124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4255 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4255  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 216 aa  434  1e-121  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.323719 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 192 aa  105  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 191 aa  102  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1553  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 212 aa  85.9  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.260138 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5207  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 216 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5295  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 216 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5587  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 216 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5159  transcriptional regulator, TetR family  33.17 
 
 		 202 aa  81.3  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2652  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 200 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2697  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 200 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312459  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2682  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 200 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0327111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3818  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 212 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 		 205 aa  77.8  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3363  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 199 aa  77.4  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5223  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 197 aa  75.1  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325156 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 209 aa  71.6  0.000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 217 aa  69.7  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0845  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 200 aa  67.8  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3063  regulatory protein TetR  31.15 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2232  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.731324  hitchhiker  0.00520971 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  24.16 
 
 		 200 aa  64.7  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 383 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3506  TetR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 195 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  0.0873465 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  26.55 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  24.19 
 
 		 204 aa  61.6  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2959  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6035  transcriptional regulator, TetR family  27.32 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3287  TetR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.443656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  25.15 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2727  TetR family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 192 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109313 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  25.64 
 
 		 199 aa  57  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  25.84 
 
 		 208 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0778  TetR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308556  normal  0.547023 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5770  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.805337 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4272  TetR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5008  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 201 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 237 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  22.16 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  26.47 
 
 		 194 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1535  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 192 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0028  TetR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 191 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35435 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 203 aa  52.4  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0038  TetR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 191 aa  52  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0047  TetR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 191 aa  52  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4339  TetR family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 207 aa  51.6  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00746452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 238 aa  50.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2948  TetR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 191 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2992  TetR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 191 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.385096  normal  0.373192 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2963  TetR family transcriptional regulator  23.78 
 
 		 189 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.412295 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  23.16 
 
 		 193 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0011  transcriptional regulator, putative  19.66 
 
 		 179 aa  50.4  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6347  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28220  transcriptional regulator  27.17 
 
 		 195 aa  50.8  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1763  TetR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 287 aa  50.1  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000686866 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6626  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 210 aa  50.1  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1252  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 202 aa  49.7  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0581191  normal  0.11609 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2402  transcriptional regulator, TetR family  25.68 
 
 		 204 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2792  transcriptional regulator, TetR family  32.71 
 
 		 248 aa  48.9  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.41359  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  25.89 
 
 		 212 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  26.04 
 
 		 224 aa  48.9  0.00006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  34.33 
 
 		 224 aa  48.5  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 212 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  35.8 
 
 		 214 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0830  TetR family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3225  TetR family transcriptional regulator  24.12 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.314279  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  26.09 
 
 		 204 aa  47  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3530  regulatory protein TetR  29.29 
 
 		 235 aa  47  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.898869  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1515  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 213 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2347  transcriptional regulator, TetR family  27.57 
 
 		 223 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.123383  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2131  regulatory protein, TetR  26.34 
 
 		 218 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00771887  normal  0.859247 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4469  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 202 aa  46.6  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4208  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 213 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.826614 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2493  transcriptional regulator, TetR family  29.52 
 
 		 221 aa  46.2  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.464185 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0326  Transcriptional regulator protein  26.74 
 
 		 217 aa  46.2  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2750  transcriptional regulator, TetR family  29.52 
 
 		 216 aa  46.6  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.622504 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 211 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2374  TetR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 191 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  32.1 
 
 		 234 aa  46.2  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1119  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 213 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3260  TetR family transcriptional regulator  23.66 
 
 		 213 aa  45.8  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.122521  normal  0.297775 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4433  putative transcriptional regulator, TetR family  38.6 
 
 		 199 aa  45.8  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304497  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21800  transcriptional regulator  37.31 
 
 		 265 aa  45.8  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.391718  normal  0.223847 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4457  TetR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 209 aa  45.4  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108103 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4851  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 194 aa  45.1  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4740  transcriptional regulator, TetR family  27.36 
 
 		 196 aa  45.1  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.609223  normal  0.406356 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0278  transcriptional regulator, TetR family  24.1 
 
 		 206 aa  45.1  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.72994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4754  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 216 aa  45.1  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00853884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1050  transcriptional regulator  32.69 
 
 		 185 aa  44.3  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1121  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 210 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0496337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2385  transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 176 aa  44.7  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000106592  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4446  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 210 aa  43.9  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2120  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 187 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.613447  normal  0.0993721 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4993  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 202 aa  43.5  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.309228 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4103  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 209 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05370  transcriptional regulator, TetR family  20.88 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2789  transcriptional regulator  28.03 
 
 		 206 aa  43.5  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3998  transcriptional regulator, TetR family  26.81 
 
 		 245 aa  43.9  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000456955  normal  0.178314 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0893  regulatory protein TetR  23.86 
 
 		 194 aa  43.5  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>