107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1889 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_1889  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
195 aa  388  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0251  transcriptional regulator, TetR family  52.27 
 
 
185 aa  181  7e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.514546  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0223  putative transcriptional regulator, TetR family  53.14 
 
 
185 aa  178  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4457  TetR family transcriptional regulator  53.75 
 
 
209 aa  176  2e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.108103 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2120  TetR family transcriptional regulator  55.97 
 
 
187 aa  170  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.613447  normal  0.0993721 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3160  transcriptional regulator, putative  50 
 
 
181 aa  168  5e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0108534  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5887  TetR family transcriptional regulator  48.65 
 
 
187 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.350094 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3026  transcriptional regulator, putative  48.73 
 
 
181 aa  156  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.127274  normal  0.152535 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3173  TetR family transcriptional regulator  54.55 
 
 
213 aa  156  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2283  TetR family transcriptional regulator  52.55 
 
 
173 aa  154  8e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000000171234  hitchhiker  0.000491617 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4786  regulatory protein TetR  48.24 
 
 
189 aa  152  4e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1661  TetR family transcriptional regulator  48.77 
 
 
180 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0333899  normal  0.0197057 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4135  TetR family transcriptional regulator  37.97 
 
 
194 aa  121  8e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0691  regulatory protein TetR  35.75 
 
 
202 aa  113  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1006  transcriptional regulator, TetR family  36.78 
 
 
190 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.217455  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4434  transcriptional regulator  40.23 
 
 
203 aa  99.8  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.147694  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6626  TetR family transcriptional regulator  37.13 
 
 
210 aa  89  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7144  transcriptional regulator, TetR family  35.37 
 
 
188 aa  85.5  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3008  putative transcriptional regulator, TetR family  34.08 
 
 
203 aa  74.7  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5818  TetR family transcriptional regulator  49.43 
 
 
216 aa  73.9  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.199964  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  31.49 
 
 
205 aa  71.6  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2792  transcriptional regulator, TetR family  32.57 
 
 
248 aa  69.3  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.41359  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  31.38 
 
 
191 aa  65.9  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0602  transcriptional regulator, TetR family  32.37 
 
 
209 aa  63.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  31.72 
 
 
198 aa  62.8  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7526  putative transcriptional regulator, TetR family  33.53 
 
 
204 aa  63.2  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5615  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 
200 aa  62  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000827938  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5979  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 
200 aa  62  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000443748  hitchhiker  0.000881636 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  32.16 
 
 
199 aa  62  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3036  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
196 aa  61.6  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1533  regulatory protein TetR  32.14 
 
 
203 aa  60.5  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.987298  normal  0.249923 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 
203 aa  60.5  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2221  transcriptional regulator, TetR family  30.67 
 
 
206 aa  60.1  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1237  transcriptional regulator, TetR family  34.03 
 
 
219 aa  58.9  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.689055  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  32.86 
 
 
193 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4339  TetR family transcriptional regulator  28.81 
 
 
207 aa  58.9  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00746452  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2012  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 
206 aa  58.9  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.719864  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4074  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 
214 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4150  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 
214 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4304  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 
214 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.127399  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2374  TetR family transcriptional regulator  30.18 
 
 
191 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 
194 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 
194 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4006  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 
193 aa  55.5  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.685052  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0278  transcriptional regulator, TetR family  36.69 
 
 
206 aa  55.1  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.72994  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1252  TetR family transcriptional regulator  33.03 
 
 
202 aa  55.5  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0581191  normal  0.11609 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11588  regulatory protein  29.63 
 
 
202 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.8751e-36  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4469  transcriptional regulator, TetR family  26.88 
 
 
202 aa  54.3  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4158  TetR family transcriptional regulator  38.32 
 
 
205 aa  53.9  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000188504  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4272  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 
191 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  35.87 
 
 
230 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0038  TetR family transcriptional regulator  27.61 
 
 
191 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0047  TetR family transcriptional regulator  27.61 
 
 
191 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0028  TetR family transcriptional regulator  27.61 
 
 
191 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.35435 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  28.88 
 
 
208 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4502  putative transcriptional regulator, TetR family  33.74 
 
 
249 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 
194 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2574  TetR family transcriptional regulator  31.98 
 
 
213 aa  52.4  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7464  TetR family transcriptional regulator  37.8 
 
 
200 aa  52  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0288781  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2593  putative transcriptional regulator, TetR family  33.65 
 
 
205 aa  52  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0854341 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2652  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 
200 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2697  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 
200 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312459  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2682  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 
200 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0327111  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05420  transcriptional regulator, tetR family  32.54 
 
 
188 aa  51.6  0.000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 
224 aa  51.2  0.000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1929  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 
214 aa  49.7  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4685  transcriptional regulator, TetR family  37.36 
 
 
205 aa  50.1  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.421028  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0893  regulatory protein TetR  27.62 
 
 
194 aa  50.4  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 
199 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  27.46 
 
 
214 aa  49.7  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20410  transcriptional regulator, tetR family  28.48 
 
 
222 aa  49.3  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.539092  normal  0.887832 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 
234 aa  48.5  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4993  transcriptional regulator, TetR family  29.6 
 
 
202 aa  48.5  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.309228 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  31.3 
 
 
231 aa  48.1  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1870  TetR family transcriptional regulator  31.3 
 
 
200 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524009  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2727  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
192 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.109313 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13188  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 
208 aa  47  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.166406 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0867  transcriptional regulator, TetR family  31.48 
 
 
202 aa  46.6  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4620  transcriptional regulator, TetR family  44.12 
 
 
194 aa  46.6  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 
228 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  30.57 
 
 
194 aa  47  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0011  transcriptional regulator, putative  20.12 
 
 
179 aa  46.2  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3528  transcriptional regulator, TetR family  31.88 
 
 
192 aa  46.2  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.069513  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3225  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 
213 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.314279  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  26.82 
 
 
200 aa  45.8  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3021  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 
210 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
224 aa  45.4  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3395  TetR family transcriptional regulator  21.48 
 
 
193 aa  45.1  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.584176  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4496  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 
202 aa  44.3  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0468943  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1687  regulatory protein, TetR  31.91 
 
 
266 aa  43.9  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4754  transcriptional regulator, TetR family  32.72 
 
 
216 aa  43.9  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00853884  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1434  transcriptional regulator, TetR family  36.62 
 
 
185 aa  44.7  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  27.4 
 
 
201 aa  43.9  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0845  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 
200 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  28.1 
 
 
204 aa  43.9  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2430  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 
189 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2475  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 
189 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  29.75 
 
 
194 aa  42.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 
192 aa  42.4  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0284  regulatory protein TetR  32.17 
 
 
215 aa  41.6  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>