More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3148 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



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PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
231 aa  461  1e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1763  TetR family transcriptional regulator  67.91 
 
 
287 aa  269  2e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000686866 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  45.99 
 
 
203 aa  145  6e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4993  transcriptional regulator, TetR family  42.49 
 
 
202 aa  135  8e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.309228 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1697  transcriptional regulator, TetR family  40.64 
 
 
230 aa  121  7e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2593  putative transcriptional regulator, TetR family  37.88 
 
 
205 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0854341 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3998  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 
245 aa  118  9e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000456955  normal  0.178314 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1252  TetR family transcriptional regulator  37.82 
 
 
202 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0581191  normal  0.11609 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  31.38 
 
 
191 aa  106  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0778  TetR family transcriptional regulator  40.59 
 
 
199 aa  104  9e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308556  normal  0.547023 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  32.72 
 
 
191 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  35.79 
 
 
199 aa  104  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  40.36 
 
 
194 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  35.87 
 
 
383 aa  103  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5159  transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 
202 aa  103  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 
192 aa  103  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  40.36 
 
 
194 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  40.36 
 
 
194 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  34.76 
 
 
200 aa  103  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1684  regulatory protein TetR  35.14 
 
 
211 aa  102  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.172233 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  32.1 
 
 
199 aa  102  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5008  TetR family transcriptional regulator  37.95 
 
 
201 aa  100  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  29.08 
 
 
198 aa  98.2  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  33.17 
 
 
202 aa  97.4  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1237  transcriptional regulator, TetR family  36.94 
 
 
219 aa  93.6  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.689055  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2652  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 
200 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2697  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 
200 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312459  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2682  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 
200 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0327111  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1687  regulatory protein, TetR  33.33 
 
 
266 aa  92.8  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  33.33 
 
 
204 aa  91.7  8e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
234 aa  90.9  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  33.97 
 
 
224 aa  90.1  2e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6035  transcriptional regulator, TetR family  34.13 
 
 
203 aa  89.7  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  37.13 
 
 
205 aa  89.4  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 
228 aa  88.6  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1929  transcriptional regulator, TetR family  33.89 
 
 
214 aa  87.8  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0893  regulatory protein TetR  38.42 
 
 
194 aa  87.4  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2727  TetR family transcriptional regulator  34.97 
 
 
192 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.109313 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 
214 aa  87.4  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 
237 aa  86.7  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  37.89 
 
 
224 aa  86.7  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3818  transcriptional regulator, TetR family  33.53 
 
 
212 aa  85.1  8e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104466  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2454  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
185 aa  84.7  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 
193 aa  84.7  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20410  transcriptional regulator, tetR family  29.27 
 
 
222 aa  83.6  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.539092  normal  0.887832 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 
204 aa  84.3  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6347  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
200 aa  82.8  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4754  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 
216 aa  82.8  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00853884  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  30.58 
 
 
210 aa  82.4  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3714  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 
178 aa  82.8  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.530873  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2948  TetR family transcriptional regulator  35.6 
 
 
191 aa  82.4  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2992  TetR family transcriptional regulator  35.6 
 
 
191 aa  82.4  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.385096  normal  0.373192 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  29.52 
 
 
201 aa  82  0.000000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  32.61 
 
 
224 aa  81.3  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0867  transcriptional regulator, TetR family  35.8 
 
 
202 aa  81.3  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1387  transcriptional regulator, TetR family  38.36 
 
 
213 aa  81.3  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  33.93 
 
 
194 aa  80.9  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3333  transcriptional regulator, TetR family  34.57 
 
 
211 aa  80.9  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.618946 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  34.36 
 
 
194 aa  80.5  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3771  transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 
223 aa  79.7  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  31.32 
 
 
193 aa  80.1  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2963  TetR family transcriptional regulator  35.08 
 
 
189 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.412295 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  35.8 
 
 
199 aa  79.3  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2758  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 
231 aa  79  0.00000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3225  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 
213 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.314279  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3260  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 
213 aa  77  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.122521  normal  0.297775 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3506  TetR family transcriptional regulator  32.07 
 
 
195 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  0.0873465 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0014  TetR family transcriptional regulator  33.95 
 
 
234 aa  76.6  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.730336  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0091  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
187 aa  76.3  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0611138  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4620  transcriptional regulator, TetR family  35.15 
 
 
194 aa  76.6  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  31.1 
 
 
205 aa  75.9  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2574  TetR family transcriptional regulator  35.2 
 
 
213 aa  76.3  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4818  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 
208 aa  76.3  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.945526  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5223  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 
197 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.325156 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1467  hypothetical protein  31.21 
 
 
213 aa  75.1  0.0000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.165444  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  34.09 
 
 
188 aa  75.1  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1474  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
188 aa  75.1  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2700  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
200 aa  75.1  0.0000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05420  transcriptional regulator, tetR family  34.83 
 
 
188 aa  74.7  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2792  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
248 aa  74.7  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.41359  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2670  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
214 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.545748  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3441  TetR family transcriptional regulator  29.28 
 
 
215 aa  74.3  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4158  TetR family transcriptional regulator  35.34 
 
 
205 aa  74.7  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000188504  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2715  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
214 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.180608  normal  0.0320009 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7526  putative transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 
204 aa  74.7  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  34.24 
 
 
230 aa  73.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0278  transcriptional regulator, TetR family  32.48 
 
 
206 aa  73.2  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.72994  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2232  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 
201 aa  72.8  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.731324  hitchhiker  0.00520971 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0872  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 
212 aa  72  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.83423  normal  0.281851 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  32.78 
 
 
192 aa  71.6  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0602  transcriptional regulator, TetR family  32.91 
 
 
209 aa  70.5  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4433  putative transcriptional regulator, TetR family  31.77 
 
 
199 aa  70.5  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304497  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2221  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 
206 aa  70.9  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5207  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
216 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5587  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
216 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4685  transcriptional regulator, TetR family  35.98 
 
 
205 aa  70.5  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.421028  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5295  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
216 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334601  normal 
 
 
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NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 
231 aa  70.5  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 
209 aa  70.1  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0845142 
 
 
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NC_013441  Gbro_4603  regulatory protein TetR  32.7 
 
 
211 aa  69.7  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204139  n/a   
 
 
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