More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2374 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_2374  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 191 aa  377  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4272  TetR family transcriptional regulator  74.87 
 
 		 191 aa  288  3e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0028  TetR family transcriptional regulator  63.19 
 
 		 191 aa  222  3e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35435 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0038  TetR family transcriptional regulator  62.64 
 
 		 191 aa  219  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0047  TetR family transcriptional regulator  62.64 
 
 		 191 aa  219  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4339  TetR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 207 aa  106  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00746452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4433  putative transcriptional regulator, TetR family  39.72 
 
 		 199 aa  95.5  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304497  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  33.67 
 
 		 204 aa  88.2  7e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  34.39 
 
 		 199 aa  87.8  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 194 aa  83.6  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  35.8 
 
 		 205 aa  82.8  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  68.33 
 
 		 237 aa  81.6  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5159  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 202 aa  78.6  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3001  transcriptional regulator, TetR family  41.43 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.145736  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 191 aa  74.7  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4135  TetR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 194 aa  72.8  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3363  transcriptional regulator, TetR family  35.25 
 
 		 199 aa  72.8  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 209 aa  72.4  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  60 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 192 aa  71.2  0.000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  47.56 
 
 		 217 aa  70.9  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3225  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 213 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.314279  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  34.31 
 
 		 192 aa  68.2  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3008  putative transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 203 aa  67.8  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4006  transcriptional regulator, TetR family  33.67 
 
 		 193 aa  65.9  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.685052  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3818  transcriptional regulator, TetR family  51.61 
 
 		 212 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104466  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4818  transcriptional regulator, TetR family  51.43 
 
 		 208 aa  65.5  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.945526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  54.1 
 
 		 194 aa  64.7  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1553  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.260138 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2120  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.613447  normal  0.0993721 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2454  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4469  transcriptional regulator, TetR family  34.02 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5615  TetR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 200 aa  62  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000827938  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5979  TetR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 200 aa  62  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000443748  hitchhiker  0.000881636 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2012  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 206 aa  61.6  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.719864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5818  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.199964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  40.82 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2593  putative transcriptional regulator, TetR family  29.85 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0854341 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  59.18 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2221  transcriptional regulator, TetR family  49.25 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4457  TetR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108103 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2792  transcriptional regulator, TetR family  30.53 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.41359  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  55.1 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0521  regulatory protein TetR  39.01 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.368507  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  35.34 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2232  transcriptional regulator, TetR family  32.8 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.731324  hitchhiker  0.00520971 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  32.81 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  35.51 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  32.59 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2652  TetR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2697  TetR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312459  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2682  TetR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0327111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4851  TetR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 194 aa  57.8  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 231 aa  57.8  0.00000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0845  transcriptional regulator, TetR family  33.88 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  51.67 
 
 		 214 aa  57  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0251  transcriptional regulator, TetR family  30.82 
 
 		 185 aa  57.4  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.514546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1889  TetR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3287  TetR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 195 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.443656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12090  transcriptional regulator, tetR family  33.11 
 
 		 182 aa  56.6  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4993  transcriptional regulator, TetR family  40.4 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.309228 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2385  transcriptional regulator, TetR family  29.25 
 
 		 176 aa  57  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000106592  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 257 aa  55.8  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1556  putative transcriptional regulator, TetR family  41.3 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4786  regulatory protein TetR  37.04 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3036  TetR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3757  transcriptional regulator, TetR family  43.68 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0306386  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 383 aa  55.1  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4502  putative transcriptional regulator, TetR family  43.21 
 
 		 249 aa  55.1  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5065  TetR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174952  normal  0.51505 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3063  regulatory protein TetR  38.58 
 
 		 191 aa  54.7  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5887  TetR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 187 aa  54.3  0.0000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.350094 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6626  TetR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0223  putative transcriptional regulator, TetR family  34.91 
 
 		 185 aa  53.9  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5902  TetR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 213 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0602  transcriptional regulator, TetR family  33.63 
 
 		 209 aa  53.9  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 194 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3998  transcriptional regulator, TetR family  47.37 
 
 		 245 aa  53.5  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000456955  normal  0.178314 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1697  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 230 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 194 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 194 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5223  TetR family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 197 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325156 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 193 aa  52.8  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2574  TetR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 213 aa  52.8  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1809  TetR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 211 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.300582  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1856  TetR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 211 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.337362 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6035  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 203 aa  52.8  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1790  TetR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 211 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.305772  normal  1 
 
 
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NC_013530  Xcel_3195  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 200 aa  52.8  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007777  Francci3_2283  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 173 aa  52.4  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000000171234  hitchhiker  0.000491617 
 
 
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NC_010087  Bmul_6158  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 212 aa  52.4  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.488727  normal  0.104212 
 
 
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NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 193 aa  52.4  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199059 
 
 
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NC_013131  Caci_7144  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 188 aa  52.4  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.251131 
 
 
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NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 226 aa  52  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
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NC_011071  Smal_3394  transcriptional regulator, TetR family  45.33 
 
 		 220 aa  52  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.222962 
 
 
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NC_008146  Mmcs_4074  TetR family transcriptional regulator  38 
 
 		 214 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011145  AnaeK_2959  transcriptional regulator, TetR family  34.4 
 
 		 200 aa  52  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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