR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 204 aa  47.4  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.313937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1467  hypothetical protein  41.82 
 
 		 213 aa  46.6  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.165444  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0400  TetR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3558  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 190 aa  47  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.410356 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1456  transcriptional regulator, TetR family  33.59 
 
 		 211 aa  46.6  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2792  transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 		 248 aa  47  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.41359  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0872  transcriptional regulator, TetR family  41.56 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.83423  normal  0.281851 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5902  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 213 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 226 aa  46.6  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3324  transcriptional regulator, TetR family  37 
 
 		 225 aa  47  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.748824 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1712  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 231 aa  46.2  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.149018  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0153  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 193 aa  46.2  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1592  regulatory protein TetR  53.66 
 
 		 193 aa  46.2  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0893  regulatory protein TetR  40.62 
 
 		 194 aa  45.8  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4046  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 222 aa  46.2  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933953  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2743  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 188 aa  45.8  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.673676  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  28.03 
 
 		 202 aa  45.8  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0830  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 195 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4487  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 207 aa  45.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4516  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 207 aa  45.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5316  transcriptional regulator, TetR family  48.08 
 
 		 215 aa  45.8  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.505659  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0011  transcriptional regulator, putative  19.34 
 
 		 179 aa  45.4  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0409  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 214 aa  45.4  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1684  regulatory protein TetR  36.62 
 
 		 211 aa  45.4  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.172233 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2827  transcriptional regulator, TetR family  26.82 
 
 		 186 aa  45.4  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.05215  normal  0.803833 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2441  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 217 aa  45.4  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.429129  normal  0.59735 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2286  transcriptional regulator, TetR family  33.77 
 
 		 188 aa  45.1  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000280215 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4255  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 216 aa  45.1  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.323719 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6393  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 229 aa  45.1  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0255151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3058  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 209 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.765793  normal  0.0466418 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>